More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6230 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_6230  putative glutathione S-transferase  100 
 
 
207 aa  412  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0344917  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1180  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.81 
 
 
207 aa  248  6e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.610567  normal  0.0747789 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3224  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.86 
 
 
208 aa  244  9e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.395203  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4250  glutathione S-transferase domain-containing protein  62.37 
 
 
209 aa  244  9e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0645  glutathione S-transferase-like  61.27 
 
 
225 aa  243  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.722095  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2670  putative glutathione S-transferase  63.45 
 
 
297 aa  242  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0407  glutathione S-transferase  63.96 
 
 
217 aa  241  3.9999999999999997e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2817  glutathione S-transferase  63.45 
 
 
300 aa  241  5e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1071  glutathione S-transferase  63.45 
 
 
214 aa  240  9e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.292672  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1162  glutathione S-transferase family protein  61.86 
 
 
209 aa  239  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0125  glutathione S-transferase  62.94 
 
 
266 aa  239  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1196  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.86 
 
 
209 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0107  glutathione S-transferase  62.94 
 
 
214 aa  238  4e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1267  glutathione S-transferase  62.94 
 
 
214 aa  238  4e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261228  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2439  glutathione S-transferase-like protein  63.4 
 
 
214 aa  237  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.414826  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4693  glutathione S-transferase-like  61.42 
 
 
214 aa  235  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3670  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.42 
 
 
214 aa  235  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630105  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3851  glutathione S-transferase domain-containing protein  62.37 
 
 
214 aa  235  4e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.216591  normal  0.461755 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5040  glutathione S-transferase domain-containing protein  60.91 
 
 
221 aa  231  4.0000000000000004e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.367084 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4962  Glutathione S-transferase domain protein  57.5 
 
 
219 aa  229  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3573  glutathione S-transferase domain-containing protein  60.41 
 
 
214 aa  229  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.242235  normal  0.0117224 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5417  glutathione S-transferase domain-containing protein  60.41 
 
 
214 aa  229  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556283  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4952  Glutathione S-transferase domain  59.11 
 
 
208 aa  226  3e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.246161 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5690  glutathione S-transferase-like protein  56.57 
 
 
227 aa  223  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.529075 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4489  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.62 
 
 
208 aa  223  1e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5005  Glutathione S-transferase domain  59.11 
 
 
208 aa  223  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.286975  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8513  Glutathione S-transferase domain protein  57.21 
 
 
205 aa  223  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700179  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5079  Glutathione S-transferase domain  55.33 
 
 
213 aa  221  8e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.242731  hitchhiker  0.00740675 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3323  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.22 
 
 
227 aa  219  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0187385  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4051  putative glutathione S-transferase  57.29 
 
 
223 aa  219  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.838028 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2762  glutathione S-transferase-like  60 
 
 
206 aa  215  2.9999999999999998e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0925  putative glutathione S-transferase  55.78 
 
 
203 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.324873  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4686  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.58 
 
 
205 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1347  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.14 
 
 
205 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5568  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.68 
 
 
205 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446565  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0661  Glutathione S-transferase domain protein  55.78 
 
 
203 aa  211  4.9999999999999996e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1057  Glutathione S-transferase domain protein  55.17 
 
 
203 aa  209  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0628244  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0910  Glutathione S-transferase domain  55.17 
 
 
203 aa  209  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1106  Glutathione S-transferase domain  54.04 
 
 
203 aa  208  5e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4125  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.04 
 
 
203 aa  206  3e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1128  glutathione S-transferase-like  52.28 
 
 
206 aa  201  5e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3325  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.05 
 
 
205 aa  201  8e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4729  glutathione S-transferase  54.46 
 
 
203 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0556098  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3433  glutathione S-transferase family protein  44 
 
 
214 aa  195  3e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000284771 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3092  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.01 
 
 
205 aa  192  4e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.061874 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2245  glutathione S-transferase-like  50.75 
 
 
220 aa  190  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.556118  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1904  Glutathione S-transferase domain protein  49.74 
 
 
199 aa  188  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142458  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0462  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.51 
 
