More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003296 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_003296  glutathione transferase  100 
 
 
198 aa  413  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3511  glutathione S-transferase-like protein  60.91 
 
 
198 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2139  glutathione S-transferase  57.95 
 
 
203 aa  247  8e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.041384 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3211  glutathione S-transferase domain-containing protein  59.39 
 
 
198 aa  246  1e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0503  Glutathione S-transferase domain protein  56.92 
 
 
208 aa  245  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0544052  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0196  glutathione S-transferase-like  56.35 
 
 
204 aa  241  3.9999999999999997e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3617  putative glutathione S-transferase  56.92 
 
 
200 aa  237  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2032  glutathione S-transferase family protein  56.92 
 
 
200 aa  236  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2495  putative glutathione S-transferase  56.41 
 
 
204 aa  233  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00712937  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1399  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.9 
 
 
200 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250488  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43110  putative glutathione S-transferase  56.92 
 
 
200 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000318488  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1821  glutathione S-transferase family protein  55.9 
 
 
200 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0623474  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04080  probable glutathione S-transferase  53.81 
 
 
199 aa  232  2.0000000000000002e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1842  glutathione S-transferase  54.87 
 
 
200 aa  232  3e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260742  normal  0.324274 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3890  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.38 
 
 
200 aa  232  3e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.19285 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3827  putative glutathione S-transferase  53.85 
 
 
208 aa  228  6e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1471  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.35 
 
 
200 aa  227  7e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1429  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.36 
 
 
200 aa  227  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114439  normal  0.299107 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2670  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.87 
 
 
200 aa  225  4e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.237361  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2269  Glutathione S-transferase domain  52.6 
 
 
195 aa  209  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.333911  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2312  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.94 
 
 
195 aa  209  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0196665 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2587  Glutathione S-transferase domain  52.94 
 
 
195 aa  209  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.751074  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0017  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.33 
 
 
192 aa  206  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268724  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1311  glutathione S-transferase-like protein  49.74 
 
 
196 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.55458  normal  0.181696 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3910  glutathione S-transferase-like  51.89 
 
 
201 aa  198  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1985  glutathione S-transferase  47.31 
 
 
207 aa  197  1.0000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4794  Glutathione S-transferase domain  49.73 
 
 
197 aa  193  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.915466  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2641  Glutathione S-transferase domain  46.19 
 
 
218 aa  194  1e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.213293 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1820  putative glutathione S-transferase  47.85 
 
 
196 aa  192  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04799  glutathione S-transferase  46.19 
 
 
209 aa  191  6e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1493  glutathione S-transferase family protein  47.47 
 
 
203 aa  188  4e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.695225  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1447  glutathione S-transferase family protein  47.47 
 
 
203 aa  188  4e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277938  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3587  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.28 
 
 
203 aa  187  7e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0707812  hitchhiker  0.000377551 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2296  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.46 
 
 
204 aa  187  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.879102 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1171  Glutathione S-transferase domain protein  45.95 
 
 
204 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245566  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3893  glutathione S-transferase-like protein  47.18 
 
 
210 aa  181  6e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1421  glutathione S-transferase domain protein  44.62 
 
 
201 aa  175  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1387  Glutathione S-transferase domain protein  44.9 
 
 
201 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0412  glutathione S-transferase domain-containing protein  45 
 
 
203 aa  172  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3756  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.52 
 
 
208 aa  171  5.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2738  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.41 
 
 
216 aa  167  8e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1101  glutathione S-transferase-like  39.2 
 
 
256 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1799  putative glutathione S-transferase (GST)  37.69 
 
 
216 aa  149  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.602523  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1296  glutathione S-transferase-like protein  38.69 
 
 
228 aa  147  8e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.041604  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4124  glutathione S-transferase-like  38.69 
 
 
217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.590461  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0134  Glutathione S-transferase domain protein  42.93 
 
 
209 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3927  glutathione S-transferase-like  38.19 
 
 
228 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2981  glutathione S-transferase  37.19 
 
 
216 aa  144  7.0000000000000006e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.897939  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3618  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.5 
 
 
201 aa  142  4e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.822578  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4810  Glutathione S-transferase domain  37.19 
 
 
217 aa  140  9e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5413  Glutathione S-transferase domain protein  34.52 
 
 
207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0407  glutathione S-transferase  35.75 
 
 
217 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4125  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.13 
 
 
203 aa  116  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24830  putative glutathione S-transferase  37.11 
 
 
198 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0107  glutathione S-transferase  35.23 
 
 
214 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1267  glutathione S-transferase  35.23 
 
 
214 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261228  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0125  glutathione S-transferase  35.23 
 
 
266 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3224  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.86 
 
 
208 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.395203  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3573  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 
214 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.242235  normal  0.0117224 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2670  putative glutathione S-transferase  34.72 
 
 
297 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1071  glutathione S-transferase  34.72 
 
 
214 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.292672  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2439  glutathione S-transferase-like protein  33.84 
 
 
214 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.414826  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2817  glutathione S-transferase  34.72 
 
 
300 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2547  glutathione S-transferase-like  32.81 
 
 
203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.277247  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5417  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 
214 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556283  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0661  Glutathione S-transferase domain protein  35.32 
 
 
203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1180  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.67 
 
 
207 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.610567  normal  0.0747789 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3851  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.84 
 
 
214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.216591  normal  0.461755 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4693  glutathione S-transferase-like  33.33 
 
 
214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3670  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 
214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630105  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0925  putative glutathione S-transferase  34.03 
 
 
203 aa  109  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.324873  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3323  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.21 
 
 
227 aa  108  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0187385  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5040  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 
221 aa  108  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.367084 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2104  putative glutathione S-transferase  36.6 
 
 
198 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3092  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.67 
 
 
205 aa  107  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.061874 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2696  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.67 
 
 
222 aa  107  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036581 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2764  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.67 
 
 
222 aa  107  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0910  Glutathione S-transferase domain  33 
 
 
203 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2866  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.11 
 
 
222 aa  106  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0201506 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1416  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.11 
 
 
222 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1393  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.11 
 
 
222 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2762  glutathione S-transferase-like  33.84 
 
 
206 aa  105  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2966  Glutathione S-transferase domain protein  31.11 
 
 
222 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.183097  normal  0.112262 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1576  glutathione S-transferase family protein  31.11 
 
 
222 aa  105  5e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4962  Glutathione S-transferase domain protein  32.34 
 
 
219 aa  105  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1057  Glutathione S-transferase domain protein  32.5 
 
 
203 aa  105  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0628244  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4250  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.82 
 
 
209 aa  104  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1377  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.11 
 
 
222 aa  104  9e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.682685  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0645  glutathione S-transferase-like  33.85 
 
 
225 aa  103  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.722095  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1196  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.32 
 
 
209 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1306  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.56 
 
 
222 aa  103  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4489  glutathione S-transferase domain-containing protein  30 
 
 
208 aa  102  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1347  glutathione S-transferase domain-containing protein  33 
 
 
205 aa  102  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4952  Glutathione S-transferase domain  29.5 
 
 
208 aa  102  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.246161 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1162  glutathione S-transferase family protein  31.82 
 
 
209 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4686  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.83 
 
 
205 aa  101  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0797  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.31 
 
 
205 aa  100  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0528  putative glutathione S-transferase  29.32 
 
 
222 aa  100  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2245  glutathione S-transferase-like  31.79 
 
 
220 aa  100  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.556118  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5568  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.2 
 
 
205 aa  99.8  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446565  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>