More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1106 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1106  Glutathione S-transferase domain  100 
 
 
203 aa  412  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5568  glutathione S-transferase domain-containing protein  72.91 
 
 
205 aa  312  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446565  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0925  putative glutathione S-transferase  72.91 
 
 
203 aa  308  2.9999999999999997e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.324873  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0661  Glutathione S-transferase domain protein  72.41 
 
 
203 aa  297  6e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4686  glutathione S-transferase domain-containing protein  68.97 
 
 
205 aa  296  2e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3325  glutathione S-transferase domain-containing protein  68.47 
 
 
205 aa  295  3e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1347  glutathione S-transferase domain-containing protein  67.49 
 
 
205 aa  289  2e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8513  Glutathione S-transferase domain protein  68.97 
 
 
205 aa  288  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700179  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1057  Glutathione S-transferase domain protein  68.47 
 
 
203 aa  286  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0628244  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0910  Glutathione S-transferase domain  68.47 
 
 
203 aa  283  9e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4125  glutathione S-transferase domain-containing protein  67.49 
 
 
203 aa  280  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4729  glutathione S-transferase  67.49 
 
 
203 aa  271  6e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0556098  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4489  glutathione S-transferase domain-containing protein  65.02 
 
 
208 aa  266  2e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4952  Glutathione S-transferase domain  64.53 
 
 
208 aa  265  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.246161 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2762  glutathione S-transferase-like  62.75 
 
 
206 aa  265  5e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4051  putative glutathione S-transferase  63.05 
 
 
223 aa  264  7e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.838028 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5005  Glutathione S-transferase domain  65.52 
 
 
208 aa  263  1e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.286975  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3323  glutathione S-transferase domain-containing protein  64.04 
 
 
227 aa  263  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0187385  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3224  glutathione S-transferase domain-containing protein  62.56 
 
 
208 aa  263  2e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.395203  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1162  glutathione S-transferase family protein  62.69 
 
 
209 aa  251  6e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4250  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.69 
 
 
209 aa  249  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1196  glutathione S-transferase domain-containing protein  62.69 
 
 
209 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5690  glutathione S-transferase-like protein  60.4 
 
 
227 aa  245  4e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.529075 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1180  glutathione S-transferase domain-containing protein  60.78 
 
 
207 aa  244  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.610567  normal  0.0747789 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2670  putative glutathione S-transferase  58.13 
 
 
297 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2817  glutathione S-transferase  58.13 
 
 
300 aa  240  9e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0125  glutathione S-transferase  57.64 
 
 
266 aa  239  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1071  glutathione S-transferase  58.13 
 
 
214 aa  239  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.292672  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0107  glutathione S-transferase  57.64 
 
 
214 aa  238  5e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1267  glutathione S-transferase  57.64 
 
 
214 aa  238  5e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261228  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3670  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.14 
 
 
214 aa  235  4e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630105  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2439  glutathione S-transferase-like protein  58.13 
 
 
214 aa  235  4e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.414826  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4693  glutathione S-transferase-like  57.14 
 
 
214 aa  235  4e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3851  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.65 
 
 
214 aa  234  8e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.216591  normal  0.461755 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5417  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.65 
 
 
214 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556283  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3573  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.16 
 
 
214 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.242235  normal  0.0117224 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0407  glutathione S-transferase  57.14 
 
 
217 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5040  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.14 
 
 
221 aa  230  9e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.367084 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0645  glutathione S-transferase-like  55.12 
 
 
225 aa  227  7e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.722095  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2245  glutathione S-transferase-like  52.74 
 
 
220 aa  218  5e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.556118  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5079  Glutathione S-transferase domain  50.74 
 
 
213 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.242731  hitchhiker  0.00740675 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4962  Glutathione S-transferase domain protein  50.24 
 
 
219 aa  213  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3433  glutathione S-transferase family protein  50.25 
 
 
214 aa  210  1e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000284771 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6230  putative glutathione S-transferase  54.04 
 
 
207 aa  196  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0344917  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3947  Glutathione S-transferase domain protein  50.78 
 
 
207 aa  195  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1128  glutathione S-transferase-like  48.28 
 
 
206 aa  190  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1904  Glutathione S-transferase domain protein  48.19 
 
 
199 aa  187  7e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142458  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0462  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.74 
 
