More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1128 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1128  glutathione S-transferase-like  100 
 
 		 206 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3573  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.1 
 
 		 214 aa  231  5e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.242235  normal  0.0117224 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5417  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.1 
 
 		 214 aa  231  6e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4686  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.68 
 
 		 205 aa  226  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0910  Glutathione S-transferase domain  54.19 
 
 		 203 aa  225  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3323  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.67 
 
 		 227 aa  225  4e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0187385  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3670  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.59 
 
 		 214 aa  224  6e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4693  glutathione S-transferase-like  56.59 
 
 		 214 aa  224  6e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1057  Glutathione S-transferase domain protein  53.69 
 
 		 203 aa  223  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0628244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3851  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.1 
 
 		 214 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.216591  normal  0.461755 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2439  glutathione S-transferase-like protein  55.61 
 
 		 214 aa  222  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.414826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2670  putative glutathione S-transferase  52.74 
 
 		 297 aa  220  9e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1071  glutathione S-transferase  52.74 
 
 		 214 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.292672  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2817  glutathione S-transferase  52.74 
 
 		 300 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0125  glutathione S-transferase  52.74 
 
 		 266 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0107  glutathione S-transferase  52.74 
 
 		 214 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1267  glutathione S-transferase  52.74 
 
 		 214 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261228  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2762  glutathione S-transferase-like  54.9 
 
 		 206 aa  219  3e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5040  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.15 
 
 		 221 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.367084 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0407  glutathione S-transferase  52.45 
 
 		 217 aa  217  8.999999999999998e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3325  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.22 
 
 		 205 aa  216  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1196  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.15 
 
 		 209 aa  214  5e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1347  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.69 
 
 		 205 aa  214  5e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0645  glutathione S-transferase-like  51.69 
 
 		 225 aa  214  7e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.722095  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1162  glutathione S-transferase family protein  53.66 
 
 		 209 aa  214  8e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4250  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.17 
 
 		 209 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3224  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.88 
 
 		 208 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.395203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5568  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.71 
 
 		 205 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4125  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.74 
 
 		 203 aa  212  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8513  Glutathione S-transferase domain protein  53.23 
 
 		 205 aa  211  5.999999999999999e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700179  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1180  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.92 
 
 		 207 aa  211  9e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.610567  normal  0.0747789 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0925  putative glutathione S-transferase  53.2 
 
 		 203 aa  210  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.324873  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4952  Glutathione S-transferase domain  50.75 
 
 		 208 aa  209  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.246161 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4489  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.24 
 
 		 208 aa  208  4e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5005  Glutathione S-transferase domain  50.75 
 
 		 208 aa  206  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.286975  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4729  glutathione S-transferase  52.22 
 
 		 203 aa  206  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0556098  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4051  putative glutathione S-transferase  50.74 
 
 		 223 aa  206  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.838028 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0661  Glutathione S-transferase domain protein  50.74 
 
 		 203 aa  204  6e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5079  Glutathione S-transferase domain  49.27 
 
 		 213 aa  201  7e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.242731  hitchhiker  0.00740675 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5690  glutathione S-transferase-like protein  52.24 
 
 		 227 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529075 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1106  Glutathione S-transferase domain  48.28 
 
 		 203 aa  190  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4962  Glutathione S-transferase domain protein  46.38 
 
 		 219 aa  189  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6230  putative glutathione S-transferase  52.28 
 
 		 207 aa  188  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0344917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0797  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.18 
 
 		 205 aa  183  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3092  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.19 
 
 		 205 aa  179  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.061874 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2245  glutathione S-transferase-like  44.78 
 
 		 220 aa  177  8e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.556118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2104  putative glutathione S-transferase  45.13 
 
 		 198 aa  175  4e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1873  Glutathione S-transferase domain protein  45.6 
 
 		 200 aa  174  7e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3433  glutathione S-transferase family protein  42.49 
 
 		 214 aa  171  5e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000284771 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3947  Glutathione S-transferase domain protein  44.9 
 
 		 207 aa  169  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1904  Glutathione S-transferase domain protein  43.88 
 
