More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3827 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3827  putative glutathione S-transferase  100 
 
 		 208 aa  434  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0503  Glutathione S-transferase domain protein  67.5 
 
 		 208 aa  285  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0544052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0196  glutathione S-transferase-like  64.97 
 
 		 204 aa  285  4e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2139  glutathione S-transferase  65.15 
 
 		 203 aa  283  1.0000000000000001e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.041384 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3211  glutathione S-transferase domain-containing protein  66.5 
 
 		 198 aa  281  4.0000000000000003e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2495  putative glutathione S-transferase  63.64 
 
 		 204 aa  270  1e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00712937  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1842  glutathione S-transferase  60.61 
 
 		 200 aa  259  3e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260742  normal  0.324274 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2032  glutathione S-transferase family protein  60.1 
 
 		 200 aa  256  2e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1429  glutathione S-transferase domain-containing protein  60.1 
 
 		 200 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114439  normal  0.299107 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43110  putative glutathione S-transferase  58.59 
 
 		 200 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000318488  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3617  putative glutathione S-transferase  58.08 
 
 		 200 aa  250  1e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1821  glutathione S-transferase family protein  58.59 
 
 		 200 aa  248  4e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0623474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3890  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.08 
 
 		 200 aa  247  9e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.19285 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04080  probable glutathione S-transferase  58.08 
 
 		 199 aa  247  1e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1399  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.58 
 
 		 200 aa  245  3e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2670  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.07 
 
 		 200 aa  242  3e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.237361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3511  glutathione S-transferase-like protein  56.85 
 
 		 198 aa  236  1e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003296  glutathione transferase  53.85 
 
 		 198 aa  228  7e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1471  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.28 
 
 		 200 aa  223  2e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2296  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.76 
 
 		 204 aa  201  5e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.879102 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4794  Glutathione S-transferase domain  49.25 
 
 		 197 aa  198  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.915466  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1311  glutathione S-transferase-like protein  50.79 
 
 		 196 aa  198  6e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.55458  normal  0.181696 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04799  glutathione S-transferase  49.75 
 
 		 209 aa  195  4.0000000000000005e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3910  glutathione S-transferase-like  51.89 
 
 		 201 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2587  Glutathione S-transferase domain  49.21 
 
 		 195 aa  189  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.751074  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2312  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.44 
 
 		 195 aa  188  4e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0196665 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0017  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.21 
 
 		 192 aa  187  8e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2641  Glutathione S-transferase domain  49.24 
 
 		 218 aa  187  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.213293 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1387  Glutathione S-transferase domain protein  47.18 
 
 		 201 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3893  glutathione S-transferase-like protein  47.72 
 
 		 210 aa  186  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3587  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.53 
 
 		 203 aa  184  6e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0707812  hitchhiker  0.000377551 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1985  glutathione S-transferase  48.17 
 
 		 207 aa  184  1.0000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1421  glutathione S-transferase domain protein  46.15 
 
 		 201 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2269  Glutathione S-transferase domain  46.84 
 
 		 195 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1820  putative glutathione S-transferase  47.62 
 
 		 196 aa  180  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1493  glutathione S-transferase family protein  48.98 
 
 		 203 aa  178  4.999999999999999e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.695225  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1447  glutathione S-transferase family protein  48.98 
 
 		 203 aa  178  4.999999999999999e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277938  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1171  Glutathione S-transferase domain protein  47.06 
 
 		 204 aa  174  9e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245566  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2738  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.5 
 
 		 216 aa  170  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3756  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.57 
 
 		 208 aa  167  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2981  glutathione S-transferase  41.58 
 
 		 216 aa  160  9e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.897939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4810  Glutathione S-transferase domain  44.55 
 
 		 217 aa  157  8e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1799  putative glutathione S-transferase (GST)  41.79 
 
 		 216 aa  157  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.602523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3927  glutathione S-transferase-like  43.56 
 
 		 228 aa  156  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1101  glutathione S-transferase-like  42.57 
 
 		 256 aa  154  6e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4124  glutathione S-transferase-like  42.57 
 
