More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2846 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_2846  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 
263 aa  542  1e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.130993  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1416  glutathione S-transferase  73.28 
 
 
230 aa  357  9.999999999999999e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3798  glutathione S-transferase domain-containing protein  69.36 
 
 
236 aa  342  2.9999999999999997e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.59415  normal  0.718162 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0662  glutathione S-transferase domain-containing protein  68.1 
 
 
233 aa  334  7e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1526  glutathione S-transferase domain-containing protein  66.11 
 
 
241 aa  333  2e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.824932  normal  0.476803 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0624  glutathione S-transferase family protein  66.1 
 
 
236 aa  325  3e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0626  glutathione S-transferase family protein  66.1 
 
 
236 aa  324  8.000000000000001e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.679166  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2655  glutathione S-transferase domain-containing protein  65.82 
 
 
235 aa  324  8.000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185355  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0332  glutathione S-transferase-like protein  63.64 
 
 
229 aa  305  6e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4135  glutathione S-transferase-like  61.11 
 
 
239 aa  295  3e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.354502  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4144  glutathione S-transferase-like protein  62.5 
 
 
235 aa  293  1e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.547927  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2356  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.47 
 
 
231 aa  292  4e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.727095  normal  0.759531 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0354  Glutathione S-transferase domain protein  60.78 
 
 
233 aa  287  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4759  glutathione S-transferase domain-containing protein  63.9 
 
 
211 aa  286  2e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.895544  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5226  Glutathione S-transferase domain  63.9 
 
 
211 aa  286  2e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0430433 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5301  Glutathione S-transferase domain  63.9 
 
 
211 aa  285  4e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0346  glutathione S-transferase domain-containing protein  60.26 
 
 
231 aa  285  7e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0486  glutathione S-transferase domain-containing protein  62.56 
 
 
211 aa  280  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.302672  normal  0.434346 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2246  glutathione S-transferase-like  59.91 
 
 
237 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0687483  normal  0.14056 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3215  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.21 
 
 
261 aa  279  3e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.969871  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1701  Glutathione S-transferase domain protein  60.78 
 
 
233 aa  279  4e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5440  glutathione S-transferase domain-containing protein  60 
 
 
235 aa  278  6e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.199616  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4693  glutathione S-transferase-like protein  56.9 
 
 
232 aa  278  8e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2306  Glutathione S-transferase domain protein  60.7 
 
 
229 aa  277  1e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0027483 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0300  glutathione S-transferase-like protein  54.74 
 
 
234 aa  277  1e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3373  putative glutathione S-transferase  58.8 
 
 
232 aa  276  3e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0887626  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3416  putative glutathione S-transferase-like protein  58.8 
 
 
232 aa  276  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21646  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3409  putative glutathione S-transferase  58.8 
 
 
232 aa  276  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3132  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.19 
 
 
235 aa  275  6e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188559  normal  0.0740814 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0258  putative glutathione S-transferase  58.8 
 
 
232 aa  275  8e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2524  putative glutathione S-transferase  58.8 
 
 
232 aa  275  8e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1120  putative glutathione S-transferase  58.8 
 
 
232 aa  275  8e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3457  glutathione S-transferase domain-containing protein  60.61 
 
 
232 aa  274  1.0000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0220469  normal  0.0243961 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2303  Glutathione S-transferase domain protein  56.9 
 
 
234 aa  273  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0188012  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1238  hypothetical protein  58.19 
 
 
232 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00464821  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1855  Glutathione S-transferase domain protein  60.09 
 
 
230 aa  273  3e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.619929  normal  0.146027 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0967  glutathione S-transferase-like protein  57.89 
 
 
230 aa  271  8.000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00253605  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2178  Glutathione S-transferase domain  59.65 
 
 
230 aa  270  1e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0564194 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3771  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.77 
 
 
230 aa  270  1e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.680155  normal  0.387546 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2602  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.52 
 
 
231 aa  270  2.9999999999999997e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.550233 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2631  glutathione S-transferase-like  58.97 
 
 
239 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.400604  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2476  Glutathione S-transferase domain  58.08 
 
 
239 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.797585  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0442  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.62 
 
 
233 aa  269  4e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0747669 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3329  Glutathione S-transferase domain  58.19 
 
 
235 aa  267  1e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1001  glutathione S-transferase  57.02 
 
 
230 aa  267  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1653  Glutathione S-transferase domain protein  58.37 
 
 
233 aa  267  1e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1954  putative GST-related protein  57.46 
 
 
255 aa  267  1e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2021  putative GST-related protein  58.77 
 
