More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4794 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4794  Glutathione S-transferase domain  100 
 
 		 197 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.915466  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3910  glutathione S-transferase-like  75.52 
 
 		 201 aa  304  6e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1311  glutathione S-transferase-like protein  74.74 
 
 		 196 aa  303  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.55458  normal  0.181696 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1820  putative glutathione S-transferase  68.23 
 
 		 196 aa  277  6e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1171  Glutathione S-transferase domain protein  63.21 
 
 		 204 aa  257  9e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245566  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0017  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.46 
 
 		 192 aa  249  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2587  Glutathione S-transferase domain  61.98 
 
 		 195 aa  245  2e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.751074  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2312  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.46 
 
 		 195 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0196665 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2269  Glutathione S-transferase domain  61.46 
 
 		 195 aa  241  6e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1985  glutathione S-transferase  57.29 
 
 		 207 aa  238  5.999999999999999e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3587  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.35 
 
 		 203 aa  230  9e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0707812  hitchhiker  0.000377551 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1821  glutathione S-transferase family protein  52.38 
 
 		 200 aa  207  6e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0623474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1399  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.32 
 
 		 200 aa  204  5e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3890  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.32 
 
 		 200 aa  204  7e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.19285 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0196  glutathione S-transferase-like  51.05 
 
 		 204 aa  204  8e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3211  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.58 
 
 		 198 aa  201  8e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3827  putative glutathione S-transferase  49.25 
 
 		 208 aa  198  3.9999999999999996e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43110  putative glutathione S-transferase  50 
 
 		 200 aa  197  6e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000318488  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2032  glutathione S-transferase family protein  50 
 
 		 200 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1842  glutathione S-transferase  50 
 
 		 200 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260742  normal  0.324274 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3617  putative glutathione S-transferase  50 
 
 		 200 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3511  glutathione S-transferase-like protein  49.22 
 
 		 198 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1429  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.74 
 
 		 200 aa  194  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114439  normal  0.299107 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003296  glutathione transferase  49.73 
 
 		 198 aa  193  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04080  probable glutathione S-transferase  47.57 
 
 		 199 aa  187  5.999999999999999e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2670  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.06 
 
 		 200 aa  186  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.237361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3893  glutathione S-transferase-like protein  45.08 
 
 		 210 aa  182  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2495  putative glutathione S-transferase  43.46 
 
 		 204 aa  182  3e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00712937  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1471  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.21 
 
 		 200 aa  182  3e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2139  glutathione S-transferase  42.86 
 
 		 203 aa  176  3e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.041384 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0503  Glutathione S-transferase domain protein  41.27 
 
 		 208 aa  170  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0544052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04799  glutathione S-transferase  44.44 
 
 		 209 aa  169  3e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2296  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.89 
 
 		 204 aa  165  4e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.879102 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1387  Glutathione S-transferase domain protein  42.02 
 
 		 201 aa  164  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1493  glutathione S-transferase family protein  42.05 
 
 		 203 aa  162  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.695225  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1447  glutathione S-transferase family protein  42.05 
 
 		 203 aa  162  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277938  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2641  Glutathione S-transferase domain  41.58 
 
 		 218 aa  162  3e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.213293 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0412  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.56 
 
 		 203 aa  161  5.0000000000000005e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1421  glutathione S-transferase domain protein  40.43 
 
 		 201 aa  157  9e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1101  glutathione S-transferase-like  42.56 
 
 		 256 aa  156  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2738  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.81 
 
 		 216 aa  156  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2981  glutathione S-transferase  41.54 
 
 		 216 aa  150  8.999999999999999e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.897939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3756  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.78 
 
 		 208 aa  149  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1296  glutathione S-transferase-like protein  41.54 
 
 		 228 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.041604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1799  putative glutathione S-transferase (GST)  38.89 
 
 		 216 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.602523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4810  Glutathione S-transferase domain  41.54 
 
 		 217 aa  144  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3927  glutathione S-transferase-like  40.51 
 
 		 228 aa  143  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4124  glutathione S-transferase-like  40.72 
 
