More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1311 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1311  glutathione S-transferase-like protein  100 
 
 		 196 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.55458  normal  0.181696 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3910  glutathione S-transferase-like  82.56 
 
 		 201 aa  325  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4794  Glutathione S-transferase domain  74.74 
 
 		 197 aa  303  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.915466  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1820  putative glutathione S-transferase  68.75 
 
 		 196 aa  271  4.0000000000000004e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1171  Glutathione S-transferase domain protein  60.62 
 
 		 204 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245566  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0017  glutathione S-transferase domain-containing protein  59.38 
 
 		 192 aa  236  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2587  Glutathione S-transferase domain  60.53 
 
 		 195 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.751074  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2312  glutathione S-transferase domain-containing protein  60.53 
 
 		 195 aa  232  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0196665 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2269  Glutathione S-transferase domain  60.53 
 
 		 195 aa  232  3e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1985  glutathione S-transferase  55.21 
 
 		 207 aa  213  1.9999999999999998e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3587  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.77 
 
 		 203 aa  210  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0707812  hitchhiker  0.000377551 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003296  glutathione transferase  49.74 
 
 		 198 aa  202  4e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3827  putative glutathione S-transferase  50.79 
 
 		 208 aa  198  5e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3211  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.73 
 
 		 198 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1821  glutathione S-transferase family protein  49.75 
 
 		 200 aa  194  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0623474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3890  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.24 
 
 		 200 aa  192  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.19285 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3511  glutathione S-transferase-like protein  48.19 
 
 		 198 aa  192  4e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04080  probable glutathione S-transferase  47.42 
 
 		 199 aa  192  4e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0196  glutathione S-transferase-like  48.15 
 
 		 204 aa  192  4e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1399  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.73 
 
 		 200 aa  191  5e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43110  putative glutathione S-transferase  49.46 
 
 		 200 aa  191  8e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000318488  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3617  putative glutathione S-transferase  49.46 
 
 		 200 aa  190  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1429  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.46 
 
 		 200 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114439  normal  0.299107 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2139  glutathione S-transferase  44.68 
 
 		 203 aa  185  4e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.041384 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3893  glutathione S-transferase-like protein  45.45 
 
 		 210 aa  183  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2670  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.69 
 
 		 200 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.237361  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2495  putative glutathione S-transferase  43.01 
 
 		 204 aa  177  8e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00712937  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2032  glutathione S-transferase family protein  46.28 
 
 		 200 aa  177  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1842  glutathione S-transferase  46.2 
 
 		 200 aa  176  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260742  normal  0.324274 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1471  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.88 
 
 		 200 aa  176  3e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0503  Glutathione S-transferase domain protein  41.15 
 
 		 208 aa  173  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0544052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2296  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.39 
 
 		 204 aa  166  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.879102 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1387  Glutathione S-transferase domain protein  41.27 
 
 		 201 aa  165  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1421  glutathione S-transferase domain protein  40.76 
 
 		 201 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0412  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.27 
 
 		 203 aa  154  7e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1493  glutathione S-transferase family protein  44.62 
 
 		 203 aa  152  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.695225  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2641  Glutathione S-transferase domain  41.79 
 
 		 218 aa  153  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.213293 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1447  glutathione S-transferase family protein  44.62 
 
 		 203 aa  152  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277938  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04799  glutathione S-transferase  40.4 
 
 		 209 aa  150  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2738  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.21 
 
 		 216 aa  145  5e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3756  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.08 
 
 		 208 aa  144  7.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1101  glutathione S-transferase-like  37.06 
 
 		 256 aa  136  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2981  glutathione S-transferase  37.06 
 
 		 216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.897939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1799  putative glutathione S-transferase (GST)  36.22 
 
 		 216 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.602523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1296  glutathione S-transferase-like protein  38.07 
 
 		 228 aa  128  6e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.041604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4124  glutathione S-transferase-like  37.24 
 
 		 217 aa  128  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.590461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3927  glutathione S-transferase-like  36.55 
 
 		 228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4810  Glutathione S-transferase domain  38.07 
 
