More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1821 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_1821  glutathione S-transferase family protein  100 
 
 
200 aa  414  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0623474  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1399  glutathione S-transferase domain-containing protein  99 
 
 
200 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250488  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3890  glutathione S-transferase domain-containing protein  98.5 
 
 
200 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.19285 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1429  glutathione S-transferase domain-containing protein  92 
 
 
200 aa  387  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114439  normal  0.299107 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2670  glutathione S-transferase domain-containing protein  78 
 
 
200 aa  333  1e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.237361  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1842  glutathione S-transferase  75.38 
 
 
200 aa  322  2e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260742  normal  0.324274 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3617  putative glutathione S-transferase  74.87 
 
 
200 aa  318  3e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43110  putative glutathione S-transferase  74.87 
 
 
200 aa  318  3e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000318488  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2032  glutathione S-transferase family protein  73.37 
 
 
200 aa  314  6e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3211  glutathione S-transferase domain-containing protein  65.99 
 
 
198 aa  274  6e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3511  glutathione S-transferase-like protein  61.22 
 
 
198 aa  257  6e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0196  glutathione S-transferase-like  60.71 
 
 
204 aa  256  1e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2495  putative glutathione S-transferase  58.67 
 
 
204 aa  255  3e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00712937  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04080  probable glutathione S-transferase  57.65 
 
 
199 aa  253  1.0000000000000001e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2139  glutathione S-transferase  58.79 
 
 
203 aa  252  3e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.041384 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3827  putative glutathione S-transferase  58.59 
 
 
208 aa  248  4e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0503  Glutathione S-transferase domain protein  56.78 
 
 
208 aa  241  7e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0544052  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003296  glutathione transferase  55.9 
 
 
198 aa  233  2.0000000000000002e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1471  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.67 
 
 
200 aa  229  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2296  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.84 
 
 
204 aa  220  9e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.879102 
 
 
-
 
NC_004310  BR1493  glutathione S-transferase family protein  54.27 
 
 
203 aa  212  1.9999999999999998e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.695225  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1447  glutathione S-transferase family protein  54.27 
 
 
203 aa  212  1.9999999999999998e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277938  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3893  glutathione S-transferase-like protein  53.68 
 
 
210 aa  211  3.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2269  Glutathione S-transferase domain  55.56 
 
 
195 aa  209  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.333911  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4794  Glutathione S-transferase domain  52.38 
 
 
197 aa  207  7e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.915466  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2738  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.1 
 
 
216 aa  206  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2587  Glutathione S-transferase domain  53.93 
 
 
195 aa  205  3e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.751074  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1985  glutathione S-transferase  51.85 
 
 
207 aa  205  3e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2312  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.12 
 
 
195 aa  204  1e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0196665 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2641  Glutathione S-transferase domain  50.51 
 
 
218 aa  202  3e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.213293 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1387  Glutathione S-transferase domain protein  48.99 
 
 
201 aa  201  5e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04799  glutathione S-transferase  50.77 
 
 
209 aa  201  6e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3587  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.48 
 
 
203 aa  200  9e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0707812  hitchhiker  0.000377551 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1421  glutathione S-transferase domain protein  48.48 
 
 
201 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3910  glutathione S-transferase-like  52.97 
 
 
201 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1311  glutathione S-transferase-like protein  49.75 
 
 
196 aa  194  9e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.55458  normal  0.181696 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0017  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.8 
 
 
192 aa  191  6e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268724  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1171  Glutathione S-transferase domain protein  50.8 
 
 
204 aa  188  5e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245566  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2981  glutathione S-transferase  47.26 
 
 
216 aa  186  2e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.897939  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1101  glutathione S-transferase-like  48.26 
 
 
256 aa  185  3e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1820  putative glutathione S-transferase  48.91 
 
 
196 aa  184  6e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1296  glutathione S-transferase-like protein  48.74 
 
 
228 aa  182  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.041604  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4810  Glutathione S-transferase domain  49.25 
 
 
217 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3927  glutathione S-transferase-like  47.74 
 