 		 217 aa  154  9e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.590461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0412  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.88 
 
 		 203 aa  153  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1296  glutathione S-transferase-like protein  41.58 
 
 		 228 aa  147  9e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.041604  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5413  Glutathione S-transferase domain protein  39.58 
 
 		 207 aa  144  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2547  glutathione S-transferase-like  38.89 
 
 		 203 aa  140  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.277247  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3618  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.41 
 
 		 201 aa  134  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.822578  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0134  Glutathione S-transferase domain protein  38.95 
 
 		 209 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5040  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.14 
 
 		 221 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.367084 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2439  glutathione S-transferase-like protein  37 
 
 		 214 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.414826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5079  Glutathione S-transferase domain  36.14 
 
 		 213 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.242731  hitchhiker  0.00740675 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3092  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.89 
 
 		 205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.061874 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3851  glutathione S-transferase domain-containing protein  36 
 
 		 214 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.216591  normal  0.461755 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4693  glutathione S-transferase-like  36 
 
 		 214 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3670  glutathione S-transferase domain-containing protein  36 
 
 		 214 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630105  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4962  Glutathione S-transferase domain protein  35.64 
 
 		 219 aa  111  9e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1708  Glutathione S-transferase domain  35.32 
 
 		 199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1180  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.82 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.610567  normal  0.0747789 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3573  glutathione S-transferase domain-containing protein  36 
 
 		 214 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.242235  normal  0.0117224 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5417  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.5 
 
 		 214 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1071  glutathione S-transferase  37.44 
 
 		 214 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.292672  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0407  glutathione S-transferase  37.31 
 
 		 217 aa  105  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2817  glutathione S-transferase  37.44 
 
 		 300 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0661  Glutathione S-transferase domain protein  35.82 
 
 		 203 aa  105  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4125  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.29 
 
 		 203 aa  105  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2670  putative glutathione S-transferase  37.44 
 
 		 297 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0107  glutathione S-transferase  37.44 
 
 		 214 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1267  glutathione S-transferase  37.44 
 
 		 214 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261228  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0125  glutathione S-transferase  37.44 
 
 		 266 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1196  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.17 
 
 		 209 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2245  glutathione S-transferase-like  35.15 
 
 		 220 aa  103  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.556118  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1162  glutathione S-transferase family protein  32.68 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2762  glutathione S-transferase-like  34.87 
 
 		 206 aa  102  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0645  glutathione S-transferase-like  34.65 
 
 		 225 aa  103  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.722095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5568  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.84 
 
 		 205 aa  102  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4686  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 		 205 aa  102  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3433  glutathione S-transferase family protein  31.53 
 
 		 214 aa  102  6e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000284771 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6230  putative glutathione S-transferase  34.95 
 
 		 207 aa  101  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0344917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0925  putative glutathione S-transferase  33.66 
 
 		 203 aa  101  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.324873  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4250  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.2 
 
 		 209 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0910  Glutathione S-transferase domain  34.3 
 
 		 203 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1057  Glutathione S-transferase domain protein  32.85 
 
 		 203 aa  99  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0628244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1049  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.99 
 
 		 230 aa  98.6  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104834  normal  0.267684 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1347  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.17 
 
 		 205 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3224  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.37 
 
 		 208 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.395203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8513  Glutathione S-transferase domain protein  33.33 
 
 		 205 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700179  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4489  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.5 
 
 		 208 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24830  putative glutathione S-transferase  34.69 
 
 		 198 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3323  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.67 
 
 		 227 aa  95.1  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0187385  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2104  putative glutathione S-transferase  33.66 
 
 		 198 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5690  glutathione S-transferase-like protein  31.55 
 
 		 227 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529075 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0974  Glutathione S-transferase domain protein  32.66 
 
 		 209 aa  92.8  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3325  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.66 
 
 		 205 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4952  Glutathione S-transferase domain  32 
 
 		 208 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.246161 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1904  Glutathione S-transferase domain protein  30.58 
 
 		 199 aa  92.4  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3947  Glutathione S-transferase domain protein  30.95 
 
 		 207 aa  92  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>