More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1931 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008044  TM1040_1931  glutathione S-transferase-like  100 
 
 
227 aa  471  1e-132  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.548624 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1633  Glutathione S-transferase domain protein  60.1 
 
 
209 aa  258  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0604815 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2306  Glutathione S-transferase domain protein  51.89 
 
 
229 aa  230  1e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0027483 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7359  putative glutathione S-transferase  57.43 
 
 
208 aa  229  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.787949  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3771  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.21 
 
 
230 aa  229  4e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.680155  normal  0.387546 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2356  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.83 
 
 
231 aa  228  9e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.727095  normal  0.759531 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0332  glutathione S-transferase-like protein  55.71 
 
 
229 aa  227  1e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3457  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.74 
 
 
232 aa  226  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0220469  normal  0.0243961 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1701  Glutathione S-transferase domain protein  52.58 
 
 
233 aa  225  5.0000000000000005e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4437  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.22 
 
 
206 aa  224  6e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1049  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.86 
 
 
230 aa  223  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104834  normal  0.267684 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2021  putative GST-related protein  56 
 
 
230 aa  223  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.398836  normal  0.122618 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1855  Glutathione S-transferase domain protein  56 
 
 
230 aa  223  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.619929  normal  0.146027 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5556  glutathione S-transferase-like protein  56.37 
 
 
230 aa  223  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4348  glutathione S-transferase  52.86 
 
 
213 aa  222  3e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1988  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.88 
 
 
233 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.601516 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0906  hypothetical protein  55.45 
 
 
228 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.719726  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2252  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.9 
 
 
230 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.791972  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3209  glutathione S-transferase-like protein  52.94 
 
 
239 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2178  Glutathione S-transferase domain  55 
 
 
230 aa  219  3e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0564194 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1616  glutathione S-transferase-like  54.9 
 
 
230 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1366  Glutathione S-transferase domain  53.92 
 
 
233 aa  219  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202985  hitchhiker  0.00146778 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2228  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.9 
 
 
230 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3866  Glutathione S-transferase domain  53.33 
 
 
229 aa  219  3.9999999999999997e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2266  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.41 
 
 
230 aa  218  5e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05780  Glutathione S-transferase-like protein  52.83 
 
 
229 aa  218  7e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.713113  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2145  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.41 
 
 
230 aa  218  7e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0715733  normal  0.478827 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1954  putative GST-related protein  52.49 
 
 
255 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2563  Glutathione S-transferase domain protein  52.4 
 
 
209 aa  218  7.999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0185641  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50970  glutathione S-transferase  50.95 
 
 
213 aa  217  8.999999999999998e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.069878  hitchhiker  0.0000421189 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2848  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.76 
 
 
233 aa  217  1e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0336918  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5440  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.43 
 
 
235 aa  216  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.199616  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0346  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.47 
 
 
231 aa  216  2e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4135  glutathione S-transferase-like  50.48 
 
 
239 aa  216  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.354502  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3329  Glutathione S-transferase domain  55.84 
 
 
235 aa  216  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3132  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.19 
 
 
235 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188559  normal  0.0740814 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0624  glutathione S-transferase family protein  53.2 
 
 
236 aa  216  2.9999999999999998e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4693  glutathione S-transferase-like protein  50.74 
 
 
232 aa  214  8e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0626  glutathione S-transferase family protein  53.2 
 
 
236 aa  214  9.999999999999999e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.679166  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3215  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.77 
 
 
261 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.969871  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0831  Glutathione S-transferase domain protein  52.02 
 
 
227 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0286662 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0486  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.77 
 
 
211 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.302672  normal  0.434346 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3453  Glutathione S-transferase domain  55.1 
 
 
235 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1486  glutathione S-transferase  53.73 
 
 
204 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2246  glutathione S-transferase-like  53.92 
 
 
237 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0687483  normal  0.14056 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2846  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.96 
 
 
263 aa  213  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.130993  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2303  Glutathione S-transferase domain protein  52.71 
 
 
234 aa  213  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0188012  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0354  Glutathione S-transferase domain protein  50 
 
 
233 aa  211  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2784  Glutathione S-transferase domain protein  51.92 
 
