More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3910 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3910  glutathione S-transferase-like  100 
 
 		 201 aa  408  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1311  glutathione S-transferase-like protein  82.56 
 
 		 196 aa  325  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.55458  normal  0.181696 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4794  Glutathione S-transferase domain  75.52 
 
 		 197 aa  304  7e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.915466  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1820  putative glutathione S-transferase  67.19 
 
 		 196 aa  271  4.0000000000000004e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1171  Glutathione S-transferase domain protein  63.02 
 
 		 204 aa  250  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245566  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0017  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.46 
 
 		 192 aa  244  4.9999999999999997e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3587  glutathione S-transferase domain-containing protein  59.9 
 
 		 203 aa  227  9e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0707812  hitchhiker  0.000377551 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2587  Glutathione S-transferase domain  60.53 
 
 		 195 aa  226  1e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.751074  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2312  glutathione S-transferase domain-containing protein  60.53 
 
 		 195 aa  227  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0196665 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2269  Glutathione S-transferase domain  60.73 
 
 		 195 aa  226  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1985  glutathione S-transferase  56.85 
 
 		 207 aa  223  1e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1821  glutathione S-transferase family protein  52.97 
 
 		 200 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0623474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43110  putative glutathione S-transferase  52.72 
 
 		 200 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000318488  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3617  putative glutathione S-transferase  52.72 
 
 		 200 aa  199  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003296  glutathione transferase  51.89 
 
 		 198 aa  198  5e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3890  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.89 
 
 		 200 aa  197  7e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.19285 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1399  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.89 
 
 		 200 aa  197  9e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3511  glutathione S-transferase-like protein  51.05 
 
 		 198 aa  194  6e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1429  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.89 
 
 		 200 aa  194  9e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114439  normal  0.299107 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04080  probable glutathione S-transferase  48.45 
 
 		 199 aa  193  1e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3211  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.89 
 
 		 198 aa  193  1e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3827  putative glutathione S-transferase  51.89 
 
 		 208 aa  192  4e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0196  glutathione S-transferase-like  49.74 
 
 		 204 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2670  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.57 
 
 		 200 aa  186  3e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.237361  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2032  glutathione S-transferase family protein  47.87 
 
 		 200 aa  184  8e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1842  glutathione S-transferase  48.11 
 
 		 200 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260742  normal  0.324274 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2139  glutathione S-transferase  44.5 
 
 		 203 aa  182  2.0000000000000003e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.041384 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0503  Glutathione S-transferase domain protein  42.29 
 
 		 208 aa  177  8e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0544052  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2495  putative glutathione S-transferase  43.78 
 
 		 204 aa  175  4e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00712937  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1471  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.45 
 
 		 200 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3893  glutathione S-transferase-like protein  44.09 
 
 		 210 aa  168  5e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3756  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.77 
 
 		 208 aa  164  9e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2296  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.09 
 
 		 204 aa  163  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.879102 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2641  Glutathione S-transferase domain  43.55 
 
 		 218 aa  160  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.213293 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0412  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.27 
 
 		 203 aa  160  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1387  Glutathione S-transferase domain protein  41.27 
 
 		 201 aa  158  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1493  glutathione S-transferase family protein  44.68 
 
 		 203 aa  158  5e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.695225  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1447  glutathione S-transferase family protein  44.68 
 
 		 203 aa  158  5e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277938  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04799  glutathione S-transferase  42.47 
 
 		 209 aa  157  1e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2738  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.32 
 
 		 216 aa  154  8e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1421  glutathione S-transferase domain protein  40.76 
 
 		 201 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1101  glutathione S-transferase-like  40.1 
 
 		 256 aa  149  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2981  glutathione S-transferase  38.61 
 
 		 216 aa  144  6e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.897939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1799  putative glutathione S-transferase (GST)  38.69 
 
 		 216 aa  141  7e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.602523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3927  glutathione S-transferase-like  38.19 
 
 		 228 aa  138  6e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1296  glutathione S-transferase-like protein  39.2 
 
 		 228 aa  138  7e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.041604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4124  glutathione S-transferase-like  38.69 
 
