More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3890 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_3890  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 		 200 aa  414  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.19285 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1821  glutathione S-transferase family protein  98.5 
 
 		 200 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0623474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1399  glutathione S-transferase domain-containing protein  98.5 
 
 		 200 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1429  glutathione S-transferase domain-containing protein  92.5 
 
 		 200 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114439  normal  0.299107 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2670  glutathione S-transferase domain-containing protein  78 
 
 		 200 aa  335  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.237361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1842  glutathione S-transferase  75.88 
 
 		 200 aa  324  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260742  normal  0.324274 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3617  putative glutathione S-transferase  74.87 
 
 		 200 aa  318  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43110  putative glutathione S-transferase  74.87 
 
 		 200 aa  318  3e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000318488  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2032  glutathione S-transferase family protein  73.87 
 
 		 200 aa  316  2e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3211  glutathione S-transferase domain-containing protein  64.97 
 
 		 198 aa  271  5.000000000000001e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3511  glutathione S-transferase-like protein  60.71 
 
 		 198 aa  257  8e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0196  glutathione S-transferase-like  60.2 
 
 		 204 aa  255  3e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2495  putative glutathione S-transferase  58.67 
 
 		 204 aa  254  5e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00712937  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04080  probable glutathione S-transferase  57.14 
 
 		 199 aa  252  2.0000000000000002e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2139  glutathione S-transferase  58.79 
 
 		 203 aa  251  4.0000000000000004e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.041384 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3827  putative glutathione S-transferase  58.08 
 
 		 208 aa  247  8e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0503  Glutathione S-transferase domain protein  56.28 
 
 		 208 aa  239  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0544052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003296  glutathione transferase  55.38 
 
 		 198 aa  232  3e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1471  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.61 
 
 		 200 aa  226  2e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2296  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.33 
 
 		 204 aa  218  3e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.879102 
 
 
-
 
NC_004310  BR1493  glutathione S-transferase family protein  54.27 
 
 		 203 aa  214  7e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.695225  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1447  glutathione S-transferase family protein  54.27 
 
 		 203 aa  214  7e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277938  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3893  glutathione S-transferase-like protein  53.16 
 
 		 210 aa  210  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2269  Glutathione S-transferase domain  55.03 
 
 		 195 aa  208  4e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4794  Glutathione S-transferase domain  51.32 
 
 		 197 aa  204  7e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.915466  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1985  glutathione S-transferase  51.85 
 
 		 207 aa  204  8e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2738  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.59 
 
 		 216 aa  204  9e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2587  Glutathione S-transferase domain  53.4 
 
 		 195 aa  204  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.751074  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2312  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.6 
 
 		 195 aa  202  3e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0196665 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1387  Glutathione S-transferase domain protein  48.48 
 
 		 201 aa  201  6e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04799  glutathione S-transferase  50.77 
 
 		 209 aa  201  6e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2641  Glutathione S-transferase domain  50.51 
 
 		 218 aa  201  8e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.213293 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1421  glutathione S-transferase domain protein  47.98 
 
 		 201 aa  199  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3910  glutathione S-transferase-like  51.89 
 
 		 201 aa  197  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3587  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.41 
 
 		 203 aa  197  9e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0707812  hitchhiker  0.000377551 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1311  glutathione S-transferase-like protein  49.24 
 
 		 196 aa  192  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.55458  normal  0.181696 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0017  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.27 
 
 		 192 aa  189  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1171  Glutathione S-transferase domain protein  50.27 
 
 		 204 aa  187  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245566  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1820  putative glutathione S-transferase  49.46 
 
 		 196 aa  186  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2981  glutathione S-transferase  46.27 
 
 		 216 aa  183  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.897939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1101  glutathione S-transferase-like  47.26 
 
 		 256 aa  182  3e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1296  glutathione S-transferase-like protein  47.74 
 
 		 228 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.041604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4810  Glutathione S-transferase domain  48.24 
 
 		 217 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4124  glutathione S-transferase-like  47.24 
 
 		 217 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.590461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3927  glutathione S-transferase-like  46.73 
 