 
205 aa  176  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.269396 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3092  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.72 
 
 
205 aa  174  6e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.061874 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2104  putative glutathione S-transferase  44.04 
 
 
198 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1708  Glutathione S-transferase domain  43.23 
 
 
199 aa  171  5.999999999999999e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0797  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.3 
 
 
205 aa  169  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3285  putative glutathione S-transferase  42.41 
 
 
197 aa  167  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.549218  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24830  putative glutathione S-transferase  43.01 
 
 
198 aa  165  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1873  Glutathione S-transferase domain protein  42.11 
 
 
200 aa  164  8e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2349  glutathione S-transferase-like protein  36.46 
 
 
208 aa  127  8.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0771783 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3700  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.18 
 
 
202 aa  123  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5869  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.83 
 
 
215 aa  121  7e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2738  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.1 
 
 
216 aa  118  6e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1296  glutathione S-transferase-like protein  35.78 
 
 
228 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.041604  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6467  Glutathione S-transferase domain protein  35.15 
 
 
219 aa  112  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1704  Glutathione S-transferase domain protein  33.83 
 
 
212 aa  112  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0690203  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4463  Glutathione S-transferase domain  34.83 
 
 
220 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0595447 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3511  glutathione S-transferase-like protein  35.03 
 
 
198 aa  111  6e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0196  glutathione S-transferase-like  35.61 
 
 
204 aa  110  9e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5413  Glutathione S-transferase domain protein  34.52 
 
 
207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1799  putative glutathione S-transferase (GST)  34.45 
 
 
216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.602523  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2981  glutathione S-transferase  34.63 
 
 
216 aa  108  5e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.897939  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3893  glutathione S-transferase-like protein  32.65 
 
 
210 aa  108  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3211  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.5 
 
 
198 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3155  hypothetical protein  34.63 
 
 
207 aa  107  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.423769  normal  0.476319 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1101  glutathione S-transferase-like  34.63 
 
 
256 aa  107  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3927  glutathione S-transferase-like  33.99 
 
 
228 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0805  putative glutathione S-transferase  31 
 
 
216 aa  105  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.671378  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4810  Glutathione S-transferase domain  33.49 
 
 
217 aa  104  9e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3532  Glutathione S-transferase domain protein  34.95 
 
 
217 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.150118 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2670  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.17 
 
 
200 aa  103  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.237361  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04080  probable glutathione S-transferase  32 
 
 
199 aa  102  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3617  putative glutathione S-transferase  30.96 
 
 
200 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1560  glutathione S-transferase-like  32.49 
 
 
210 aa  100  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.25247  normal  0.599029 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2547  glutathione S-transferase-like  33.85 
 
 
203 aa  100  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.277247  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43110  putative glutathione S-transferase  31.47 
 
 
200 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000318488  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2032  glutathione S-transferase family protein  31.66 
 
 
200 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3890  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.67 
 
 
200 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.19285 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1842  glutathione S-transferase  31.16 
 
 
200 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260742  normal  0.324274 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1821  glutathione S-transferase family protein  34.67 
 
 
200 aa  99  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0623474  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1447  glutathione S-transferase family protein  32.66 
 
 
203 aa  97.4  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277938  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1493  glutathione S-transferase family protein  32.66 
 
 
203 aa  97.4  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.695225  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1399  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.17 
 
 
200 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250488  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003296  glutathione transferase  32.02 
 
 
198 aa  96.7  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3618  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.16 
 
 
201 aa  97.1  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.822578  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2557  glutathione S-transferase-like protein  36.04 
 
 
205 aa  97.1  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.630075 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4124  glutathione S-transferase-like  31.73 
 
 
217 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.590461  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4794  Glutathione S-transferase domain  33.67 
 
 
197 aa  96.7  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.915466  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1240  Glutathione S-transferase domain  29.27 
 
 
213 aa  95.9  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123579  normal  0.124818 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1429  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.66 
 
 
200 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114439  normal  0.299107 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0837  glutathione S-transferase domain protein  31.63 
 
 
211 aa  94.7  8e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.613396 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4359  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.31 
 
 
222 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2073  Glutathione S-transferase domain  30.24 
 
 
213 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.774679  normal  0.0456347 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1311  glutathione S-transferase-like protein  34 
 
 
196 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.55458  normal  0.181696 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>