 		 217 aa  138  7e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.590461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4810  Glutathione S-transferase domain  39.2 
 
 		 217 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0134  Glutathione S-transferase domain protein  39.57 
 
 		 209 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5413  Glutathione S-transferase domain protein  36.41 
 
 		 207 aa  121  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3618  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.83 
 
 		 201 aa  120  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.822578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1180  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.5 
 
 		 207 aa  117  9e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.610567  normal  0.0747789 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4693  glutathione S-transferase-like  39.57 
 
 		 214 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3670  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.57 
 
 		 214 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3851  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.57 
 
 		 214 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.216591  normal  0.461755 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2439  glutathione S-transferase-like protein  39.57 
 
 		 214 aa  112  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.414826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5040  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.02 
 
 		 221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.367084 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2245  glutathione S-transferase-like  36.87 
 
 		 220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.556118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5079  Glutathione S-transferase domain  35.58 
 
 		 213 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.242731  hitchhiker  0.00740675 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0407  glutathione S-transferase  39.57 
 
 		 217 aa  107  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0107  glutathione S-transferase  39.04 
 
 		 214 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1267  glutathione S-transferase  39.04 
 
 		 214 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261228  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0125  glutathione S-transferase  39.04 
 
 		 266 aa  105  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2817  glutathione S-transferase  39.04 
 
 		 300 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1057  Glutathione S-transferase domain protein  36.56 
 
 		 203 aa  105  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0628244  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4962  Glutathione S-transferase domain protein  38.14 
 
 		 219 aa  104  7e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0910  Glutathione S-transferase domain  37.63 
 
 		 203 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5417  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.04 
 
 		 214 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3224  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.48 
 
 		 208 aa  104  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.395203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3573  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.04 
 
 		 214 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.242235  normal  0.0117224 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0645  glutathione S-transferase-like  36.71 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.722095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1071  glutathione S-transferase  38.5 
 
 		 214 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.292672  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1196  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.41 
 
 		 209 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2670  putative glutathione S-transferase  38.5 
 
 		 297 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1347  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.79 
 
 		 205 aa  102  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3947  Glutathione S-transferase domain protein  33.5 
 
 		 207 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4250  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 		 209 aa  101  7e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1162  glutathione S-transferase family protein  33.33 
 
 		 209 aa  101  8e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2762  glutathione S-transferase-like  35.71 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4489  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.86 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1904  Glutathione S-transferase domain protein  32 
 
 		 199 aa  99.8  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2547  glutathione S-transferase-like  32.63 
 
 		 203 aa  99.8  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.277247  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2104  putative glutathione S-transferase  37.88 
 
 		 198 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24830  putative glutathione S-transferase  38.54 
 
 		 198 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1775  glutathione S-transferase  34.69 
 
 		 208 aa  97.4  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000137039 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1128  glutathione S-transferase-like  34.76 
 
 		 206 aa  97.4  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0661  Glutathione S-transferase domain protein  36.17 
 
 		 203 aa  97.1  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8513  Glutathione S-transferase domain protein  34.92 
 
 		 205 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700179  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4952  Glutathione S-transferase domain  34.85 
 
 		 208 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.246161 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1887  Glutathione S-transferase domain protein  36.97 
 
 		 206 aa  95.9  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3092  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.53 
 
 		 205 aa  95.1  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.061874 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4686  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.82 
 
 		 205 aa  94.7  9e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4125  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.57 
 
 		 203 aa  92.8  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1106  Glutathione S-transferase domain  33.51 
 
 		 203 aa  92.4  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0925  putative glutathione S-transferase  34.76 
 
 		 203 aa  92.8  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.324873  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4359  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.85 
 
 		 222 aa  92.4  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0797  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.74 
 
 		 205 aa  92  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3433  glutathione S-transferase family protein  31.84 
 
 		 214 aa  91.7  7e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000284771 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5690  glutathione S-transferase-like protein  32.11 
 
 		 227 aa  91.3  8e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529075 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5005  Glutathione S-transferase domain  35.83 
 
 		 208 aa  91.3  9e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.286975  normal  0.574785 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>