More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2848 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_2848  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 
233 aa  474  1e-133  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0336918  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5556  glutathione S-transferase-like protein  62.68 
 
 
230 aa  257  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2266  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.72 
 
 
230 aa  256  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2145  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.72 
 
 
230 aa  255  4e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0715733  normal  0.478827 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1616  glutathione S-transferase-like  61.72 
 
 
230 aa  254  7e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2228  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.72 
 
 
230 aa  254  7e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2252  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.9 
 
 
230 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.791972  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1049  glutathione S-transferase domain-containing protein  60.95 
 
 
230 aa  249  3e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104834  normal  0.267684 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2306  Glutathione S-transferase domain protein  57.89 
 
 
229 aa  246  2e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0027483 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2021  putative GST-related protein  59.33 
 
 
230 aa  246  3e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.398836  normal  0.122618 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0131  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.14 
 
 
208 aa  246  3e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.949199  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3457  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.49 
 
 
232 aa  243  9.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0220469  normal  0.0243961 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50970  glutathione S-transferase  56.19 
 
 
213 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.069878  hitchhiker  0.0000421189 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43530  hypothetical protein  58.57 
 
 
220 aa  242  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2329  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.17 
 
 
211 aa  241  7e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00249355  normal  0.144066 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1366  Glutathione S-transferase domain  55.96 
 
 
233 aa  240  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202985  hitchhiker  0.00146778 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4144  glutathione S-transferase-like protein  54.98 
 
 
235 aa  239  2e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.547927  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0346  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.89 
 
 
231 aa  239  4e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3650  hypothetical protein  57.62 
 
 
220 aa  238  4e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.328113  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1855  Glutathione S-transferase domain protein  57.42 
 
 
230 aa  238  5e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.619929  normal  0.146027 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4348  glutathione S-transferase  55.71 
 
 
213 aa  238  5e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1701  Glutathione S-transferase domain protein  54.72 
 
 
233 aa  237  1e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3329  Glutathione S-transferase domain  58.42 
 
 
235 aa  237  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2178  Glutathione S-transferase domain  57.42 
 
 
230 aa  236  2e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0564194 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1988  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.08 
 
 
233 aa  236  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.601516 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1653  Glutathione S-transferase domain protein  57.92 
 
 
233 aa  236  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1214  glutathione S-transferase-like protein  57.14 
 
 
214 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3132  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.46 
 
 
235 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188559  normal  0.0740814 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0354  Glutathione S-transferase domain protein  55.12 
 
 
233 aa  234  8e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02807  glutathione S-transferase  58.29 
 
 
229 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3453  Glutathione S-transferase domain  57.71 
 
 
235 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4938  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.98 
 
 
210 aa  233  3e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2602  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.4 
 
 
231 aa  232  3e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.550233 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1001  glutathione S-transferase  56.46 
 
 
230 aa  232  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3771  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.88 
 
 
230 aa  232  4.0000000000000004e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.680155  normal  0.387546 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4693  glutathione S-transferase-like protein  54.85 
 
 
232 aa  231  7.000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5440  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.98 
 
 
235 aa  231  8.000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.199616  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0831  Glutathione S-transferase domain protein  52.31 
 
 
227 aa  230  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0286662 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4135  glutathione S-transferase-like  52.83 
 
 
239 aa  229  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.354502  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2246  glutathione S-transferase-like  53.55 
 
 
237 aa  229  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0687483  normal  0.14056 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3152  glutathione S-transferase-like  54.98 
 
 
235 aa  229  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.194724  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0442  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.44 
 
 
233 aa  229  3e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0747669 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0300  glutathione S-transferase-like protein  54.33 
 
 
234 aa  229  4e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2476  Glutathione S-transferase domain  54.03 
 
 
239 aa  228  5e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.797585  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3215  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.56 
 
 
261 aa  228  7e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.969871  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0906  hypothetical protein  55.02 
 
 
228 aa  228  7e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.719726  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2356  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.94 
 
 
231 aa  226  2e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.727095  normal  0.759531 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4759  glutathione S-transferase domain-containing protein  59.71 
 
 
211 aa  226  2e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.895544  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5226  Glutathione S-transferase domain  59.71 
 
 
211 aa  226  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0430433 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2655  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.92 
 
 
235 aa  226  3e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185355  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2631  glutathione S-transferase-like  55.87 
 
