More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3226 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_3226  glutathione S-transferase-like  100 
 
 
228 aa  471  1e-132  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.74059  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2604  glutathione S-transferase  89.47 
 
 
227 aa  408  1e-113  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.918843  normal  0.211055 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0387  glutathione S-transferase-like  63.18 
 
 
229 aa  296  2e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1237  glutathione S-transferase, putative  62.27 
 
 
234 aa  290  1e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00250185  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2523  putative glutathione S-transferase  61.82 
 
 
234 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3410  putative glutathione S-transferase  61.82 
 
 
234 aa  287  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.822464  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2345  glutathione S-transferase, putative  61.82 
 
 
234 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0257  putative glutathione S-transferase  61.82 
 
 
234 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3417  glutathione S-transferase, putative  61.82 
 
 
234 aa  287  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0270497  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3374  putative glutathione S-transferase  61.82 
 
 
234 aa  287  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0444471  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1119  putative glutathione S-transferase  61.82 
 
 
234 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5179  glutathione S-transferase-like  57.27 
 
 
231 aa  278  4e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0776734  normal  0.437986 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4489  glutathione S-transferase domain-containing protein  59.28 
 
 
226 aa  259  3e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6162  Glutathione S-transferase domain  58.64 
 
 
227 aa  256  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2158  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.02 
 
 
224 aa  255  4e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1831  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.01 
 
 
235 aa  255  4e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0418  glutathione S-transferase  55.91 
 
 
226 aa  254  9e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0882437 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1254  glutathione S-transferase-like  54.55 
 
 
229 aa  251  7e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0201238  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1690  Glutathione S-transferase domain  54.19 
 
 
231 aa  244  8e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2975  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.82 
 
 
234 aa  243  1.9999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.916048 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0981  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.46 
 
 
236 aa  239  2.9999999999999997e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5156  Glutathione S-transferase domain  53.81 
 
 
234 aa  228  5e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.561496  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5133  Glutathione S-transferase domain  53.51 
 
 
233 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2145  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.58 
 
 
230 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0715733  normal  0.478827 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3457  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.29 
 
 
232 aa  187  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0220469  normal  0.0243961 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2266  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.58 
 
 
230 aa  186  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5556  glutathione S-transferase-like protein  45.58 
 
 
230 aa  185  5e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2252  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.58 
 
 
230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.791972  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1616  glutathione S-transferase-like  45.13 
 
 
230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2228  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.13 
 
 
230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0354  Glutathione S-transferase domain protein  40.6 
 
 
233 aa  181  9.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1049  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.25 
 
 
230 aa  180  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104834  normal  0.267684 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2021  putative GST-related protein  44.09 
 
 
230 aa  180  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.398836  normal  0.122618 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0300  glutathione S-transferase-like protein  42.92 
 
 
234 aa  178  7e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2602  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.38 
 
 
231 aa  177  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.550233 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4693  glutathione S-transferase-like protein  38.03 
 
 
232 aa  176  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50970  glutathione S-transferase  43.66 
 
 
213 aa  176  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.069878  hitchhiker  0.0000421189 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4348  glutathione S-transferase  43.66 
 
 
213 aa  176  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2178  Glutathione S-transferase domain  43.36 
 
 
230 aa  174  7e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0564194 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1855  Glutathione S-transferase domain protein  42.92 
 
 
230 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.619929  normal  0.146027 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0078  Glutathione S-transferase domain  41.92 
 
 
235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.926583  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1988  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.79 
 
 
233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.601516 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1653  Glutathione S-transferase domain protein  40.97 
 
 
233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1701  Glutathione S-transferase domain protein  41.41 
 
 
233 aa  172  2.9999999999999996e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0980  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.81 
 
 
237 aa  172  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3866  Glutathione S-transferase domain  44.25 
 
 
229 aa  172  5e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3798  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.75 
 
 
236 aa  171  6.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.59415  normal  0.718162 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4144  glutathione S-transferase-like protein  41.6 
 
 
235 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.547927  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1366  Glutathione S-transferase domain  41.92 
 