 
228 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4124  glutathione S-transferase-like  48.24 
 
 
217 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.590461  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1799  putative glutathione S-transferase (GST)  46.23 
 
 
216 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.602523  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3756  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.64 
 
 
208 aa  176  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0412  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.97 
 
 
203 aa  155  4e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0134  Glutathione S-transferase domain protein  44.04 
 
 
209 aa  147  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5413  Glutathione S-transferase domain protein  39.7 
 
 
207 aa  147  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2547  glutathione S-transferase-like  40.2 
 
 
203 aa  145  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.277247  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3618  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.82 
 
 
201 aa  137  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.822578  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1180  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.22 
 
 
207 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.610567  normal  0.0747789 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5040  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.19 
 
 
221 aa  124  9e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.367084 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0645  glutathione S-transferase-like  38.61 
 
 
225 aa  124  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.722095  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1162  glutathione S-transferase family protein  37.81 
 
 
209 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1087  glutathione S-transferase family protein  35.14 
 
 
222 aa  122  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.983271 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3224  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.2 
 
 
208 aa  122  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.395203  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1196  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.81 
 
 
209 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4250  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.81 
 
 
209 aa  121  6e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2439  glutathione S-transferase-like protein  36.68 
 
 
214 aa  121  7e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.414826  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24830  putative glutathione S-transferase  41.33 
 
 
198 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4962  Glutathione S-transferase domain protein  39.41 
 
 
219 aa  119  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3851  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.68 
 
 
214 aa  118  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.216591  normal  0.461755 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3670  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.68 
 
 
214 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630105  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4693  glutathione S-transferase-like  36.68 
 
 
214 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0125  glutathione S-transferase  41.12 
 
 
266 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0107  glutathione S-transferase  41.12 
 
 
214 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4489  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.68 
 
 
208 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0407  glutathione S-transferase  39.9 
 
 
217 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1267  glutathione S-transferase  41.12 
 
 
214 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261228  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1347  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.31 
 
 
205 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2104  putative glutathione S-transferase  41.18 
 
 
198 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5417  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.19 
 
 
214 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556283  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2817  glutathione S-transferase  40.61 
 
 
300 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3573  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.19 
 
 
214 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.242235  normal  0.0117224 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5005  Glutathione S-transferase domain  34.67 
 
 
208 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.286975  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2245  glutathione S-transferase-like  37.5 
 
 
220 aa  114  7.999999999999999e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.556118  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49100  glutathione S-transferase  36.55 
 
 
209 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000404937 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4194  glutathione S-transferase  35.53 
 
 
209 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4952  Glutathione S-transferase domain  34.67 
 
 
208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.246161 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2762  glutathione S-transferase-like  38.12 
 
 
206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3433  glutathione S-transferase family protein  34.5 
 
 
214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000284771 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5079  Glutathione S-transferase domain  34.83 
 
 
213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.242731  hitchhiker  0.00740675 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1576  glutathione S-transferase family protein  32.43 
 
 
222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1904  Glutathione S-transferase domain protein  36.95 
 
 
199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142458  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1071  glutathione S-transferase  40.1 
 
 
214 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.292672  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2670  putative glutathione S-transferase  40.1 
 
 
297 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5690  glutathione S-transferase-like protein  37.69 
 
 
227 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.529075 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2696  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.43 
 
 
222 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036581 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1057  Glutathione S-transferase domain protein  35.68 
 
 
203 aa  111  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0628244  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1479  Glutathione S-transferase domain protein  37.5 
 
 
208 aa  112  5e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00108267  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8513  Glutathione S-transferase domain protein  34.8 
 
 
205 aa  112  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700179  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1306  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.35 
 
 
222 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2866  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.43 
 
 
222 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0201506 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4925  Glutathione S-transferase domain protein  33.33 
 
 
223 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18954  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2764  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.43 
 
 
222 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2966  Glutathione S-transferase domain protein  31.35 
 
 
222 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.183097  normal  0.112262 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1393  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.35 
 
 
222 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1416  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.35 
 
 
222 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>