 
205 aa  185  4e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.269396 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3947  Glutathione S-transferase domain protein  49.23 
 
 
207 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0797  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.81 
 
 
205 aa  181  9.000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1873  Glutathione S-transferase domain protein  45.64 
 
 
200 aa  169  3e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2104  putative glutathione S-transferase  46.67 
 
 
198 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1708  Glutathione S-transferase domain  44.85 
 
 
199 aa  160  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24830  putative glutathione S-transferase  44.1 
 
 
198 aa  156  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3285  putative glutathione S-transferase  44.16 
 
 
197 aa  155  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.549218  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2349  glutathione S-transferase-like protein  46.15 
 
 
208 aa  135  4e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0771783 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5869  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.57 
 
 
215 aa  134  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1704  Glutathione S-transferase domain protein  39.81 
 
 
212 aa  125  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0690203  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2670  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.9 
 
 
200 aa  124  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.237361  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1842  glutathione S-transferase  40.41 
 
 
200 aa  121  6e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260742  normal  0.324274 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2032  glutathione S-transferase family protein  39.9 
 
 
200 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3700  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.36 
 
 
202 aa  118  4.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2738  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.92 
 
 
216 aa  117  7.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1821  glutathione S-transferase family protein  39.38 
 
 
200 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0623474  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1240  Glutathione S-transferase domain  38.73 
 
 
213 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123579  normal  0.124818 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43110  putative glutathione S-transferase  36.5 
 
 
200 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000318488  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3511  glutathione S-transferase-like protein  36.32 
 
 
198 aa  115  3e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3617  putative glutathione S-transferase  36.5 
 
 
200 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2641  Glutathione S-transferase domain  39.39 
 
 
218 aa  115  6e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.213293 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0196  glutathione S-transferase-like  36.27 
 
 
204 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5423  Gst12 glutathione-S-transferase  34.62 
 
 
210 aa  114  7.999999999999999e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.355245  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3890  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.38 
 
 
200 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.19285 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1399  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.31 
 
 
200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250488  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3211  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.5 
 
 
198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1387  Glutathione S-transferase domain protein  33 
 
 
201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2073  Glutathione S-transferase domain  37.86 
 
 
213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.774679  normal  0.0456347 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6467  Glutathione S-transferase domain protein  39.22 
 
 
219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04080  probable glutathione S-transferase  32.67 
 
 
199 aa  111  6e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1429  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.5 
 
 
200 aa  111  6e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114439  normal  0.299107 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3954  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.97 
 
 
205 aa  111  9e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.251267 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4463  Glutathione S-transferase domain  38.73 
 
 
220 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0595447 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3893  glutathione S-transferase-like protein  32.54 
 
 
210 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1421  glutathione S-transferase domain protein  32.5 
 
 
201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3478  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.44 
 
 
205 aa  109  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.556825  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5300  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.95 
 
 
205 aa  108  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.217524  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3827  putative glutathione S-transferase  34.95 
 
 
208 aa  107  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2296  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.65 
 
 
204 aa  107  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.879102 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2557  glutathione S-transferase-like protein  37.11 
 
 
205 aa  105  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.630075 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5110  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.66 
 
 
205 aa  105  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0347901 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3155  hypothetical protein  37.32 
 
 
207 aa  104  7e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.423769  normal  0.476319 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3756  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.09 
 
 
208 aa  104  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003296  glutathione transferase  35.23 
 
 
198 aa  105  7e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2587  Glutathione S-transferase domain  38.38 
 
 
195 aa  104  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.751074  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2495  putative glutathione S-transferase  34.33 
 
 
204 aa  103  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00712937  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0412  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.5 
 
 
203 aa  102  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04799  glutathione S-transferase  36.6 
 
 
209 aa  103  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2312  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.57 
 
 
195 aa  102  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0196665 
 
 
-
 
NC_004310  BR1493  glutathione S-transferase family protein  36.87 
 
 
203 aa  102  4e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.695225  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1447  glutathione S-transferase family protein  36.87 
 
 
203 aa  102  4e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277938  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1471  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.53 
 
 
200 aa  102  5e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>