 
230 aa  266  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.398836  normal  0.122618 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2407  putative glutathione S-transferase  60.48 
 
 
235 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00274689  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5556  glutathione S-transferase-like protein  56.58 
 
 
230 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3209  glutathione S-transferase-like protein  56.52 
 
 
239 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0980  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.14 
 
 
237 aa  265  5.999999999999999e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3453  Glutathione S-transferase domain  57.76 
 
 
235 aa  265  7e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5178  glutathione S-transferase-like  55.98 
 
 
232 aa  263  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.14205  normal  0.444148 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2266  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.02 
 
 
230 aa  263  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05780  Glutathione S-transferase-like protein  56.09 
 
 
229 aa  263  3e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.713113  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2145  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.02 
 
 
230 aa  262  4e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0715733  normal  0.478827 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3195  Glutathione S-transferase domain  60.66 
 
 
233 aa  261  6.999999999999999e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.16528  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2252  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.14 
 
 
230 aa  260  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.791972  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1616  glutathione S-transferase-like  56.14 
 
 
230 aa  260  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2228  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.14 
 
 
230 aa  260  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1049  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.26 
 
 
230 aa  259  3e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104834  normal  0.267684 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4925  Glutathione S-transferase domain protein  58.33 
 
 
223 aa  258  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18954  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3866  Glutathione S-transferase domain  56.71 
 
 
229 aa  253  2.0000000000000002e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4348  glutathione S-transferase  59.31 
 
 
213 aa  253  3e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0751  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.14 
 
 
242 aa  253  3e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0134442  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1214  glutathione S-transferase-like protein  60.29 
 
 
214 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50970  glutathione S-transferase  59.31 
 
 
213 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.069878  hitchhiker  0.0000421189 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2962  glutathione S-transferase-like  54.51 
 
 
234 aa  251  6e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.716617  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4359  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.33 
 
 
222 aa  251  9.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3152  glutathione S-transferase-like  52.81 
 
 
235 aa  249  5e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.194724  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1988  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.68 
 
 
233 aa  247  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.601516 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1366  Glutathione S-transferase domain  53.68 
 
 
233 aa  246  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202985  hitchhiker  0.00146778 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1641  Glutathione S-transferase domain protein  54.24 
 
 
240 aa  247  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.606226  normal  0.332972 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0078  Glutathione S-transferase domain  51.71 
 
 
235 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.926583  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1459  glutathione S-transferase-like protein  50.87 
 
 
228 aa  241  7.999999999999999e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0619383 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2563  Glutathione S-transferase domain protein  54.11 
 
 
209 aa  239  2e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0185641  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5265  putative glutathione transferase  52.99 
 
 
234 aa  238  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0071298  normal  0.528332 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02807  glutathione S-transferase  52.79 
 
 
229 aa  238  1e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1381  Glutathione S-transferase domain protein  54.63 
 
 
209 aa  231  6e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0785607  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4437  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.19 
 
 
206 aa  228  6e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2784  Glutathione S-transferase domain protein  53.14 
 
 
208 aa  228  6e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000939416  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4163  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.78 
 
 
227 aa  228  8e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.301495 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3320  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.11 
 
 
209 aa  228  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000262213  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3353  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.72 
 
 
208 aa  224  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000179296 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1479  Glutathione S-transferase domain protein  54.46 
 
 
208 aa  224  1e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00108267  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2851  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.48 
 
 
207 aa  221  9.999999999999999e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0434229  normal  0.257081 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1664  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.31 
 
 
240 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.44689 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2590  glutathione S-transferase, N- domain  52.48 
 
 
215 aa  217  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.153757  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2490  glutathione S-transferase, N- domain  52.48 
 
 
215 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00139167  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2578  glutathione S-transferase, N- domain  52.48 
 
 
215 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.539822  normal  0.255018 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2536  glutathione S-transferase, N- domain  52.48 
 
 
215 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0018218  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7359  putative glutathione S-transferase  53.23 
 
 
208 aa  216  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.787949  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2699  glutathione S-transferase, N- domain  52.48 
 
 
215 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.100904  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1354  Glutathione S-transferase domain protein  49.55 
 
 
215 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000942555  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02187  hypothetical protein  49.55 
 
 
215 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0695509  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2678  glutathione S-transferase  49.55 
 
 
215 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000401347  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2458  glutathione S-transferase  49.55 
 
 
215 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00690199  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2452  glutathione S-transferase  49.55 
 
 
215 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1350  glutathione S-transferase  49.55 
 
 
215 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0219801  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>