More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1855 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1855  Glutathione S-transferase domain protein  100 
 
 		 230 aa  476  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.619929  normal  0.146027 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2178  Glutathione S-transferase domain  96.96 
 
 		 230 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0564194 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2021  putative GST-related protein  89.57 
 
 		 230 aa  438  9.999999999999999e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.398836  normal  0.122618 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0967  glutathione S-transferase-like protein  80 
 
 		 230 aa  390  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00253605  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1001  glutathione S-transferase  80.43 
 
 		 230 aa  389  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3771  glutathione S-transferase domain-containing protein  74.78 
 
 		 230 aa  374  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.680155  normal  0.387546 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2145  glutathione S-transferase domain-containing protein  77.29 
 
 		 230 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0715733  normal  0.478827 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2266  glutathione S-transferase domain-containing protein  76.86 
 
 		 230 aa  374  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5556  glutathione S-transferase-like protein  75.98 
 
 		 230 aa  373  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1049  glutathione S-transferase domain-containing protein  76.09 
 
 		 230 aa  373  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104834  normal  0.267684 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2228  glutathione S-transferase domain-containing protein  75.22 
 
 		 230 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2252  glutathione S-transferase domain-containing protein  74.78 
 
 		 230 aa  367  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.791972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1954  putative GST-related protein  73.91 
 
 		 255 aa  367  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1616  glutathione S-transferase-like  75.22 
 
 		 230 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2602  glutathione S-transferase domain-containing protein  76.11 
 
 		 231 aa  366  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.550233 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1988  glutathione S-transferase domain-containing protein  71.24 
 
 		 233 aa  357  6e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.601516 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1366  Glutathione S-transferase domain  70.39 
 
 		 233 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202985  hitchhiker  0.00146778 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2303  Glutathione S-transferase domain protein  71.62 
 
 		 234 aa  351  5.9999999999999994e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0188012  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0751  glutathione S-transferase domain-containing protein  69.92 
 
 		 242 aa  347  8e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0134442  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2962  glutathione S-transferase-like  66.24 
 
 		 234 aa  330  8e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.716617  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0300  glutathione S-transferase-like protein  58.7 
 
 		 234 aa  291  8e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0346  glutathione S-transferase domain-containing protein  60.53 
 
 		 231 aa  290  2e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1416  glutathione S-transferase  63.68 
 
 		 230 aa  286  2e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5440  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.84 
 
 		 235 aa  285  5e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.199616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3457  glutathione S-transferase domain-containing protein  59.91 
 
 		 232 aa  284  7e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0220469  normal  0.0243961 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3132  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.7 
 
 		 235 aa  280  2e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188559  normal  0.0740814 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3329  Glutathione S-transferase domain  58.95 
 
 		 235 aa  277  1e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3798  glutathione S-transferase domain-containing protein  60.44 
 
 		 236 aa  276  2e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.59415  normal  0.718162 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3453  Glutathione S-transferase domain  58.08 
 
 		 235 aa  276  2e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2356  glutathione S-transferase domain-containing protein  60.09 
 
 		 231 aa  276  3e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.727095  normal  0.759531 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4693  glutathione S-transferase-like protein  59.03 
 
 		 232 aa  275  5e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50970  glutathione S-transferase  61.14 
 
 		 213 aa  274  8e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.069878  hitchhiker  0.0000421189 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0354  Glutathione S-transferase domain protein  59.03 
 
 		 233 aa  273  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2846  glutathione S-transferase domain-containing protein  60.09 
 
 		 263 aa  273  2.0000000000000002e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.130993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1701  Glutathione S-transferase domain protein  58.22 
 
 		 233 aa  272  3e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2306  Glutathione S-transferase domain protein  56.77 
 
 		 229 aa  272  3e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0027483 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4135  glutathione S-transferase-like  57.14 
 
 		 239 aa  271  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.354502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0662  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.41 
 
 		 233 aa  270  1e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0980  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.56 
 
 		 237 aa  270  1e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0131  glutathione S-transferase domain-containing protein  60.1 
 
 		 208 aa  270  1e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.949199  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4144  glutathione S-transferase-like protein  57.76 
 
 		 235 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.547927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2631  glutathione S-transferase-like  54.74 
 
 		 239 aa  268  5e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.400604  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3866  Glutathione S-transferase domain  56.83 
 
 		 229 aa  268  5.9999999999999995e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4348  glutathione S-transferase  59.72 
 
 		 213 aa  267  8.999999999999999e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1214  glutathione S-transferase-like protein  60.19 
 
 		 214 aa  267  1e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1653  Glutathione S-transferase domain protein  57.94 
 
 		 233 aa  266  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1381  Glutathione S-transferase domain protein  60.58 
 
 		 209 aa  263  1e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0785607  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0442  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.46 
 
 		 233 aa  263  2e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0747669 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0332  glutathione S-transferase-like protein  57.08 
 
