More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0196 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0196  glutathione S-transferase-like  100 
 
 		 204 aa  424  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3211  glutathione S-transferase domain-containing protein  79.19 
 
 		 198 aa  333  1e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2495  putative glutathione S-transferase  68.69 
 
 		 204 aa  295  2e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00712937  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3827  putative glutathione S-transferase  64.97 
 
 		 208 aa  285  2.9999999999999996e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43110  putative glutathione S-transferase  61.73 
 
 		 200 aa  275  4e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000318488  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3617  putative glutathione S-transferase  61.22 
 
 		 200 aa  271  5.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0503  Glutathione S-transferase domain protein  61.22 
 
 		 208 aa  268  4e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0544052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2139  glutathione S-transferase  58.67 
 
 		 203 aa  266  2e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.041384 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1842  glutathione S-transferase  61.22 
 
 		 200 aa  259  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260742  normal  0.324274 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2032  glutathione S-transferase family protein  61.73 
 
 		 200 aa  259  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1821  glutathione S-transferase family protein  60.71 
 
 		 200 aa  256  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0623474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04080  probable glutathione S-transferase  59.8 
 
 		 199 aa  256  1e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1429  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.22 
 
 		 200 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114439  normal  0.299107 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1399  glutathione S-transferase domain-containing protein  60.2 
 
 		 200 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3890  glutathione S-transferase domain-containing protein  60.2 
 
 		 200 aa  255  3e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.19285 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3511  glutathione S-transferase-like protein  59.9 
 
 		 198 aa  254  6e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2670  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.65 
 
 		 200 aa  242  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.237361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003296  glutathione transferase  56.35 
 
 		 198 aa  241  5e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1471  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.14 
 
 		 200 aa  231  6e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2587  Glutathione S-transferase domain  55.03 
 
 		 195 aa  207  9e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.751074  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2312  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.03 
 
 		 195 aa  207  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0196665 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2269  Glutathione S-transferase domain  54.26 
 
 		 195 aa  204  9e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4794  Glutathione S-transferase domain  51.05 
 
 		 197 aa  204  9e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.915466  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3893  glutathione S-transferase-like protein  47.21 
 
 		 210 aa  196  3e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04799  glutathione S-transferase  43.5 
 
 		 209 aa  193  1e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1311  glutathione S-transferase-like protein  48.15 
 
 		 196 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.55458  normal  0.181696 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2296  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.74 
 
 		 204 aa  191  6e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.879102 
 
 
-
 
NC_004310  BR1493  glutathione S-transferase family protein  49.01 
 
 		 203 aa  190  1e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.695225  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1447  glutathione S-transferase family protein  49.01 
 
 		 203 aa  190  1e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277938  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3910  glutathione S-transferase-like  49.74 
 
 		 201 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0017  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.47 
 
 		 192 aa  187  9e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1421  glutathione S-transferase domain protein  44.67 
 
 		 201 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1387  Glutathione S-transferase domain protein  45.77 
 
 		 201 aa  185  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1820  putative glutathione S-transferase  47.62 
 
 		 196 aa  185  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1985  glutathione S-transferase  45.1 
 
 		 207 aa  184  9e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3587  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.64 
 
 		 203 aa  180  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0707812  hitchhiker  0.000377551 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2641  Glutathione S-transferase domain  43.72 
 
 		 218 aa  179  2.9999999999999997e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.213293 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1171  Glutathione S-transferase domain protein  44.92 
 
 		 204 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245566  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0412  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.4 
 
 		 203 aa  169  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1799  putative glutathione S-transferase (GST)  42.42 
 
 		 216 aa  167  8e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.602523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3927  glutathione S-transferase-like  45.37 
 
 		 228 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2738  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.22 
 
 		 216 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3756  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.52 
 
 		 208 aa  163  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2981  glutathione S-transferase  43.78 
 
 		 216 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.897939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4810  Glutathione S-transferase domain  44.44 
 
 		 217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1296  glutathione S-transferase-like protein  43.63 
 
