More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3211 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3211  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 		 198 aa  410  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0196  glutathione S-transferase-like  79.19 
 
 		 204 aa  333  1e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2495  putative glutathione S-transferase  71.57 
 
 		 204 aa  304  4.0000000000000004e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00712937  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43110  putative glutathione S-transferase  66.84 
 
 		 200 aa  284  5e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000318488  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3827  putative glutathione S-transferase  66.5 
 
 		 208 aa  281  3.0000000000000004e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3617  putative glutathione S-transferase  65.82 
 
 		 200 aa  280  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1821  glutathione S-transferase family protein  65.99 
 
 		 200 aa  274  5e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0623474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1399  glutathione S-transferase domain-containing protein  65.48 
 
 		 200 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1429  glutathione S-transferase domain-containing protein  65.99 
 
 		 200 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114439  normal  0.299107 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3890  glutathione S-transferase domain-containing protein  64.97 
 
 		 200 aa  271  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.19285 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2139  glutathione S-transferase  60.41 
 
 		 203 aa  262  2e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.041384 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2670  glutathione S-transferase domain-containing protein  62.24 
 
 		 200 aa  262  3e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.237361  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2032  glutathione S-transferase family protein  61.73 
 
 		 200 aa  261  6e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1842  glutathione S-transferase  61.73 
 
 		 200 aa  260  8e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260742  normal  0.324274 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04080  probable glutathione S-transferase  59.39 
 
 		 199 aa  259  2e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0503  Glutathione S-transferase domain protein  60.41 
 
 		 208 aa  258  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0544052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3511  glutathione S-transferase-like protein  62.63 
 
 		 198 aa  255  3e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003296  glutathione transferase  59.39 
 
 		 198 aa  246  1e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1471  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.86 
 
 		 200 aa  240  1e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3893  glutathione S-transferase-like protein  51.52 
 
 		 210 aa  214  7e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2312  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.21 
 
 		 195 aa  211  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0196665 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2587  Glutathione S-transferase domain  54.97 
 
 		 195 aa  209  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.751074  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2269  Glutathione S-transferase domain  54.5 
 
 		 195 aa  208  4e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2296  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.01 
 
 		 204 aa  202  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.879102 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4794  Glutathione S-transferase domain  51.58 
 
 		 197 aa  201  8e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.915466  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04799  glutathione S-transferase  47.72 
 
 		 209 aa  199  3e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1493  glutathione S-transferase family protein  50.99 
 
 		 203 aa  197  6e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.695225  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1447  glutathione S-transferase family protein  50.99 
 
 		 203 aa  197  6e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277938  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1421  glutathione S-transferase domain protein  48.47 
 
 		 201 aa  196  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1387  Glutathione S-transferase domain protein  48.47 
 
 		 201 aa  195  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1311  glutathione S-transferase-like protein  49.73 
 
 		 196 aa  194  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.55458  normal  0.181696 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3910  glutathione S-transferase-like  51.89 
 
 		 201 aa  193  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2641  Glutathione S-transferase domain  46.19 
 
 		 218 aa  192  4e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.213293 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0017  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.26 
 
 		 192 aa  189  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1171  Glutathione S-transferase domain protein  48.66 
 
 		 204 aa  189  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245566  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1985  glutathione S-transferase  48.4 
 
 		 207 aa  187  7e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3587  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.79 
 
 		 203 aa  186  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0707812  hitchhiker  0.000377551 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1820  putative glutathione S-transferase  49.19 
 
 		 196 aa  184  6e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2738  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.25 
 
 		 216 aa  182  4.0000000000000006e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4124  glutathione S-transferase-like  48.22 
 
 		 217 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.590461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1799  putative glutathione S-transferase (GST)  46.19 
 
 		 216 aa  176  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.602523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1296  glutathione S-transferase-like protein  46.7 
 
 		 228 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.041604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4810  Glutathione S-transferase domain  46.7 
 
 		 217 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3927  glutathione S-transferase-like  46.7 
 
 		 228 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3756  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.18 
 
 		 208 aa  172  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0412  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.77 
 
 		 203 aa  171  7.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1101  glutathione S-transferase-like  44.67 
 