 		 217 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0134  Glutathione S-transferase domain protein  37.76 
 
 		 209 aa  122  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1180  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.9 
 
 		 207 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.610567  normal  0.0747789 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5413  Glutathione S-transferase domain protein  35.33 
 
 		 207 aa  116  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4962  Glutathione S-transferase domain protein  38.66 
 
 		 219 aa  111  8.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3224  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.9 
 
 		 208 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.395203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3618  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.6 
 
 		 201 aa  108  7.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.822578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2547  glutathione S-transferase-like  35.33 
 
 		 203 aa  107  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.277247  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4489  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.17 
 
 		 208 aa  105  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1347  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.5 
 
 		 205 aa  104  7e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2762  glutathione S-transferase-like  36.22 
 
 		 206 aa  104  7e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3670  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.17 
 
 		 214 aa  104  9e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4693  glutathione S-transferase-like  37.17 
 
 		 214 aa  104  9e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1162  glutathione S-transferase family protein  35.26 
 
 		 209 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2439  glutathione S-transferase-like protein  37.31 
 
 		 214 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.414826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3851  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.17 
 
 		 214 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.216591  normal  0.461755 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4250  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.87 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1196  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.26 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5040  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.17 
 
 		 221 aa  101  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.367084 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0910  Glutathione S-transferase domain  36.32 
 
 		 203 aa  101  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1057  Glutathione S-transferase domain protein  35.26 
 
 		 203 aa  101  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0628244  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0661  Glutathione S-transferase domain protein  36.46 
 
 		 203 aa  100  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4952  Glutathione S-transferase domain  35.6 
 
 		 208 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.246161 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2245  glutathione S-transferase-like  34.22 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.556118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0925  putative glutathione S-transferase  36.9 
 
 		 203 aa  97.8  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.324873  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1904  Glutathione S-transferase domain protein  35.26 
 
 		 199 aa  97.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8513  Glutathione S-transferase domain protein  34.9 
 
 		 205 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700179  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5079  Glutathione S-transferase domain  32.84 
 
 		 213 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.242731  hitchhiker  0.00740675 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3573  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.27 
 
 		 214 aa  97.4  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.242235  normal  0.0117224 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0645  glutathione S-transferase-like  35.94 
 
 		 225 aa  96.7  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.722095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4686  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.69 
 
 		 205 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5005  Glutathione S-transferase domain  35.6 
 
 		 208 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.286975  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5417  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.27 
 
 		 214 aa  97.1  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3092  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.53 
 
 		 205 aa  95.5  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.061874 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6230  putative glutathione S-transferase  36.65 
 
 		 207 aa  95.5  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0344917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4051  putative glutathione S-transferase  36.32 
 
 		 223 aa  95.1  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.838028 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1128  glutathione S-transferase-like  32.31 
 
 		 206 aa  94.7  7e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3947  Glutathione S-transferase domain protein  33.17 
 
 		 207 aa  94.7  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3325  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.71 
 
 		 205 aa  94.7  8e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0407  glutathione S-transferase  36.65 
 
 		 217 aa  94  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0797  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.34 
 
 		 205 aa  93.2  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1106  Glutathione S-transferase domain  34 
 
 		 203 aa  93.6  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1775  glutathione S-transferase  33.84 
 
 		 208 aa  92.8  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000137039 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0107  glutathione S-transferase  35.6 
 
 		 214 aa  92  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1267  glutathione S-transferase  35.6 
 
 		 214 aa  92  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261228  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0125  glutathione S-transferase  35.6 
 
 		 266 aa  91.7  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2817  glutathione S-transferase  35.6 
 
 		 300 aa  91.3  8e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4359  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.27 
 
 		 222 aa  91.3  9e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5690  glutathione S-transferase-like protein  32.63 
 
 		 227 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529075 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3433  glutathione S-transferase family protein  29.35 
 
 		 214 aa  90.1  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000284771 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4125  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.23 
 
 		 203 aa  89.7  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1071  glutathione S-transferase  35.08 
 
 		 214 aa  89  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.292672  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2670  putative glutathione S-transferase  35.08 
 
 		 297 aa  88.6  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>