More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4163 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4163  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 		 227 aa  456  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.301495 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2246  glutathione S-transferase-like  53.17 
 
 		 237 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0687483  normal  0.14056 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2846  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.78 
 
 		 263 aa  228  7e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.130993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2476  Glutathione S-transferase domain  52.2 
 
 		 239 aa  228  8e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.797585  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3209  glutathione S-transferase-like protein  53.4 
 
 		 239 aa  227  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1416  glutathione S-transferase  55.17 
 
 		 230 aa  226  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5440  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.67 
 
 		 235 aa  226  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.199616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5226  Glutathione S-transferase domain  57.43 
 
 		 211 aa  226  3e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0430433 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4759  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.43 
 
 		 211 aa  226  3e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.895544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5301  Glutathione S-transferase domain  57.43 
 
 		 211 aa  224  6e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0332  glutathione S-transferase-like protein  53.39 
 
 		 229 aa  223  2e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4144  glutathione S-transferase-like protein  54.5 
 
 		 235 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.547927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0662  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.19 
 
 		 233 aa  222  4e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3457  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.85 
 
 		 232 aa  221  6e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0220469  normal  0.0243961 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3798  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.77 
 
 		 236 aa  221  9e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.59415  normal  0.718162 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3132  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.93 
 
 		 235 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188559  normal  0.0740814 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0354  Glutathione S-transferase domain protein  53 
 
 		 233 aa  219  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3215  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.23 
 
 		 261 aa  219  3e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.969871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3453  Glutathione S-transferase domain  57.14 
 
 		 235 aa  219  3e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1653  Glutathione S-transferase domain protein  55.84 
 
 		 233 aa  218  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0078  Glutathione S-transferase domain  50.85 
 
 		 235 aa  218  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.926583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2356  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.72 
 
 		 231 aa  218  5e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.727095  normal  0.759531 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3329  Glutathione S-transferase domain  56.85 
 
 		 235 aa  218  5e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4693  glutathione S-transferase-like protein  51.69 
 
 		 232 aa  218  5e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0486  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.45 
 
 		 211 aa  218  6e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.302672  normal  0.434346 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4135  glutathione S-transferase-like  51.5 
 
 		 239 aa  217  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.354502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1526  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.07 
 
 		 241 aa  216  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.824932  normal  0.476803 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5556  glutathione S-transferase-like protein  53.69 
 
 		 230 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2306  Glutathione S-transferase domain protein  52.66 
 
 		 229 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0027483 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3152  glutathione S-transferase-like  50.73 
 
 		 235 aa  215  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.194724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7359  putative glutathione S-transferase  55.61 
 
 		 208 aa  214  5.9999999999999996e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.787949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3195  Glutathione S-transferase domain  54 
 
 		 233 aa  214  9.999999999999999e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.16528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2266  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.69 
 
 		 230 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0442  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.82 
 
 		 233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0747669 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3409  putative glutathione S-transferase  52.74 
 
 		 232 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3373  putative glutathione S-transferase  52.74 
 
 		 232 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0887626  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3416  putative glutathione S-transferase-like protein  52.74 
 
 		 232 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21646  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0258  putative glutathione S-transferase  52.74 
 
 		 232 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1120  putative glutathione S-transferase  52.74 
 
 		 232 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2145  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.2 
 
 		 230 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0715733  normal  0.478827 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2524  putative glutathione S-transferase  52.74 
 
 		 232 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05780  Glutathione S-transferase-like protein  53.23 
 
 		 229 aa  211  7e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.713113  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4348  glutathione S-transferase  54.19 
 
 		 213 aa  211  9e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0624  glutathione S-transferase family protein  51.4 
 
 		 236 aa  210  1e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1701  Glutathione S-transferase domain protein  53.23 
 
 		 233 aa  210  1e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0346  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.69 
 
 		 231 aa  210  2e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2021  putative GST-related protein  52.5 
 
 		 230 aa  209  4e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.398836  normal  0.122618 
 
 
-
 
NC_004310  BR0626  glutathione S-transferase family protein  51.4 
 
 		 236 aa  209  4e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.679166  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4437  glutathione S-transferase domain-containing protein  54 
 
 		 206 aa  209  4e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1238  hypothetical protein  51.49 
 
 		 232 aa  208  5e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00464821  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2631  glutathione S-transferase-like  52.68 
 
 		 239 aa  208  5e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.400604  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1616  glutathione S-transferase-like  52.22 
 