 		 256 aa  168  6e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2981  glutathione S-transferase  43.15 
 
 		 216 aa  167  1e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.897939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3618  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.5 
 
 		 201 aa  142  4e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.822578  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0134  Glutathione S-transferase domain protein  42.49 
 
 		 209 aa  141  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2547  glutathione S-transferase-like  37.31 
 
 		 203 aa  128  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.277247  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0661  Glutathione S-transferase domain protein  41.09 
 
 		 203 aa  128  6e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5413  Glutathione S-transferase domain protein  35.03 
 
 		 207 aa  127  8.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5040  glutathione S-transferase domain-containing protein  36 
 
 		 221 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.367084 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3323  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.42 
 
 		 227 aa  125  5e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0187385  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3573  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.5 
 
 		 214 aa  124  7e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.242235  normal  0.0117224 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5417  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.5 
 
 		 214 aa  124  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2439  glutathione S-transferase-like protein  36.5 
 
 		 214 aa  123  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.414826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3851  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.5 
 
 		 214 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.216591  normal  0.461755 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1180  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.45 
 
 		 207 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.610567  normal  0.0747789 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4686  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.61 
 
 		 205 aa  123  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4693  glutathione S-transferase-like  36.5 
 
 		 214 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3670  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.5 
 
 		 214 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3224  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.5 
 
 		 208 aa  122  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.395203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5079  Glutathione S-transferase domain  35.64 
 
 		 213 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.242731  hitchhiker  0.00740675 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4125  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.11 
 
 		 203 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3092  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.9 
 
 		 205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.061874 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4489  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.64 
 
 		 208 aa  119  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5005  Glutathione S-transferase domain  35.5 
 
 		 208 aa  118  6e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.286975  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4962  Glutathione S-transferase domain protein  36.63 
 
 		 219 aa  117  7.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1057  Glutathione S-transferase domain protein  34.31 
 
 		 203 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0628244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0910  Glutathione S-transferase domain  36.5 
 
 		 203 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2762  glutathione S-transferase-like  37.7 
 
 		 206 aa  116  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24830  putative glutathione S-transferase  40.59 
 
 		 198 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1347  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.44 
 
 		 205 aa  115  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0107  glutathione S-transferase  37.81 
 
 		 214 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0125  glutathione S-transferase  37.81 
 
 		 266 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1267  glutathione S-transferase  37.81 
 
 		 214 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261228  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4952  Glutathione S-transferase domain  34.16 
 
 		 208 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.246161 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1071  glutathione S-transferase  37.31 
 
 		 214 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.292672  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2670  putative glutathione S-transferase  37.31 
 
 		 297 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2817  glutathione S-transferase  37.31 
 
 		 300 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1162  glutathione S-transferase family protein  33.66 
 
 		 209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3325  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.59 
 
 		 205 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2104  putative glutathione S-transferase  39.3 
 
 		 198 aa  111  6e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3947  Glutathione S-transferase domain protein  35.82 
 
 		 207 aa  111  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1196  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.17 
 
 		 209 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0407  glutathione S-transferase  36.5 
 
 		 217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3433  glutathione S-transferase family protein  34.33 
 
 		 214 aa  109  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000284771 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4250  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.67 
 
 		 209 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0645  glutathione S-transferase-like  36.14 
 
 		 225 aa  108  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.722095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1106  Glutathione S-transferase domain  35.5 
 
 		 203 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5690  glutathione S-transferase-like protein  35.5 
 
 		 227 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529075 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0925  putative glutathione S-transferase  34.85 
 
 		 203 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.324873  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6230  putative glutathione S-transferase  36.5 
 
 		 207 aa  106  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0344917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1708  Glutathione S-transferase domain  34.5 
 
 		 199 aa  106  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5568  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.35 
 
 		 205 aa  105  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8513  Glutathione S-transferase domain protein  34.33 
 
 		 205 aa  105  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700179  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1904  Glutathione S-transferase domain protein  33.83 
 
 		 199 aa  104  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1087  glutathione S-transferase family protein  33.69 
 
 		 222 aa  102  5e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.983271 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>