 		 199 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3285  putative glutathione S-transferase  43.15 
 
 		 197 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.549218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0462  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.1 
 
 		 205 aa  160  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.269396 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24830  putative glutathione S-transferase  43.08 
 
 		 198 aa  159  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1708  Glutathione S-transferase domain  41.75 
 
 		 199 aa  145  3e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4463  Glutathione S-transferase domain  38 
 
 		 220 aa  125  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0595447 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5869  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.76 
 
 		 215 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6467  Glutathione S-transferase domain protein  37.5 
 
 		 219 aa  122  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3700  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.68 
 
 		 202 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2349  glutathione S-transferase-like protein  36.41 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0771783 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0805  putative glutathione S-transferase  35.2 
 
 		 216 aa  111  9e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.671378  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4794  Glutathione S-transferase domain  35.08 
 
 		 197 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.915466  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0412  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.15 
 
 		 203 aa  105  6e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1704  Glutathione S-transferase domain protein  33.33 
 
 		 212 aa  104  8e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0690203  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5423  Gst12 glutathione-S-transferase  28.86 
 
 		 210 aa  104  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.355245  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3511  glutathione S-transferase-like protein  30.85 
 
 		 198 aa  102  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2641  Glutathione S-transferase domain  32.85 
 
 		 218 aa  101  6e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.213293 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0017  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.92 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0196  glutathione S-transferase-like  32.84 
 
 		 204 aa  99.8  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003296  glutathione transferase  34.03 
 
 		 198 aa  99  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0503  Glutathione S-transferase domain protein  30.15 
 
 		 208 aa  98.6  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0544052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3954  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.38 
 
 		 205 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.251267 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3910  glutathione S-transferase-like  34.76 
 
 		 201 aa  97.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1985  glutathione S-transferase  34.18 
 
 		 207 aa  97.4  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2670  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.86 
 
 		 200 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.237361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2557  glutathione S-transferase-like protein  34.72 
 
 		 205 aa  97.1  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.630075 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3587  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.83 
 
 		 203 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0707812  hitchhiker  0.000377551 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2032  glutathione S-transferase family protein  34.17 
 
 		 200 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3478  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.14 
 
 		 205 aa  95.9  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.556825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5300  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.75 
 
 		 205 aa  95.9  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.217524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1311  glutathione S-transferase-like protein  32.31 
 
 		 196 aa  94.7  8e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.55458  normal  0.181696 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1842  glutathione S-transferase  34.17 
 
 		 200 aa  94  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260742  normal  0.324274 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5110  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.72 
 
 		 205 aa  92.8  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0347901 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2738  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.66 
 
 		 216 aa  93.2  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3211  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 		 198 aa  92.4  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3893  glutathione S-transferase-like protein  29.9 
 
 		 210 aa  91.3  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04799  glutathione S-transferase  29.9 
 
 		 209 aa  91.3  9e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1821  glutathione S-transferase family protein  33 
 
 		 200 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0623474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2139  glutathione S-transferase  28.57 
 
 		 203 aa  91.3  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.041384 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04080  probable glutathione S-transferase  32.02 
 
 		 199 aa  89.7  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2495  putative glutathione S-transferase  31.66 
 
 		 204 aa  89  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00712937  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3890  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.5 
 
 		 200 aa  88.2  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.19285 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2604  glutathione S-transferase  31.96 
 
 		 227 aa  87.4  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.918843  normal  0.211055 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3827  putative glutathione S-transferase  32.84 
 
 		 208 aa  87.4  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5413  Glutathione S-transferase domain protein  27.64 
 
 		 207 aa  87.4  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1010  glutathione S-transferase-like protein  31.5 
 
 		 215 aa  86.7  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0403399  normal  0.226457 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1399  glutathione S-transferase domain-containing protein  32 
 
 		 200 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2587  Glutathione S-transferase domain  34.55 
 
 		 195 aa  87  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.751074  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1387  Glutathione S-transferase domain protein  31.41 
 
 		 201 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3226  glutathione S-transferase-like  31.77 
 
 		 228 aa  86.3  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.74059  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>