More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3927 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007958  RPD_3927  glutathione S-transferase-like  100 
 
 
228 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1296  glutathione S-transferase-like protein  95.61 
 
 
228 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.041604  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4810  Glutathione S-transferase domain  91.71 
 
 
217 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4124  glutathione S-transferase-like  83.87 
 
 
217 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.590461  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2981  glutathione S-transferase  82.24 
 
 
216 aa  379  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.897939  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1101  glutathione S-transferase-like  83.33 
 
 
256 aa  378  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1799  putative glutathione S-transferase (GST)  85.07 
 
 
216 aa  370  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.602523  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2738  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.54 
 
 
216 aa  243  1.9999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3893  glutathione S-transferase-like protein  53.57 
 
 
210 aa  222  3e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1387  Glutathione S-transferase domain protein  49 
 
 
201 aa  216  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2296  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.74 
 
 
204 aa  214  7e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.879102 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1421  glutathione S-transferase domain protein  48 
 
 
201 aa  211  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3617  putative glutathione S-transferase  48.24 
 
 
200 aa  190  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43110  putative glutathione S-transferase  47.24 
 
 
200 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000318488  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1821  glutathione S-transferase family protein  47.74 
 
 
200 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0623474  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1399  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.24 
 
 
200 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250488  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2670  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.23 
 
 
200 aa  176  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.237361  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3890  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.73 
 
 
200 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.19285 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2495  putative glutathione S-transferase  45.45 
 
 
204 aa  175  4e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00712937  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3511  glutathione S-transferase-like protein  45.5 
 
 
198 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3211  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.7 
 
 
198 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1429  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.23 
 
 
200 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114439  normal  0.299107 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2139  glutathione S-transferase  44.06 
 
 
203 aa  172  3.9999999999999995e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.041384 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0503  Glutathione S-transferase domain protein  44.71 
 
 
208 aa  171  9e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0544052  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04799  glutathione S-transferase  46.19 
 
 
209 aa  169  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2032  glutathione S-transferase family protein  44.28 
 
 
200 aa  166  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1842  glutathione S-transferase  44.78 
 
 
200 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260742  normal  0.324274 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0196  glutathione S-transferase-like  45.37 
 
 
204 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1447  glutathione S-transferase family protein  44.28 
 
 
203 aa  164  8e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277938  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1493  glutathione S-transferase family protein  44.28 
 
 
203 aa  164  8e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.695225  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04080  probable glutathione S-transferase  40.1 
 
 
199 aa  160  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1471  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.32 
 
 
200 aa  159  4e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3827  putative glutathione S-transferase  43.56 
 
 
208 aa  156  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2641  Glutathione S-transferase domain  43.22 
 
 
218 aa  152  5e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.213293 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1985  glutathione S-transferase  42.56 
 
 
207 aa  151  8.999999999999999e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0412  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.2 
 
 
203 aa  146  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003296  glutathione transferase  38.19 
 
 
198 aa  145  5e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0134  Glutathione S-transferase domain protein  41.33 
 
 
209 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4794  Glutathione S-transferase domain  40.51 
 
 
197 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.915466  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2312  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.82 
 
 
195 aa  142  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0196665 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2587  Glutathione S-transferase domain  40.82 
 
 
195 aa  142  5e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.751074  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0017  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.97 
 
 
192 aa  141  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268724  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1171  Glutathione S-transferase domain protein  41.8 
 
 
204 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245566  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3587  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.91 
 
 
203 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0707812  hitchhiker  0.000377551 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2269  Glutathione S-transferase domain  40.7 
 
 
195 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.333911  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3910  glutathione S-transferase-like  38.19 
 
 
201 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3618  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.97 
 
 
201 aa  132  3.9999999999999996e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.822578  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2547  glutathione S-transferase-like  37.24 
 
 
203 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.277247  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1311  glutathione S-transferase-like protein  36.55 
 
 
196 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.55458  normal  0.181696 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3756  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.11 
 
 
208 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1820  putative glutathione S-transferase  38.62 
 
 
196 aa  125  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4686  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.5 
 
 
205 aa  119  6e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1347  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.7 
 
 
205 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5005  Glutathione S-transferase domain  35.47 
 
 
208 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.286975  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3325  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.39 
 
 
205 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1180  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.98 
 
 
207 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.610567  normal  0.0747789 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5413  Glutathione S-transferase domain protein  35.18 
 
 
207 aa  115  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8513  Glutathione S-transferase domain protein  36.55 
 
 
205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700179  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4962  Glutathione S-transferase domain protein  36.19 
 
 
219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4489  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.5 
 
 
208 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4952  Glutathione S-transferase domain  34 
 
 
208 aa  113  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.246161 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0925  putative glutathione S-transferase  36.36 
 
 
203 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.324873  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1057  Glutathione S-transferase domain protein  35.35 
 
 
203 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0628244  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2762  glutathione S-transferase-like  35.35 
 
 
206 aa  108  5e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3224  glutathione S-transferase domain-containing protein  35 
 
 
208 aa  108  6e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.395203  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3851  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.65 
 
 
214 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.216591  normal  0.461755 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5040  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.27 
 
 
221 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.367084 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4693  glutathione S-transferase-like  33.65 
 
 
214 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3670  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.65 
 
 
214 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630105  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3573  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.6 
 
 
214 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.242235  normal  0.0117224 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1708  Glutathione S-transferase domain  37.5 
 
 
199 aa  107  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5417  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.6 
 
 
214 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556283  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1106  Glutathione S-transferase domain  33.99 
 
 
203 aa  106  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2439  glutathione S-transferase-like protein  33.17 
 
 
214 aa  105  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.414826  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4250  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.83 
 
 
209 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0910  Glutathione S-transferase domain  34.85 
 
 
203 aa  105  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1904  Glutathione S-transferase domain protein  35.15 
 
 
199 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142458  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0661  Glutathione S-transferase domain protein  35.86 
 
 
203 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5690  glutathione S-transferase-like protein  33.17 
 
 
227 aa  103  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.529075 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2973  glutathione S-transferase-like  32.32 
 
 
206 aa  103  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00286843  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4194  glutathione S-transferase  35.9 
 
 
209 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2207  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.99 
 
 
209 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49100  glutathione S-transferase  35.9 
 
 
209 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000404937 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2104  putative glutathione S-transferase  33.83 
 
 
198 aa  102  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3742  glutathione S-transferase family protein  31.98 
 
 
208 aa  101  9e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.495095  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5568  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.86 
 
 
205 aa  101  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446565  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3433  glutathione S-transferase family protein  32.18 
 
 
214 aa  101  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000284771 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3323  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.82 
 
 
227 aa  101  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0187385  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1162  glutathione S-transferase family protein  32.84 
 
 
209 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4051  putative glutathione S-transferase  33.17 
 
 
223 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.838028 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5079  Glutathione S-transferase domain  33.5 
 
 
213 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.242731  hitchhiker  0.00740675 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1196  glutathione S-transferase domain-containing protein  32 
 
 
209 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2021  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.47 
 
 
208 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.203063  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0645  glutathione S-transferase-like  33.49 
 
 
225 aa  99.4  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.722095  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24830  putative glutathione S-transferase  33.33 
 
 
198 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0974  Glutathione S-transferase domain protein  32.14 
 
 
209 aa  99  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0209  glutathione S-transferase-like  29.03 
 
 
233 aa  98.2  9e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3947  Glutathione S-transferase domain protein  30.69 
 
 
207 aa  98.2  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1087  glutathione S-transferase family protein  31.82 
 
 
222 aa  97.8  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.983271 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4125  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.32 
 
 
203 aa  97.4  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>