 		 217 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.590461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0134  Glutathione S-transferase domain protein  39.25 
 
 		 209 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5413  Glutathione S-transferase domain protein  36.08 
 
 		 207 aa  121  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2762  glutathione S-transferase-like  37.19 
 
 		 206 aa  119  3.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2547  glutathione S-transferase-like  35.05 
 
 		 203 aa  118  6e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.277247  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1347  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.19 
 
 		 205 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1180  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.5 
 
 		 207 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.610567  normal  0.0747789 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4686  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.95 
 
 		 205 aa  115  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3618  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.69 
 
 		 201 aa  114  7.999999999999999e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.822578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3851  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.68 
 
 		 214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.216591  normal  0.461755 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3224  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.87 
 
 		 208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.395203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4693  glutathione S-transferase-like  36.68 
 
 		 214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3670  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.68 
 
 		 214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2439  glutathione S-transferase-like protein  37.19 
 
 		 214 aa  111  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.414826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5040  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.19 
 
 		 221 aa  111  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.367084 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4962  Glutathione S-transferase domain protein  39.6 
 
 		 219 aa  111  7.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3325  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.36 
 
 		 205 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4489  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.82 
 
 		 208 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1128  glutathione S-transferase-like  35.08 
 
 		 206 aa  109  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3573  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.19 
 
 		 214 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.242235  normal  0.0117224 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5417  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.19 
 
 		 214 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3323  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.5 
 
 		 227 aa  107  9.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0187385  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0910  Glutathione S-transferase domain  35.86 
 
 		 203 aa  106  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4952  Glutathione S-transferase domain  36.32 
 
 		 208 aa  106  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.246161 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1057  Glutathione S-transferase domain protein  35.35 
 
 		 203 aa  106  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0628244  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0661  Glutathione S-transferase domain protein  36.82 
 
 		 203 aa  106  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1196  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.18 
 
 		 209 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0645  glutathione S-transferase-like  37.81 
 
 		 225 aa  106  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.722095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2245  glutathione S-transferase-like  34.69 
 
 		 220 aa  106  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.556118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4250  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.67 
 
 		 209 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1162  glutathione S-transferase family protein  34.67 
 
 		 209 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4125  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.13 
 
 		 203 aa  105  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8513  Glutathione S-transferase domain protein  36.14 
 
 		 205 aa  105  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700179  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5005  Glutathione S-transferase domain  36.5 
 
 		 208 aa  105  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.286975  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0925  putative glutathione S-transferase  36.87 
 
 		 203 aa  105  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.324873  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4051  putative glutathione S-transferase  34.85 
 
 		 223 aa  104  9e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.838028 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5690  glutathione S-transferase-like protein  34.85 
 
 		 227 aa  102  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529075 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1775  glutathione S-transferase  33.33 
 
 		 208 aa  99.4  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000137039 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0125  glutathione S-transferase  36.76 
 
 		 266 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0107  glutathione S-transferase  36.76 
 
 		 214 aa  97.4  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1267  glutathione S-transferase  36.76 
 
 		 214 aa  97.4  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261228  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3433  glutathione S-transferase family protein  32.47 
 
 		 214 aa  97.4  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000284771 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2817  glutathione S-transferase  36.76 
 
 		 300 aa  97.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0407  glutathione S-transferase  37.17 
 
 		 217 aa  96.3  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1106  Glutathione S-transferase domain  33.67 
 
 		 203 aa  96.7  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1904  Glutathione S-transferase domain protein  33.16 
 
 		 199 aa  96.3  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5079  Glutathione S-transferase domain  35 
 
 		 213 aa  95.5  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.242731  hitchhiker  0.00740675 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2104  putative glutathione S-transferase  36.04 
 
 		 198 aa  94.7  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2741  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.81 
 
 		 203 aa  94.4  9e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.492964 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3092  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.82 
 
 		 205 aa  94.4  9e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.061874 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1071  glutathione S-transferase  36.27 
 
 		 214 aa  94  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.292672  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1508  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.5 
 
 		 211 aa  94  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4748  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.03 
 
 		 222 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>