 
233 aa  171  9e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202985  hitchhiker  0.00146778 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5440  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.29 
 
 
235 aa  171  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.199616  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0967  glutathione S-transferase-like protein  43.96 
 
 
230 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00253605  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0442  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.41 
 
 
233 aa  170  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0747669 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0346  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.23 
 
 
231 aa  170  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3292  putative glutathione S-transferase  42.08 
 
 
222 aa  169  3e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000024408 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1001  glutathione S-transferase  42.04 
 
 
230 aa  168  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1238  hypothetical protein  38.46 
 
 
232 aa  169  5e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00464821  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1416  glutathione S-transferase  41.78 
 
 
230 aa  168  5e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3195  Glutathione S-transferase domain  43.33 
 
 
233 aa  169  5e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.16528  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3215  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.44 
 
 
261 aa  168  6e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.969871  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02807  glutathione S-transferase  43.81 
 
 
229 aa  167  1e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1954  putative GST-related protein  42.04 
 
 
255 aa  167  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1459  glutathione S-transferase-like protein  42.98 
 
 
228 aa  167  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0619383 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1576  glutathione S-transferase family protein  42.51 
 
 
222 aa  166  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1214  glutathione S-transferase-like protein  41.78 
 
 
214 aa  166  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2848  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.45 
 
 
233 aa  166  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0336918  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2966  Glutathione S-transferase domain protein  39.3 
 
 
222 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.183097  normal  0.112262 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2356  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.93 
 
 
231 aa  166  4e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.727095  normal  0.759531 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1393  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.3 
 
 
222 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2303  Glutathione S-transferase domain protein  43.22 
 
 
234 aa  165  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0188012  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3771  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.73 
 
 
230 aa  166  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.680155  normal  0.387546 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1416  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.3 
 
 
222 aa  165  5e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1306  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.3 
 
 
222 aa  165  5e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0751  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.59 
 
 
242 aa  164  6.9999999999999995e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0134442  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3132  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.53 
 
 
235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188559  normal  0.0740814 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0906  hypothetical protein  41.43 
 
 
228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.719726  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2866  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.3 
 
 
222 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0201506 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3329  Glutathione S-transferase domain  45.5 
 
 
235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3416  putative glutathione S-transferase-like protein  37.61 
 
 
232 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21646  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3409  putative glutathione S-transferase  37.61 
 
 
232 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3373  putative glutathione S-transferase  37.61 
 
 
232 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0887626  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4135  glutathione S-transferase-like  39.24 
 
 
239 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.354502  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2458  glutathione S-transferase  43.69 
 
 
215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00690199  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1377  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.86 
 
 
222 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.682685  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1120  putative glutathione S-transferase  37.61 
 
 
232 aa  162  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0258  putative glutathione S-transferase  37.61 
 
 
232 aa  162  3e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2524  putative glutathione S-transferase  37.61 
 
 
232 aa  162  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2696  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.86 
 
 
222 aa  162  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036581 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2246  glutathione S-transferase-like  42.29 
 
 
237 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0687483  normal  0.14056 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2764  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.86 
 
 
222 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3320  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.13 
 
 
209 aa  162  5.0000000000000005e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000262213  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4163  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.84 
 
 
227 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.301495 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0131  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.55 
 
 
208 aa  162  6e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.949199  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2962  glutathione S-transferase-like  44.34 
 
 
234 aa  161  7e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.716617  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4359  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.96 
 
 
222 aa  161  7e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3442  glutathione S-transferase  43.69 
 
 
215 aa  161  8.000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000326275  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3453  Glutathione S-transferase domain  44.22 
 
 
235 aa  160  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1349  Glutathione S-transferase domain protein  41.44 
 
 
236 aa  161  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02227  predicted glutathione S-transferase  43.2 
 
 
215 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0437248  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1354  Glutathione S-transferase domain protein  43.2 
 
 
215 aa  160  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000942555  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2678  glutathione S-transferase  43.2 
 
 
215 aa  160  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000401347  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>