 		 229 aa  263  2e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1459  glutathione S-transferase-like protein  57.59 
 
 		 228 aa  262  4e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0619383 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2655  glutathione S-transferase domain-containing protein  56 
 
 		 235 aa  260  1e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185355  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3215  glutathione S-transferase domain-containing protein  56 
 
 		 261 aa  260  1e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.969871  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2563  Glutathione S-transferase domain protein  59.51 
 
 		 209 aa  260  1e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0185641  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4759  glutathione S-transferase domain-containing protein  60.29 
 
 		 211 aa  258  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.895544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5226  Glutathione S-transferase domain  60.29 
 
 		 211 aa  258  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0430433 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5301  Glutathione S-transferase domain  59.8 
 
 		 211 aa  256  2e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2246  glutathione S-transferase-like  55.31 
 
 		 237 aa  255  5e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0687483  normal  0.14056 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0078  Glutathione S-transferase domain  52.61 
 
 		 235 aa  254  9e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.926583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3152  glutathione S-transferase-like  53.57 
 
 		 235 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.194724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3195  Glutathione S-transferase domain  54.82 
 
 		 233 aa  253  2.0000000000000002e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.16528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0624  glutathione S-transferase family protein  55.75 
 
 		 236 aa  253  2.0000000000000002e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3320  glutathione S-transferase domain-containing protein  59.51 
 
 		 209 aa  252  3e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000262213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2476  Glutathione S-transferase domain  52.63 
 
 		 239 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.797585  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0486  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.84 
 
 		 211 aa  251  6e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.302672  normal  0.434346 
 
 
-
 
NC_004310  BR0626  glutathione S-transferase family protein  55.75 
 
 		 236 aa  251  7e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.679166  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02807  glutathione S-transferase  55.07 
 
 		 229 aa  250  1e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3209  glutathione S-transferase-like protein  51.97 
 
 		 239 aa  248  7e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1238  hypothetical protein  53.54 
 
 		 232 aa  247  8e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00464821  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05780  Glutathione S-transferase-like protein  52.86 
 
 		 229 aa  247  1e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.713113  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1526  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.85 
 
 		 241 aa  246  3e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.824932  normal  0.476803 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3416  putative glutathione S-transferase-like protein  53.74 
 
 		 232 aa  244  6e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21646  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3409  putative glutathione S-transferase  53.74 
 
 		 232 aa  244  6e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2851  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.85 
 
 		 207 aa  244  6e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0434229  normal  0.257081 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5178  glutathione S-transferase-like  55.26 
 
 		 232 aa  244  6e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.14205  normal  0.444148 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3373  putative glutathione S-transferase  53.74 
 
 		 232 aa  244  6e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0887626  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0258  putative glutathione S-transferase  53.74 
 
 		 232 aa  244  9e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1120  putative glutathione S-transferase  53.74 
 
 		 232 aa  244  9e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2524  putative glutathione S-transferase  53.74 
 
 		 232 aa  244  9e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1486  glutathione S-transferase  54.15 
 
 		 204 aa  242  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2590  glutathione S-transferase, N- domain  56.16 
 
 		 215 aa  241  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.153757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2699  glutathione S-transferase, N- domain  56.16 
 
 		 215 aa  241  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.100904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2536  glutathione S-transferase, N- domain  56.16 
 
 		 215 aa  241  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0018218  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2578  glutathione S-transferase, N- domain  56.16 
 
 		 215 aa  241  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.539822  normal  0.255018 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2490  glutathione S-transferase, N- domain  56.16 
 
 		 215 aa  241  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00139167  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2784  Glutathione S-transferase domain protein  54.15 
 
 		 208 aa  240  1e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000939416  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1479  Glutathione S-transferase domain protein  55.88 
 
 		 208 aa  240  1e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00108267  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43530  hypothetical protein  56.46 
 
 		 220 aa  240  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02227  predicted glutathione S-transferase  56.16 
 
 		 215 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0437248  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1354  Glutathione S-transferase domain protein  56.16 
 
 		 215 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000942555  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02187  hypothetical protein  56.16 
 
 		 215 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0695509  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2678  glutathione S-transferase  56.16 
 
 		 215 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000401347  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1350  glutathione S-transferase  56.16 
 
 		 215 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0219801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2452  glutathione S-transferase  56.16 
 
 		 215 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2596  glutathione S-transferase  56.16 
 
 		 215 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000860005  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4925  Glutathione S-transferase domain protein  54.19 
 
 		 223 aa  239  4e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18954  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2848  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.42 
 
 		 233 aa  238  5e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0336918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4359  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.19 
 
 		 222 aa  237  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3650  hypothetical protein  55.5 
 
 		 220 aa  236  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.328113  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2458  glutathione S-transferase  55.67 
 
 		 215 aa  236  3e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00690199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3442  glutathione S-transferase  55.67 
 
 		 215 aa  234  8e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000326275  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>