More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1471 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1471  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 		 200 aa  418  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3511  glutathione S-transferase-like protein  63.92 
 
 		 198 aa  263  1e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3211  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.86 
 
 		 198 aa  255  3e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43110  putative glutathione S-transferase  56.57 
 
 		 200 aa  249  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000318488  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2495  putative glutathione S-transferase  56.57 
 
 		 204 aa  247  8e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00712937  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1842  glutathione S-transferase  57.07 
 
 		 200 aa  246  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260742  normal  0.324274 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3617  putative glutathione S-transferase  56.57 
 
 		 200 aa  246  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0196  glutathione S-transferase-like  57.14 
 
 		 204 aa  245  3e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2032  glutathione S-transferase family protein  56.06 
 
 		 200 aa  243  9e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1821  glutathione S-transferase family protein  57.67 
 
 		 200 aa  242  3e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0623474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04080  probable glutathione S-transferase  57.14 
 
 		 199 aa  242  3e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1399  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.14 
 
 		 200 aa  241  6e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1429  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.61 
 
 		 200 aa  240  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114439  normal  0.299107 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003296  glutathione transferase  56.35 
 
 		 198 aa  240  1e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3890  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.61 
 
 		 200 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.19285 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3827  putative glutathione S-transferase  56.28 
 
 		 208 aa  237  6.999999999999999e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2139  glutathione S-transferase  51.01 
 
 		 203 aa  226  2e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.041384 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2587  Glutathione S-transferase domain  55.9 
 
 		 195 aa  224  6e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.751074  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2312  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.38 
 
 		 195 aa  224  6e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0196665 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2269  Glutathione S-transferase domain  53.85 
 
 		 195 aa  221  6e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0503  Glutathione S-transferase domain protein  51.52 
 
 		 208 aa  219  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0544052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2670  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.01 
 
 		 200 aa  216  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.237361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04799  glutathione S-transferase  49.75 
 
 		 209 aa  207  1e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3587  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.01 
 
 		 203 aa  200  9e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0707812  hitchhiker  0.000377551 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0017  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.98 
 
 		 192 aa  199  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2641  Glutathione S-transferase domain  48.24 
 
 		 218 aa  198  5e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.213293 
 
 
-
 
NC_004310  BR1493  glutathione S-transferase family protein  47.5 
 
 		 203 aa  197  1.0000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.695225  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1447  glutathione S-transferase family protein  47.5 
 
 		 203 aa  197  1.0000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277938  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4794  Glutathione S-transferase domain  49.21 
 
 		 197 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.915466  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1985  glutathione S-transferase  46.6 
 
 		 207 aa  194  7e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2296  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.69 
 
 		 204 aa  190  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.879102 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1311  glutathione S-transferase-like protein  46.88 
 
 		 196 aa  188  5e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.55458  normal  0.181696 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3893  glutathione S-transferase-like protein  46.52 
 
 		 210 aa  186  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3910  glutathione S-transferase-like  49.45 
 
 		 201 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1387  Glutathione S-transferase domain protein  45.45 
 
 		 201 aa  182  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1421  glutathione S-transferase domain protein  45.99 
 
 		 201 aa  182  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1820  putative glutathione S-transferase  46.32 
 
 		 196 aa  181  5.0000000000000004e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2981  glutathione S-transferase  45.32 
 
 		 216 aa  171  5e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.897939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3927  glutathione S-transferase-like  45.32 
 
 		 228 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1171  Glutathione S-transferase domain protein  45.83 
 
 		 204 aa  168  5e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245566  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4810  Glutathione S-transferase domain  44.33 
 
 		 217 aa  167  7e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1101  glutathione S-transferase-like  44.83 
 
 		 256 aa  167  9e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2738  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.5 
 
 		 216 aa  167  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1296  glutathione S-transferase-like protein  44.83 
 
 		 228 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.041604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3756  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.65 
 
 		 208 aa  166  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1799  putative glutathione S-transferase (GST)  42.08 
 
 		 216 aa  164  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.602523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4124  glutathione S-transferase-like  43.56 
 