 		 230 aa  207  9e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2228  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.22 
 
 		 230 aa  207  9e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3771  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.73 
 
 		 230 aa  207  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.680155  normal  0.387546 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2848  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.49 
 
 		 233 aa  207  1e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0336918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1049  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.22 
 
 		 230 aa  207  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104834  normal  0.267684 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2252  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.22 
 
 		 230 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.791972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1001  glutathione S-transferase  50.49 
 
 		 230 aa  205  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0980  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.45 
 
 		 237 aa  205  4e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1855  Glutathione S-transferase domain protein  48.62 
 
 		 230 aa  204  8e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.619929  normal  0.146027 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1366  Glutathione S-transferase domain  51.94 
 
 		 233 aa  204  8e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202985  hitchhiker  0.00146778 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50970  glutathione S-transferase  52.22 
 
 		 213 aa  204  8e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.069878  hitchhiker  0.0000421189 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1954  putative GST-related protein  52.94 
 
 		 255 aa  204  9e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0906  hypothetical protein  52.76 
 
 		 228 aa  203  1e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.719726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2602  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.94 
 
 		 231 aa  203  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.550233 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3866  Glutathione S-transferase domain  53.23 
 
 		 229 aa  202  3e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2178  Glutathione S-transferase domain  48.15 
 
 		 230 aa  202  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0564194 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5178  glutathione S-transferase-like  49.02 
 
 		 232 aa  202  4e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.14205  normal  0.444148 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0967  glutathione S-transferase-like protein  50 
 
 		 230 aa  202  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00253605  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2563  Glutathione S-transferase domain protein  49.51 
 
 		 209 aa  202  5e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0185641  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02807  glutathione S-transferase  53.96 
 
 		 229 aa  201  7e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2655  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.25 
 
 		 235 aa  201  8e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185355  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1214  glutathione S-transferase-like protein  50.25 
 
 		 214 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2329  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.62 
 
 		 211 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00249355  normal  0.144066 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2303  Glutathione S-transferase domain protein  51.5 
 
 		 234 aa  197  7.999999999999999e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0188012  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4925  Glutathione S-transferase domain protein  52 
 
 		 223 aa  197  7.999999999999999e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18954  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5265  putative glutathione transferase  47.49 
 
 		 234 aa  197  9e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0071298  normal  0.528332 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2458  glutathione S-transferase  51.24 
 
 		 215 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00690199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3442  glutathione S-transferase  51.24 
 
 		 215 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000326275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1931  glutathione S-transferase-like  49.54 
 
 		 227 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.548624 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1459  glutathione S-transferase-like protein  51.5 
 
 		 228 aa  196  2.0000000000000003e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0619383 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2590  glutathione S-transferase, N- domain  48.13 
 
 		 215 aa  194  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.153757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2699  glutathione S-transferase, N- domain  50 
 
 		 215 aa  194  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.100904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1988  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.51 
 
 		 233 aa  194  7e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.601516 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2578  glutathione S-transferase, N- domain  50 
 
 		 215 aa  194  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.539822  normal  0.255018 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2490  glutathione S-transferase, N- domain  50 
 
 		 215 aa  194  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00139167  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3353  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.72 
 
 		 208 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000179296 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02227  predicted glutathione S-transferase  50.75 
 
 		 215 aa  194  9e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0437248  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1354  Glutathione S-transferase domain protein  50.75 
 
 		 215 aa  194  9e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000942555  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2678  glutathione S-transferase  50.75 
 
 		 215 aa  194  9e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000401347  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2596  glutathione S-transferase  50.75 
 
 		 215 aa  194  9e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000860005  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2452  glutathione S-transferase  50.75 
 
 		 215 aa  194  9e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1350  glutathione S-transferase  50.75 
 
 		 215 aa  194  9e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0219801  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02187  hypothetical protein  50.75 
 
 		 215 aa  194  9e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0695509  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2407  putative glutathione S-transferase  52.91 
 
 		 235 aa  194  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00274689  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1633  Glutathione S-transferase domain protein  50 
 
 		 209 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0604815 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2536  glutathione S-transferase, N- domain  50 
 
 		 215 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0018218  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4359  glutathione S-transferase domain-containing protein  52 
 
 		 222 aa  193  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0300  glutathione S-transferase-like protein  48.04 
 
 		 234 aa  193  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1381  Glutathione S-transferase domain protein  47.55 
 
 		 209 aa  192  4e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0785607  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>