More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3224 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3224  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 		 208 aa  421  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.395203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4250  glutathione S-transferase domain-containing protein  81.64 
 
 		 209 aa  351  4e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1162  glutathione S-transferase family protein  82.13 
 
 		 209 aa  350  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1196  glutathione S-transferase domain-containing protein  81.16 
 
 		 209 aa  347  9e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1180  glutathione S-transferase domain-containing protein  81.86 
 
 		 207 aa  343  1e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.610567  normal  0.0747789 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5690  glutathione S-transferase-like protein  75.86 
 
 		 227 aa  322  2e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529075 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1057  Glutathione S-transferase domain protein  67 
 
 		 203 aa  280  8.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0628244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8513  Glutathione S-transferase domain protein  66.01 
 
 		 205 aa  280  1e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700179  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2439  glutathione S-transferase-like protein  67.46 
 
 		 214 aa  279  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.414826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3670  glutathione S-transferase domain-containing protein  66.51 
 
 		 214 aa  275  4e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4693  glutathione S-transferase-like  66.51 
 
 		 214 aa  275  4e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0645  glutathione S-transferase-like  66.83 
 
 		 225 aa  274  6e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.722095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0910  Glutathione S-transferase domain  65.02 
 
 		 203 aa  274  9e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0661  Glutathione S-transferase domain protein  66.5 
 
 		 203 aa  273  1.0000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3323  glutathione S-transferase domain-containing protein  66.18 
 
 		 227 aa  273  1.0000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0187385  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3851  glutathione S-transferase domain-containing protein  66.03 
 
 		 214 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.216591  normal  0.461755 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4489  glutathione S-transferase domain-containing protein  64.04 
 
 		 208 aa  272  3e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5040  glutathione S-transferase domain-containing protein  66.01 
 
 		 221 aa  271  6e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.367084 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3573  glutathione S-transferase domain-containing protein  64.11 
 
 		 214 aa  270  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.242235  normal  0.0117224 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5417  glutathione S-transferase domain-containing protein  64.08 
 
 		 214 aa  268  5e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2817  glutathione S-transferase  65.52 
 
 		 300 aa  267  7e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4952  Glutathione S-transferase domain  63.55 
 
 		 208 aa  267  1e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.246161 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0125  glutathione S-transferase  65.02 
 
 		 266 aa  266  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0107  glutathione S-transferase  65.02 
 
 		 214 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1267  glutathione S-transferase  65.02 
 
 		 214 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261228  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5005  Glutathione S-transferase domain  63.55 
 
 		 208 aa  265  4e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.286975  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0407  glutathione S-transferase  66.01 
 
 		 217 aa  265  4e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2670  putative glutathione S-transferase  65.02 
 
 		 297 aa  265  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4686  glutathione S-transferase domain-containing protein  65.52 
 
 		 205 aa  264  8e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3325  glutathione S-transferase domain-containing protein  64.53 
 
 		 205 aa  263  1e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1071  glutathione S-transferase  65.02 
 
 		 214 aa  263  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.292672  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1106  Glutathione S-transferase domain  62.56 
 
 		 203 aa  263  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4962  Glutathione S-transferase domain protein  61.61 
 
 		 219 aa  262  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2762  glutathione S-transferase-like  64.71 
 
 		 206 aa  258  6e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0925  putative glutathione S-transferase  65.02 
 
 		 203 aa  257  8e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.324873  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4051  putative glutathione S-transferase  60 
 
 		 223 aa  254  5e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.838028 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4125  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.58 
 
 		 203 aa  253  1.0000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1347  glutathione S-transferase domain-containing protein  63.05 
 
 		 205 aa  249  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5568  glutathione S-transferase domain-containing protein  60.59 
 
 		 205 aa  248  5e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5079  Glutathione S-transferase domain  57.62 
 
 		 213 aa  246  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.242731  hitchhiker  0.00740675 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4729  glutathione S-transferase  59.61 
 
 		 203 aa  236  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0556098  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3433  glutathione S-transferase family protein  55.33 
 
 		 214 aa  231  5e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000284771 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2245  glutathione S-transferase-like  58.88 
 
 		 220 aa  229  3e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.556118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6230  putative glutathione S-transferase  61.86 
 
 		 207 aa  227  8e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0344917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1128  glutathione S-transferase-like  52.88 
 
