More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2458 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02227  predicted glutathione S-transferase  99.53 
 
 
215 aa  443  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0437248  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1354  Glutathione S-transferase domain protein  99.53 
 
 
215 aa  443  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000942555  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1350  glutathione S-transferase  99.53 
 
 
215 aa  443  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0219801  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2452  glutathione S-transferase  99.53 
 
 
215 aa  443  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2678  glutathione S-transferase  99.53 
 
 
215 aa  443  1.0000000000000001e-124  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000401347  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3442  glutathione S-transferase  99.53 
 
 
215 aa  443  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000326275  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2458  glutathione S-transferase  100 
 
 
215 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00690199  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02187  hypothetical protein  99.53 
 
 
215 aa  443  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0695509  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2596  glutathione S-transferase  99.53 
 
 
215 aa  443  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000860005  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2590  glutathione S-transferase, N- domain  82.69 
 
 
215 aa  356  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.153757  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2490  glutathione S-transferase, N- domain  82.69 
 
 
215 aa  357  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00139167  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2699  glutathione S-transferase, N- domain  82.69 
 
 
215 aa  357  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.100904  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2578  glutathione S-transferase, N- domain  82.69 
 
 
215 aa  357  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.539822  normal  0.255018 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2536  glutathione S-transferase, N- domain  82.21 
 
 
215 aa  354  3.9999999999999996e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0018218  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2851  glutathione S-transferase domain-containing protein  79.23 
 
 
207 aa  344  6e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0434229  normal  0.257081 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2784  Glutathione S-transferase domain protein  71.09 
 
 
208 aa  313  9.999999999999999e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000939416  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3320  glutathione S-transferase domain-containing protein  71.29 
 
 
209 aa  311  6.999999999999999e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000262213  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1479  Glutathione S-transferase domain protein  70.53 
 
 
208 aa  308  2.9999999999999997e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00108267  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1381  Glutathione S-transferase domain protein  71.78 
 
 
209 aa  303  1.0000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0785607  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2563  Glutathione S-transferase domain protein  71.29 
 
 
209 aa  300  8.000000000000001e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0185641  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3132  glutathione S-transferase domain-containing protein  62.62 
 
 
235 aa  272  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188559  normal  0.0740814 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3457  glutathione S-transferase domain-containing protein  63.86 
 
 
232 aa  271  5.000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0220469  normal  0.0243961 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1701  Glutathione S-transferase domain protein  62.8 
 
 
233 aa  271  5.000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4348  glutathione S-transferase  65.35 
 
 
213 aa  271  6e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0980  glutathione S-transferase domain-containing protein  59.91 
 
 
237 aa  270  1e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3866  Glutathione S-transferase domain  61.88 
 
 
229 aa  269  2.9999999999999997e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0346  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.84 
 
 
231 aa  267  1e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05780  Glutathione S-transferase-like protein  63.29 
 
 
229 aa  267  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.713113  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3329  Glutathione S-transferase domain  63.45 
 
 
235 aa  265  4e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50970  glutathione S-transferase  62.87 
 
 
213 aa  265  4e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.069878  hitchhiker  0.0000421189 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2306  Glutathione S-transferase domain protein  63.37 
 
 
229 aa  263  1e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0027483 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4144  glutathione S-transferase-like protein  62.32 
 
 
235 aa  263  1e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.547927  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5440  glutathione S-transferase domain-containing protein  60.19 
 
 
235 aa  263  2e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.199616  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3453  Glutathione S-transferase domain  62.76 
 
 
235 aa  262  2e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1214  glutathione S-transferase-like protein  60.87 
 
 
214 aa  260  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1238  hypothetical protein  60.39 
 
 
232 aa  260  1e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00464821  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3215  glutathione S-transferase domain-containing protein  60.89 
 
 
261 aa  260  1e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.969871  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0442  glutathione S-transferase domain-containing protein  62.94 
 
 
233 aa  259  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0747669 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1653  Glutathione S-transferase domain protein  61.93 
 
 
233 aa  258  4e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02807  glutathione S-transferase  59.81 
 
 
229 aa  258  5.0000000000000005e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0354  Glutathione S-transferase domain protein  60.68 
 
 
233 aa  257  8e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4135  glutathione S-transferase-like  59.22 
 
 
239 aa  256  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.354502  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3373  putative glutathione S-transferase  60.1 
 
 
232 aa  255  3e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0887626  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3409  putative glutathione S-transferase  60.1 
 
 
232 aa  255  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3416  putative glutathione S-transferase-like protein  60.1 
 
 
232 aa  255  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21646  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2356  glutathione S-transferase domain-containing protein  59.43 
 
