More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5423 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5423  Gst12 glutathione-S-transferase  100 
 
 		 210 aa  431  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.355245  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1240  Glutathione S-transferase domain  58.94 
 
 		 213 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123579  normal  0.124818 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2073  Glutathione S-transferase domain  58.17 
 
 		 213 aa  235  4e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.774679  normal  0.0456347 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3155  hypothetical protein  49.76 
 
 		 207 aa  205  5e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.423769  normal  0.476319 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5869  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.41 
 
 		 215 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1704  Glutathione S-transferase domain protein  41.46 
 
 		 212 aa  155  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0690203  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4463  Glutathione S-transferase domain  37.5 
 
 		 220 aa  132  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0595447 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2104  putative glutathione S-transferase  37.07 
 
 		 198 aa  129  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6467  Glutathione S-transferase domain protein  37.02 
 
 		 219 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2439  glutathione S-transferase-like protein  37.25 
 
 		 214 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.414826  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0107  glutathione S-transferase  38.92 
 
 		 214 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1267  glutathione S-transferase  38.92 
 
 		 214 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261228  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0125  glutathione S-transferase  38.92 
 
 		 266 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1071  glutathione S-transferase  38.42 
 
 		 214 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.292672  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2670  putative glutathione S-transferase  38.42 
 
 		 297 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1180  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.66 
 
 		 207 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.610567  normal  0.0747789 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2817  glutathione S-transferase  38.42 
 
 		 300 aa  125  6e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3670  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.27 
 
 		 214 aa  124  7e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3851  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.27 
 
 		 214 aa  124  7e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.216591  normal  0.461755 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4693  glutathione S-transferase-like  36.27 
 
 		 214 aa  124  7e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3947  Glutathione S-transferase domain protein  36.23 
 
 		 207 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1708  Glutathione S-transferase domain  37.56 
 
 		 199 aa  123  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0407  glutathione S-transferase  37.93 
 
 		 217 aa  122  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1904  Glutathione S-transferase domain protein  34.63 
 
 		 199 aa  121  9e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3092  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.62 
 
 		 205 aa  119  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.061874 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24830  putative glutathione S-transferase  36.41 
 
 		 198 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4250  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.18 
 
 		 209 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3285  putative glutathione S-transferase  35.47 
 
 		 197 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.549218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5079  Glutathione S-transferase domain  34.16 
 
 		 213 aa  115  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.242731  hitchhiker  0.00740675 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1162  glutathione S-transferase family protein  31.19 
 
 		 209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5040  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.82 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.367084 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3573  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.67 
 
 		 214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.242235  normal  0.0117224 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5417  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.67 
 
 		 214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1196  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.19 
 
 		 209 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0925  putative glutathione S-transferase  31.71 
 
 		 203 aa  112  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.324873  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0797  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.12 
 
 		 205 aa  111  7.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1347  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.84 
 
 		 205 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5690  glutathione S-transferase-like protein  31.22 
 
 		 227 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529075 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3224  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.02 
 
 		 208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.395203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4729  glutathione S-transferase  33.33 
 
 		 203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0556098  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2245  glutathione S-transferase-like  31.4 
 
 		 220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.556118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3433  glutathione S-transferase family protein  30.3 
 
 		 214 aa  108  5e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000284771 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3323  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.88 
 
 		 227 aa  108  8.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0187385  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0645  glutathione S-transferase-like  31.07 
 
 		 225 aa  107  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.722095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4952  Glutathione S-transferase domain  32.37 
 
 		 208 aa  106  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.246161 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6230  putative glutathione S-transferase  34.13 
 
 		 207 aa  106  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0344917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4489  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.88 
 
 		 208 aa  106  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2762  glutathione S-transferase-like  32.06 
 
 		 206 aa  105  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4962  Glutathione S-transferase domain protein  33.82 
 
 		 219 aa  105  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4125  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.22 
 
 		 203 aa  105  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1873  Glutathione S-transferase domain protein  33.83 
 
 		 200 aa  104  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1128  glutathione S-transferase-like  28.86 
 
 		 206 aa  104  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5005  Glutathione S-transferase domain  32.37 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.286975  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4686  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.22 
 
 		 205 aa  102  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4051  putative glutathione S-transferase  32.32 
 
 		 223 aa  101  8e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.838028 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0462  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.54 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.269396 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3325  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.81 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5568  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.78 
 
 		 205 aa  99  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8513  Glutathione S-transferase domain protein  29.8 
 
 		 205 aa  98.6  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700179  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0910  Glutathione S-transferase domain  32.5 
 
 		 203 aa  95.9  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0503  Glutathione S-transferase domain protein  29.8 
 
 		 208 aa  95.1  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0544052  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1057  Glutathione S-transferase domain protein  31.5 
 
 		 203 aa  93.6  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0628244  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0661  Glutathione S-transferase domain protein  29.85 
 
 		 203 aa  92.8  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1106  Glutathione S-transferase domain  26.77 
 
 		 203 aa  90.5  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3511  glutathione S-transferase-like protein  29.67 
 
 		 198 aa  90.9  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1842  glutathione S-transferase  31.28 
 
 		 200 aa  89  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260742  normal  0.324274 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2981  glutathione S-transferase  34.45 
 
 		 216 aa  89.4  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.897939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3893  glutathione S-transferase-like protein  28.04 
 
 		 210 aa  89.4  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2349  glutathione S-transferase-like protein  31.03 
 
 		 208 aa  89.4  4e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0771783 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1429  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.51 
 
 		 200 aa  89  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114439  normal  0.299107 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3617  putative glutathione S-transferase  33.5 
 
 		 200 aa  88.2  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3890  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.94 
 
 		 200 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.19285 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1821  glutathione S-transferase family protein  31.41 
 
 		 200 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0623474  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2032  glutathione S-transferase family protein  29.9 
 
 		 200 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43110  putative glutathione S-transferase  32.5 
 
 		 200 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000318488  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1399  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.41 
 
 		 200 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2670  glutathione S-transferase domain-containing protein  31 
 
 		 200 aa  85.1  8e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.237361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1101  glutathione S-transferase-like  33.01 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2641  Glutathione S-transferase domain  32.23 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.213293 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3827  putative glutathione S-transferase  28.14 
 
 		 208 aa  84  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0974  Glutathione S-transferase domain protein  28.64 
 
 		 209 aa  82.4  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2139  glutathione S-transferase  25.37 
 
 		 203 aa  81.6  0.000000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.041384 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1387  Glutathione S-transferase domain protein  30.1 
 
 		 201 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4810  Glutathione S-transferase domain  30.66 
 
 		 217 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04799  glutathione S-transferase  29.52 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04080  probable glutathione S-transferase  27.84 
 
 		 199 aa  80.1  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2738  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.19 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1799  putative glutathione S-transferase (GST)  29.91 
 
 		 216 aa  78.6  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.602523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3927  glutathione S-transferase-like  29.47 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4124  glutathione S-transferase-like  28.64 
 
 		 217 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.590461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1421  glutathione S-transferase domain protein  28.23 
 
 		 201 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5413  Glutathione S-transferase domain protein  30.52 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1296  glutathione S-transferase-like protein  31.46 
 
 		 228 aa  75.5  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.041604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1471  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.85 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2495  putative glutathione S-transferase  26.6 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00712937  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3910  glutathione S-transferase-like  29.29 
 
 		 201 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2696  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.57 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036581 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2764  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.57 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1306  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.49 
 
 		 222 aa  72  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1576  glutathione S-transferase family protein  28.11 
 
 		 222 aa  72  0.000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>