 		 228 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.041604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1101  glutathione S-transferase-like  43.28 
 
 		 256 aa  160  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4124  glutathione S-transferase-like  41.92 
 
 		 217 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.590461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3618  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.2 
 
 		 201 aa  142  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.822578  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0134  Glutathione S-transferase domain protein  41.99 
 
 		 209 aa  137  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3323  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.6 
 
 		 227 aa  130  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0187385  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5040  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.78 
 
 		 221 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.367084 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5413  Glutathione S-transferase domain protein  31.86 
 
 		 207 aa  127  8.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5417  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.8 
 
 		 214 aa  125  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3573  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.8 
 
 		 214 aa  125  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.242235  normal  0.0117224 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2762  glutathione S-transferase-like  38.38 
 
 		 206 aa  124  7e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1180  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.44 
 
 		 207 aa  124  9e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.610567  normal  0.0747789 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4489  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.07 
 
 		 208 aa  124  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2547  glutathione S-transferase-like  36.87 
 
 		 203 aa  124  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.277247  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0661  Glutathione S-transferase domain protein  39.6 
 
 		 203 aa  123  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2439  glutathione S-transferase-like protein  35.29 
 
 		 214 aa  122  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.414826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3851  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.29 
 
 		 214 aa  121  8e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.216591  normal  0.461755 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5079  Glutathione S-transferase domain  35.44 
 
 		 213 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.242731  hitchhiker  0.00740675 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4125  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.13 
 
 		 203 aa  120  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3670  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.29 
 
 		 214 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4693  glutathione S-transferase-like  35.29 
 
 		 214 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3092  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.05 
 
 		 205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.061874 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3224  glutathione S-transferase domain-containing protein  37 
 
 		 208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.395203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4952  Glutathione S-transferase domain  35.61 
 
 		 208 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.246161 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0910  Glutathione S-transferase domain  35.58 
 
 		 203 aa  119  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5005  Glutathione S-transferase domain  35.12 
 
 		 208 aa  119  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.286975  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4686  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.12 
 
 		 205 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1162  glutathione S-transferase family protein  35.64 
 
 		 209 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4250  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.15 
 
 		 209 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1057  Glutathione S-transferase domain protein  35.1 
 
 		 203 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0628244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1196  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.64 
 
 		 209 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0125  glutathione S-transferase  35.78 
 
 		 266 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0107  glutathione S-transferase  35.78 
 
 		 214 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1267  glutathione S-transferase  35.78 
 
 		 214 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261228  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2245  glutathione S-transferase-like  36.1 
 
 		 220 aa  115  6e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.556118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5690  glutathione S-transferase-like protein  39.3 
 
 		 227 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529075 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1071  glutathione S-transferase  35.29 
 
 		 214 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.292672  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2670  putative glutathione S-transferase  35.29 
 
 		 297 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2817  glutathione S-transferase  35.29 
 
 		 300 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0407  glutathione S-transferase  35.12 
 
 		 217 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1347  glutathione S-transferase domain-containing protein  37 
 
 		 205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4962  Glutathione S-transferase domain protein  35.96 
 
 		 219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3325  glutathione S-transferase domain-containing protein  37 
 
 		 205 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0925  putative glutathione S-transferase  36.87 
 
 		 203 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.324873  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0645  glutathione S-transferase-like  36.14 
 
 		 225 aa  111  8.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.722095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1106  Glutathione S-transferase domain  35.61 
 
 		 203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5568  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.5 
 
 		 205 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0462  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.1 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.269396 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6230  putative glutathione S-transferase  36.27 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0344917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1708  Glutathione S-transferase domain  34.47 
 
 		 199 aa  106  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8513  Glutathione S-transferase domain protein  34.83 
 
 		 205 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700179  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3433  glutathione S-transferase family protein  32.18 
 
 		 214 aa  105  6e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000284771 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2104  putative glutathione S-transferase  36.32 
 
 		 198 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3947  Glutathione S-transferase domain protein  32.5 
 
 		 207 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1904  Glutathione S-transferase domain protein  34 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142458  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>