More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3983 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3983  glutathione S-transferase-like  100 
 
 		 219 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.409574  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00663  Glutathione S-transferase  73.97 
 
 		 219 aa  350  1e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3650  hypothetical protein  63.18 
 
 		 220 aa  300  1e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.328113  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43530  hypothetical protein  63.18 
 
 		 220 aa  300  1e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1576  glutathione S-transferase family protein  64.86 
 
 		 222 aa  297  8e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0528  putative glutathione S-transferase  63.96 
 
 		 222 aa  296  1e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1087  glutathione S-transferase family protein  65.32 
 
 		 222 aa  296  2e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.983271 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0906  hypothetical protein  62.16 
 
 		 228 aa  295  3e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.719726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2764  glutathione S-transferase domain-containing protein  63.51 
 
 		 222 aa  294  8e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2866  glutathione S-transferase domain-containing protein  63.51 
 
 		 222 aa  293  1e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0201506 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2696  glutathione S-transferase domain-containing protein  63.51 
 
 		 222 aa  293  1e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036581 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1349  Glutathione S-transferase domain protein  66.17 
 
 		 236 aa  292  3e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3292  putative glutathione S-transferase  62.44 
 
 		 222 aa  285  2.9999999999999996e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000024408 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2966  Glutathione S-transferase domain protein  61.26 
 
 		 222 aa  285  5e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.183097  normal  0.112262 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1306  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.26 
 
 		 222 aa  285  5e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1393  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.26 
 
 		 222 aa  285  5e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1416  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.26 
 
 		 222 aa  285  5e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1377  glutathione S-transferase domain-containing protein  60.81 
 
 		 222 aa  282  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.682685  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3435  glutathione S-transferase domain-containing protein  63.98 
 
 		 222 aa  282  3.0000000000000004e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.288694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3152  glutathione S-transferase-like  50.98 
 
 		 235 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.194724  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1855  Glutathione S-transferase domain protein  50.98 
 
 		 230 aa  212  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.619929  normal  0.146027 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1001  glutathione S-transferase  50 
 
 		 230 aa  208  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2178  Glutathione S-transferase domain  50 
 
 		 230 aa  207  8e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0564194 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2021  putative GST-related protein  47.6 
 
 		 230 aa  207  1e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.398836  normal  0.122618 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0831  Glutathione S-transferase domain protein  50.25 
 
 		 227 aa  206  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0286662 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1366  Glutathione S-transferase domain  48.31 
 
 		 233 aa  205  4e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202985  hitchhiker  0.00146778 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5556  glutathione S-transferase-like protein  48.04 
 
 		 230 aa  203  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2246  glutathione S-transferase-like  45.7 
 
 		 237 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0687483  normal  0.14056 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2440  glutathione S-transferase-like  49.01 
 
 		 239 aa  203  2e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2848  glutathione S-transferase domain-containing protein  50 
 
 		 233 aa  202  4e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0336918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3457  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.28 
 
 		 232 aa  201  7e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0220469  normal  0.0243961 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0346  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.76 
 
 		 231 aa  201  7e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2476  Glutathione S-transferase domain  45.25 
 
 		 239 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.797585  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2145  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.06 
 
 		 230 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0715733  normal  0.478827 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0967  glutathione S-transferase-like protein  47.27 
 
 		 230 aa  200  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00253605  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1616  glutathione S-transferase-like  46.57 
 
 		 230 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2306  Glutathione S-transferase domain protein  47.03 
 
 		 229 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0027483 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2228  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.57 
 
 		 230 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3209  glutathione S-transferase-like protein  45.25 
 
 		 239 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1049  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.06 
 
 		 230 aa  199  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104834  normal  0.267684 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2631  glutathione S-transferase-like  50 
 
 		 239 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.400604  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2266  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.57 
 
 		 230 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1214  glutathione S-transferase-like protein  49.52 
 
 		 214 aa  198  5e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2252  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.08 
 
 		 230 aa  198  6e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.791972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1931  glutathione S-transferase-like  47.09 
 
 		 227 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.548624 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4348  glutathione S-transferase  48.57 
 
 		 213 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1954  putative GST-related protein  49.02 
 
 		 255 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02807  glutathione S-transferase  49.52 
 
 		 229 aa  196  3e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3866  Glutathione S-transferase domain  46.67 
 
 		 229 aa  195  5.000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5791  glutathione S-transferase  47.44 
 
 		 236 aa  195  5.000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0354  Glutathione S-transferase domain protein  46.01 
 