 		 228 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1799  putative glutathione S-transferase (GST)  45.23 
 
 		 216 aa  176  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.602523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3756  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.64 
 
 		 208 aa  176  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0412  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.97 
 
 		 203 aa  155  6e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5413  Glutathione S-transferase domain protein  40.2 
 
 		 207 aa  149  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0134  Glutathione S-transferase domain protein  44.04 
 
 		 209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2547  glutathione S-transferase-like  39.7 
 
 		 203 aa  144  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.277247  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3618  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.82 
 
 		 201 aa  137  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.822578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1180  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.24 
 
 		 207 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.610567  normal  0.0747789 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0645  glutathione S-transferase-like  38.12 
 
 		 225 aa  122  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.722095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5040  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.18 
 
 		 221 aa  121  7e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.367084 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1162  glutathione S-transferase family protein  37.31 
 
 		 209 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1196  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.31 
 
 		 209 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3224  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.69 
 
 		 208 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.395203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1087  glutathione S-transferase family protein  34.59 
 
 		 222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.983271 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4250  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.31 
 
 		 209 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0125  glutathione S-transferase  41.12 
 
 		 266 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0107  glutathione S-transferase  40.93 
 
 		 214 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1267  glutathione S-transferase  40.93 
 
 		 214 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261228  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2439  glutathione S-transferase-like protein  35.68 
 
 		 214 aa  118  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.414826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2817  glutathione S-transferase  40.61 
 
 		 300 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4962  Glutathione S-transferase domain protein  38.92 
 
 		 219 aa  117  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24830  putative glutathione S-transferase  40.31 
 
 		 198 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1347  glutathione S-transferase domain-containing protein  38 
 
 		 205 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4489  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.18 
 
 		 208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0407  glutathione S-transferase  39.38 
 
 		 217 aa  115  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3851  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.68 
 
 		 214 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.216591  normal  0.461755 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3670  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.68 
 
 		 214 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4693  glutathione S-transferase-like  35.68 
 
 		 214 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1071  glutathione S-transferase  39.9 
 
 		 214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.292672  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2670  putative glutathione S-transferase  40.1 
 
 		 297 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2104  putative glutathione S-transferase  40.2 
 
 		 198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5005  Glutathione S-transferase domain  34.17 
 
 		 208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.286975  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2245  glutathione S-transferase-like  37 
 
 		 220 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.556118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3573  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.18 
 
 		 214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.242235  normal  0.0117224 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5417  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.18 
 
 		 214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3433  glutathione S-transferase family protein  34 
 
 		 214 aa  112  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000284771 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4952  Glutathione S-transferase domain  34.17 
 
 		 208 aa  112  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.246161 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2762  glutathione S-transferase-like  37.62 
 
 		 206 aa  112  4.0000000000000004e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1904  Glutathione S-transferase domain protein  36.45 
 
 		 199 aa  112  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1479  Glutathione S-transferase domain protein  36.98 
 
 		 208 aa  111  6e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00108267  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1576  glutathione S-transferase family protein  31.89 
 
 		 222 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1057  Glutathione S-transferase domain protein  35.18 
 
 		 203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0628244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5079  Glutathione S-transferase domain  33.83 
 
 		 213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.242731  hitchhiker  0.00740675 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49100  glutathione S-transferase  35.53 
 
 		 209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000404937 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4194  glutathione S-transferase  34.52 
 
 		 209 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8513  Glutathione S-transferase domain protein  34.65 
 
 		 205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700179  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4051  putative glutathione S-transferase  36 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.838028 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2696  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.89 
 
 		 222 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036581 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2266  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.17 
 
 		 230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2145  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.17 
 
 		 230 aa  109  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0715733  normal  0.478827 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6230  putative glutathione S-transferase  39.38 
 
 		 207 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0344917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1306  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.81 
 
 		 222 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2764  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.89 
 
 		 222 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1708  Glutathione S-transferase domain  34.65 
 
 		 199 aa  108  5e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2866  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.89 
 
 		 222 aa  108  5e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0201506 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>