 
208 aa  211  5.999999999999999e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000939416  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1381  Glutathione S-transferase domain protein  52.2 
 
 
209 aa  210  1e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0785607  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2476  Glutathione S-transferase domain  51.96 
 
 
239 aa  210  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.797585  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1214  glutathione S-transferase-like protein  49.52 
 
 
214 aa  209  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02807  glutathione S-transferase  52.86 
 
 
229 aa  209  3e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5226  Glutathione S-transferase domain  53.27 
 
 
211 aa  208  5e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0430433 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4759  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.27 
 
 
211 aa  208  5e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.895544  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1653  Glutathione S-transferase domain protein  50.7 
 
 
233 aa  207  8e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5301  Glutathione S-transferase domain  52.76 
 
 
211 aa  207  8e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4144  glutathione S-transferase-like protein  48.8 
 
 
235 aa  207  8e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.547927  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3195  Glutathione S-transferase domain  54.07 
 
 
233 aa  207  1e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.16528  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2655  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.74 
 
 
235 aa  207  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185355  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1416  glutathione S-transferase  50.99 
 
 
230 aa  207  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1001  glutathione S-transferase  51.74 
 
 
230 aa  206  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0967  glutathione S-transferase-like protein  51.74 
 
 
230 aa  206  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00253605  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2602  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.74 
 
 
231 aa  206  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.550233 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00663  Glutathione S-transferase  49.03 
 
 
219 aa  206  2e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0751  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.17 
 
 
242 aa  205  4e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0134442  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1479  Glutathione S-transferase domain protein  52.22 
 
 
208 aa  205  4e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00108267  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3152  glutathione S-transferase-like  50.75 
 
 
235 aa  205  6e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.194724  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1459  glutathione S-transferase-like protein  53.5 
 
 
228 aa  205  6e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0619383 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2631  glutathione S-transferase-like  50.97 
 
 
239 aa  204  1e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.400604  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0078  Glutathione S-transferase domain  51.23 
 
 
235 aa  203  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.926583  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3320  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.73 
 
 
209 aa  202  4e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000262213  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0980  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.52 
 
 
237 aa  202  4e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0442  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.77 
 
 
233 aa  202  5e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0747669 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5178  glutathione S-transferase-like  48.36 
 
 
232 aa  201  6e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.14205  normal  0.444148 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3353  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.77 
 
 
208 aa  201  6e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000179296 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2407  putative glutathione S-transferase  51.66 
 
 
235 aa  201  9.999999999999999e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00274689  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3373  putative glutathione S-transferase  47.89 
 
 
232 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0887626  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3416  putative glutathione S-transferase-like protein  47.89 
 
 
232 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21646  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3409  putative glutathione S-transferase  47.89 
 
 
232 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0258  putative glutathione S-transferase  47.89 
 
 
232 aa  199  3e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1120  putative glutathione S-transferase  47.89 
 
 
232 aa  199  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2524  putative glutathione S-transferase  47.89 
 
 
232 aa  199  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3798  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.77 
 
 
236 aa  199  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.59415  normal  0.718162 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0662  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.76 
 
 
233 aa  198  6e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0300  glutathione S-transferase-like protein  51.72 
 
 
234 aa  197  9e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1238  hypothetical protein  46.95 
 
 
232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00464821  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1576  glutathione S-transferase family protein  49.01 
 
 
222 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3650  hypothetical protein  50 
 
 
220 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.328113  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3983  glutathione S-transferase-like  47.09 
 
 
219 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.409574  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43530  hypothetical protein  50.49 
 
 
220 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1526  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.08 
 
 
241 aa  195  4.0000000000000005e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.824932  normal  0.476803 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1349  Glutathione S-transferase domain protein  49.25 
 
 
236 aa  195  6e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2962  glutathione S-transferase-like  47.12 
 
 
234 aa  193  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.716617  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4163  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.54 
 
 
227 aa  194  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.301495 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1416  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.83 
 
 
222 aa  193  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2866  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.02 
 
 
222 aa  193  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0201506 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1306  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.83 
 
 
222 aa  192  2e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2966  Glutathione S-transferase domain protein  46.83 
 
 
222 aa  193  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.183097  normal  0.112262 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2696  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.02 
 
 
222 aa  193  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036581 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>