 		 233 aa  194  7e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1988  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.34 
 
 		 233 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.601516 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00391  glutathione S-transferase  47.29 
 
 		 255 aa  194  1e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1701  Glutathione S-transferase domain protein  46.79 
 
 		 233 aa  194  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2602  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.55 
 
 		 231 aa  193  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.550233 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0332  glutathione S-transferase-like protein  45.75 
 
 		 229 aa  192  3e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50970  glutathione S-transferase  46.67 
 
 		 213 aa  192  4e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.069878  hitchhiker  0.0000421189 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3771  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.04 
 
 		 230 aa  191  7e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.680155  normal  0.387546 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0131  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.55 
 
 		 208 aa  191  8e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.949199  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2303  Glutathione S-transferase domain protein  48.77 
 
 		 234 aa  191  9e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0188012  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5265  putative glutathione transferase  47.09 
 
 		 234 aa  191  9e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0071298  normal  0.528332 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4693  glutathione S-transferase-like protein  48.98 
 
 		 232 aa  190  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5178  glutathione S-transferase-like  48.1 
 
 		 232 aa  189  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.14205  normal  0.444148 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1416  glutathione S-transferase  48.51 
 
 		 230 aa  189  4e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4135  glutathione S-transferase-like  48.5 
 
 		 239 aa  188  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.354502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3329  Glutathione S-transferase domain  49.75 
 
 		 235 aa  189  4e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5440  glutathione S-transferase domain-containing protein  49 
 
 		 235 aa  188  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.199616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1486  glutathione S-transferase  48.04 
 
 		 204 aa  188  5.999999999999999e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2563  Glutathione S-transferase domain protein  46.34 
 
 		 209 aa  188  5.999999999999999e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0185641  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3215  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.05 
 
 		 261 aa  187  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.969871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4759  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.74 
 
 		 211 aa  187  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.895544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5226  Glutathione S-transferase domain  47.74 
 
 		 211 aa  187  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0430433 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1653  Glutathione S-transferase domain protein  45.74 
 
 		 233 aa  187  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5301  Glutathione S-transferase domain  46.73 
 
 		 211 aa  186  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2356  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.93 
 
 		 231 aa  186  3e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.727095  normal  0.759531 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4359  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.31 
 
 		 222 aa  186  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4144  glutathione S-transferase-like protein  48.47 
 
 		 235 aa  184  9e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.547927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0486  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.23 
 
 		 211 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.302672  normal  0.434346 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1381  Glutathione S-transferase domain protein  43.75 
 
 		 209 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0785607  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3132  glutathione S-transferase domain-containing protein  48 
 
 		 235 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188559  normal  0.0740814 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05780  Glutathione S-transferase-like protein  45.02 
 
 		 229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.713113  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3453  Glutathione S-transferase domain  48.47 
 
 		 235 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1633  Glutathione S-transferase domain protein  45.77 
 
 		 209 aa  182  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0604815 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2407  putative glutathione S-transferase  48.04 
 
 		 235 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00274689  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI04380  glutathione S-transferase, putative  44.44 
 
 		 275 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.276311  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0078  Glutathione S-transferase domain  45.05 
 
 		 235 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.926583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0662  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.04 
 
 		 233 aa  181  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0751  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.67 
 
 		 242 aa  179  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0134442  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3798  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.54 
 
 		 236 aa  180  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.59415  normal  0.718162 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2655  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.69 
 
 		 235 aa  179  4e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185355  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0442  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.39 
 
 		 233 aa  178  4.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0747669 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04905  Putative uncharacterized proteinTheta class glutathione S-transferase ;(EC 2.5.1.18) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJZ8]  46.15 
 
 		 302 aa  178  5.999999999999999e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0318236  normal  0.302303 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0300  glutathione S-transferase-like protein  43.35 
 
 		 234 aa  178  7e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2784  Glutathione S-transferase domain protein  42.79 
 
 		 208 aa  177  8e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000939416  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1459  glutathione S-transferase-like protein  42.4 
 
 		 228 aa  177  8e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0619383 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4163  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.55 
 
 		 227 aa  177  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.301495 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0980  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.78 
 
 		 237 aa  176  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0097  glutathione S-transferase-like  45.97 
 
 		 234 aa  176  3e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.472902  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2962  glutathione S-transferase-like  45.67 
 
 		 234 aa  175  5e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.716617  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7359  putative glutathione S-transferase  47.03 
 
 		 208 aa  175  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.787949  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>