 
239 aa  226  3e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.400604  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3866  Glutathione S-transferase domain  54.76 
 
 
229 aa  226  3e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5301  Glutathione S-transferase domain  58.77 
 
 
211 aa  226  3e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05780  Glutathione S-transferase-like protein  54.07 
 
 
229 aa  226  3e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.713113  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0332  glutathione S-transferase-like protein  54.55 
 
 
229 aa  225  4e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0486  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.19 
 
 
211 aa  225  6e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.302672  normal  0.434346 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0967  glutathione S-transferase-like protein  55.02 
 
 
230 aa  224  7e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00253605  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3798  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.56 
 
 
236 aa  223  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.59415  normal  0.718162 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0624  glutathione S-transferase family protein  55.98 
 
 
236 aa  222  3e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1954  putative GST-related protein  52.7 
 
 
255 aa  221  4.9999999999999996e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_004310  BR0626  glutathione S-transferase family protein  55.98 
 
 
236 aa  221  8e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.679166  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1416  glutathione S-transferase  54.59 
 
 
230 aa  221  9.999999999999999e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3409  putative glutathione S-transferase  51.89 
 
 
232 aa  219  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3416  putative glutathione S-transferase-like protein  51.89 
 
 
232 aa  219  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21646  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5178  glutathione S-transferase-like  59.41 
 
 
232 aa  219  3e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.14205  normal  0.444148 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3373  putative glutathione S-transferase  51.89 
 
 
232 aa  219  3e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0887626  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1120  putative glutathione S-transferase  60 
 
 
232 aa  218  6e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3209  glutathione S-transferase-like protein  52.13 
 
 
239 aa  218  6e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0258  putative glutathione S-transferase  60 
 
 
232 aa  218  6e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2524  putative glutathione S-transferase  60 
 
 
232 aa  218  6e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0528  putative glutathione S-transferase  51.9 
 
 
222 aa  217  1e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1931  glutathione S-transferase-like  54.76 
 
 
227 aa  217  1e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.548624 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5265  putative glutathione transferase  52.58 
 
 
234 aa  216  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0071298  normal  0.528332 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3320  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.66 
 
 
209 aa  216  2.9999999999999998e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000262213  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1393  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.43 
 
 
222 aa  215  5e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2966  Glutathione S-transferase domain protein  51.43 
 
 
222 aa  215  5e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.183097  normal  0.112262 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2696  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.43 
 
 
222 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036581 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1416  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.43 
 
 
222 aa  214  7e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2764  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.43 
 
 
222 aa  214  9e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1377  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.43 
 
 
222 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.682685  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3195  Glutathione S-transferase domain  51.43 
 
 
233 aa  214  9.999999999999999e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.16528  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2866  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.95 
 
 
222 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0201506 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1306  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.95 
 
 
222 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1576  glutathione S-transferase family protein  49.3 
 
 
222 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2846  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.12 
 
 
263 aa  213  2.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.130993  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1238  hypothetical protein  50 
 
 
232 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00464821  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1349  Glutathione S-transferase domain protein  52.34 
 
 
236 aa  211  7.999999999999999e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0980  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.66 
 
 
237 aa  211  9e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2303  Glutathione S-transferase domain protein  50.96 
 
 
234 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0188012  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0662  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.2 
 
 
233 aa  210  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1087  glutathione S-transferase family protein  53.11 
 
 
222 aa  210  1e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.983271 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1381  Glutathione S-transferase domain protein  49.52 
 
 
209 aa  211  1e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0785607  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2563  Glutathione S-transferase domain protein  49.76 
 
 
209 aa  210  1e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0185641  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0751  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.51 
 
 
242 aa  209  2e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0134442  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2407  putative glutathione S-transferase  51.85 
 
 
235 aa  209  3e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00274689  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1459  glutathione S-transferase-like protein  52.38 
 
 
228 aa  207  8e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0619383 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1486  glutathione S-transferase  51.9 
 
 
204 aa  207  9e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1479  Glutathione S-transferase domain protein  49.04 
 
 
208 aa  206  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00108267  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2784  Glutathione S-transferase domain protein  49.05 
 
 
208 aa  206  3e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000939416  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1531  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.42 
 
 
233 aa  206  3e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.195621  normal  0.284704 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>