 		 206 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0462  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.06 
 
 		 205 aa  210  1e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.269396 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1904  Glutathione S-transferase domain protein  50.26 
 
 		 199 aa  197  7e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3092  glutathione S-transferase domain-containing protein  50 
 
 		 205 aa  193  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.061874 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0797  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.25 
 
 		 205 aa  191  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3947  Glutathione S-transferase domain protein  49.23 
 
 		 207 aa  189  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2104  putative glutathione S-transferase  46.43 
 
 		 198 aa  179  4e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24830  putative glutathione S-transferase  44.39 
 
 		 198 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1873  Glutathione S-transferase domain protein  44.17 
 
 		 200 aa  170  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1708  Glutathione S-transferase domain  43.08 
 
 		 199 aa  167  1e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3285  putative glutathione S-transferase  41.12 
 
 		 197 aa  164  9e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.549218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5869  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.45 
 
 		 215 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2349  glutathione S-transferase-like protein  38.78 
 
 		 208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0771783 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1429  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.7 
 
 		 200 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114439  normal  0.299107 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1821  glutathione S-transferase family protein  39.2 
 
 		 200 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0623474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1399  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.2 
 
 		 200 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3211  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.5 
 
 		 198 aa  122  4e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1704  Glutathione S-transferase domain protein  35.96 
 
 		 212 aa  121  8e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0690203  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2670  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.5 
 
 		 200 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.237361  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2032  glutathione S-transferase family protein  37.5 
 
 		 200 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3890  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.69 
 
 		 200 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.19285 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43110  putative glutathione S-transferase  37.19 
 
 		 200 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000318488  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3511  glutathione S-transferase-like protein  34.5 
 
 		 198 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3617  putative glutathione S-transferase  36.68 
 
 		 200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0196  glutathione S-transferase-like  37 
 
 		 204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4463  Glutathione S-transferase domain  37.62 
 
 		 220 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0595447 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6467  Glutathione S-transferase domain protein  37.62 
 
 		 219 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3700  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.71 
 
 		 202 aa  118  4.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1842  glutathione S-transferase  35.68 
 
 		 200 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260742  normal  0.324274 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1799  putative glutathione S-transferase (GST)  35 
 
 		 216 aa  115  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.602523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2738  glutathione S-transferase domain-containing protein  37 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2981  glutathione S-transferase  34.63 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.897939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2073  Glutathione S-transferase domain  35.47 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.774679  normal  0.0456347 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4794  Glutathione S-transferase domain  36.87 
 
 		 197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.915466  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3893  glutathione S-transferase-like protein  33.5 
 
 		 210 aa  111  7.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1101  glutathione S-transferase-like  35.12 
 
 		 256 aa  111  8.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003296  glutathione transferase  35.86 
 
 		 198 aa  111  8.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1240  Glutathione S-transferase domain  34.16 
 
 		 213 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123579  normal  0.124818 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5423  Gst12 glutathione-S-transferase  32.02 
 
 		 210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.355245  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04080  probable glutathione S-transferase  32.5 
 
 		 199 aa  109  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1296  glutathione S-transferase-like protein  35.47 
 
 		 228 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.041604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1311  glutathione S-transferase-like protein  35.9 
 
 		 196 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.55458  normal  0.181696 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1387  Glutathione S-transferase domain protein  32.16 
 
 		 201 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4810  Glutathione S-transferase domain  33.99 
 
 		 217 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3927  glutathione S-transferase-like  35 
 
 		 228 aa  108  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2296  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.83 
 
 		 204 aa  107  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.879102 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2139  glutathione S-transferase  32.99 
 
 		 203 aa  107  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.041384 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2312  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.08 
 
 		 195 aa  105  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0196665 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2587  Glutathione S-transferase domain  36.32 
 
 		 195 aa  105  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.751074  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4124  glutathione S-transferase-like  34 
 
 		 217 aa  104  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.590461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3155  hypothetical protein  33.66 
 
 		 207 aa  104  8e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.423769  normal  0.476319 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1421  glutathione S-transferase domain protein  31.16 
 
 		 201 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3910  glutathione S-transferase-like  35.48 
 
 		 201 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0503  Glutathione S-transferase domain protein  31.5 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0544052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04799  glutathione S-transferase  31.25 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2547  glutathione S-transferase-like  34.85 
 
 		 203 aa  102  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.277247  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>