 		 217 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.590461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0412  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.84 
 
 		 203 aa  161  5.0000000000000005e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0134  Glutathione S-transferase domain protein  43.16 
 
 		 209 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3618  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.61 
 
 		 201 aa  136  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.822578  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5413  Glutathione S-transferase domain protein  34.18 
 
 		 207 aa  134  7.000000000000001e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2547  glutathione S-transferase-like  35.29 
 
 		 203 aa  128  5.0000000000000004e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.277247  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4962  Glutathione S-transferase domain protein  37.13 
 
 		 219 aa  115  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3573  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.82 
 
 		 214 aa  115  6e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.242235  normal  0.0117224 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5040  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.29 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.367084 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5417  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 		 214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556283  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0661  Glutathione S-transferase domain protein  34.17 
 
 		 203 aa  112  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1180  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.82 
 
 		 207 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.610567  normal  0.0747789 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4686  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.67 
 
 		 205 aa  111  6e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3323  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.64 
 
 		 227 aa  110  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0187385  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4489  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.34 
 
 		 208 aa  108  5e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4693  glutathione S-transferase-like  32.35 
 
 		 214 aa  108  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3670  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.35 
 
 		 214 aa  108  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2439  glutathione S-transferase-like protein  32.18 
 
 		 214 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.414826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3851  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 		 214 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.216591  normal  0.461755 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6230  putative glutathione S-transferase  35.53 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0344917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2762  glutathione S-transferase-like  32.49 
 
 		 206 aa  106  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4952  Glutathione S-transferase domain  29.85 
 
 		 208 aa  105  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.246161 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5005  Glutathione S-transferase domain  29.35 
 
 		 208 aa  105  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.286975  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0910  Glutathione S-transferase domain  30.65 
 
 		 203 aa  105  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1347  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.66 
 
 		 205 aa  105  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3325  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.66 
 
 		 205 aa  104  8e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3947  Glutathione S-transferase domain protein  32.84 
 
 		 207 aa  104  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1071  glutathione S-transferase  33.83 
 
 		 214 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.292672  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2817  glutathione S-transferase  33.83 
 
 		 300 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1904  Glutathione S-transferase domain protein  31.84 
 
 		 199 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2670  putative glutathione S-transferase  33.83 
 
 		 297 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1057  Glutathione S-transferase domain protein  30.15 
 
 		 203 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0628244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0125  glutathione S-transferase  33.33 
 
 		 266 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0407  glutathione S-transferase  33.67 
 
 		 217 aa  102  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24830  putative glutathione S-transferase  34.36 
 
 		 198 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4250  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.68 
 
 		 209 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0107  glutathione S-transferase  33.33 
 
 		 214 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1267  glutathione S-transferase  33.33 
 
 		 214 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261228  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3224  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.68 
 
 		 208 aa  102  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.395203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8513  Glutathione S-transferase domain protein  31.82 
 
 		 205 aa  102  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700179  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3092  glutathione S-transferase domain-containing protein  33 
 
 		 205 aa  101  6e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.061874 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5079  Glutathione S-transferase domain  32.85 
 
 		 213 aa  100  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.242731  hitchhiker  0.00740675 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4125  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.16 
 
 		 203 aa  100  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0925  putative glutathione S-transferase  31.79 
 
 		 203 aa  100  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.324873  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1162  glutathione S-transferase family protein  31.19 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1196  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.19 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2245  glutathione S-transferase-like  29.27 
 
 		 220 aa  99  4e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.556118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0645  glutathione S-transferase-like  33 
 
 		 225 aa  98.6  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.722095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49100  glutathione S-transferase  32.68 
 
 		 209 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000404937 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0797  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.53 
 
 		 205 aa  97.1  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3433  glutathione S-transferase family protein  28.86 
 
 		 214 aa  95.5  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000284771 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1873  Glutathione S-transferase domain protein  34.69 
 
 		 200 aa  95.5  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4194  glutathione S-transferase  30.77 
 
 		 209 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2973  glutathione S-transferase-like  29.95 
 
 		 206 aa  94  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00286843  normal  0.226682 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>