 
231 aa  255  3e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.727095  normal  0.759531 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4693  glutathione S-transferase-like protein  59.42 
 
 
232 aa  253  1.0000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5178  glutathione S-transferase-like  58.42 
 
 
232 aa  252  3e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.14205  normal  0.444148 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1120  putative glutathione S-transferase  59.62 
 
 
232 aa  251  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2524  putative glutathione S-transferase  59.62 
 
 
232 aa  251  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0258  putative glutathione S-transferase  59.62 
 
 
232 aa  251  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3195  Glutathione S-transferase domain  58.91 
 
 
233 aa  246  2e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.16528  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2021  putative GST-related protein  57.75 
 
 
230 aa  245  4e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.398836  normal  0.122618 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3209  glutathione S-transferase-like protein  57.36 
 
 
239 aa  241  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1049  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.5 
 
 
230 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104834  normal  0.267684 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2476  Glutathione S-transferase domain  53.49 
 
 
239 aa  239  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.797585  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2178  Glutathione S-transferase domain  57.14 
 
 
230 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0564194 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2266  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.05 
 
 
230 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2145  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.05 
 
 
230 aa  238  4e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0715733  normal  0.478827 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0078  Glutathione S-transferase domain  55.94 
 
 
235 aa  238  5e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.926583  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2631  glutathione S-transferase-like  55.77 
 
 
239 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.400604  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5265  putative glutathione transferase  55.05 
 
 
234 aa  237  8e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0071298  normal  0.528332 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1616  glutathione S-transferase-like  55.05 
 
 
230 aa  237  9e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2228  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.05 
 
 
230 aa  237  9e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3771  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.25 
 
 
230 aa  237  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.680155  normal  0.387546 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2246  glutathione S-transferase-like  55.84 
 
 
237 aa  237  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0687483  normal  0.14056 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1855  Glutathione S-transferase domain protein  55.67 
 
 
230 aa  236  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.619929  normal  0.146027 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5556  glutathione S-transferase-like protein  54.59 
 
 
230 aa  236  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1366  Glutathione S-transferase domain  56.72 
 
 
233 aa  236  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202985  hitchhiker  0.00146778 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2252  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.59 
 
 
230 aa  235  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.791972  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2602  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.65 
 
 
231 aa  234  1.0000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.550233 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0332  glutathione S-transferase-like protein  54.17 
 
 
229 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0300  glutathione S-transferase-like protein  55.45 
 
 
234 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3152  glutathione S-transferase-like  56.35 
 
 
235 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.194724  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1954  putative GST-related protein  54.59 
 
 
255 aa  228  7e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0967  glutathione S-transferase-like protein  53.2 
 
 
230 aa  226  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00253605  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3798  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.95 
 
 
236 aa  224  5.0000000000000005e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.59415  normal  0.718162 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1001  glutathione S-transferase  53.2 
 
 
230 aa  223  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2303  Glutathione S-transferase domain protein  54.95 
 
 
234 aa  223  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0188012  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1988  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.15 
 
 
233 aa  222  4e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.601516 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0751  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.15 
 
 
242 aa  220  9.999999999999999e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0134442  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2846  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.55 
 
 
263 aa  216  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.130993  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0626  glutathione S-transferase family protein  50 
 
 
236 aa  214  8e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.679166  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1459  glutathione S-transferase-like protein  53.77 
 
 
228 aa  214  9e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0619383 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4359  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.53 
 
 
222 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0131  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.63 
 
 
208 aa  213  1.9999999999999998e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.949199  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2962  glutathione S-transferase-like  50 
 
 
234 aa  213  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.716617  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0624  glutathione S-transferase family protein  49.53 
 
 
236 aa  213  2.9999999999999995e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1416  glutathione S-transferase  50.93 
 
 
230 aa  212  3.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0662  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.48 
 
 
233 aa  212  3.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2655  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.83 
 
 
235 aa  210  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185355  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1087  glutathione S-transferase family protein  50.74 
 
 
222 aa  207  7e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.983271 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0486  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.48 
 
 
211 aa  207  9e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.302672  normal  0.434346 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1641  Glutathione S-transferase domain protein  46.83 
 
 
240 aa  206  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.606226  normal  0.332972 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1526  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.43 
 
 
241 aa  204  7e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.824932  normal  0.476803 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4938  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.66 
 
 
210 aa  204  7e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2848  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.48 
 
 
233 aa  204  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0336918  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5301  Glutathione S-transferase domain  52.48 
 
 
211 aa  204  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4437  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.46 
 
 
206 aa  203  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5226  Glutathione S-transferase domain  52.48 
 
 
211 aa  203  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0430433 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>