More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3292 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3292  putative glutathione S-transferase  100 
 
 		 222 aa  461  1e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000024408 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2966  Glutathione S-transferase domain protein  78.38 
 
 		 222 aa  370  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.183097  normal  0.112262 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1416  glutathione S-transferase domain-containing protein  77.93 
 
 		 222 aa  370  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1393  glutathione S-transferase domain-containing protein  78.38 
 
 		 222 aa  370  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2866  glutathione S-transferase domain-containing protein  78.83 
 
 		 222 aa  371  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0201506 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3435  glutathione S-transferase domain-containing protein  77.83 
 
 		 222 aa  373  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.288694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2764  glutathione S-transferase domain-containing protein  78.38 
 
 		 222 aa  370  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1377  glutathione S-transferase domain-containing protein  77.93 
 
 		 222 aa  368  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.682685  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1306  glutathione S-transferase domain-containing protein  77.93 
 
 		 222 aa  368  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2696  glutathione S-transferase domain-containing protein  77.93 
 
 		 222 aa  367  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036581 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1576  glutathione S-transferase family protein  76.58 
 
 		 222 aa  366  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1087  glutathione S-transferase family protein  73.76 
 
 		 222 aa  345  2e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.983271 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0528  putative glutathione S-transferase  70.59 
 
 		 222 aa  331  6e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43530  hypothetical protein  66.34 
 
 		 220 aa  289  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3650  hypothetical protein  65.84 
 
 		 220 aa  287  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.328113  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3983  glutathione S-transferase-like  62.44 
 
 		 219 aa  285  2.9999999999999996e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.409574  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00663  Glutathione S-transferase  60.36 
 
 		 219 aa  282  4.0000000000000003e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1349  Glutathione S-transferase domain protein  61.67 
 
 		 236 aa  280  1e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0906  hypothetical protein  60.87 
 
 		 228 aa  266  2e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.719726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5556  glutathione S-transferase-like protein  53.47 
 
 		 230 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2228  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.97 
 
 		 230 aa  228  5e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2252  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.97 
 
 		 230 aa  228  5e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.791972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1616  glutathione S-transferase-like  52.97 
 
 		 230 aa  228  5e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2266  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.97 
 
 		 230 aa  228  6e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2145  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.97 
 
 		 230 aa  228  8e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0715733  normal  0.478827 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2602  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.47 
 
 		 231 aa  227  1e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.550233 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1954  putative GST-related protein  50.22 
 
 		 255 aa  226  3e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1366  Glutathione S-transferase domain  49.33 
 
 		 233 aa  224  7e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202985  hitchhiker  0.00146778 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1049  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.98 
 
 		 230 aa  223  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104834  normal  0.267684 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0967  glutathione S-transferase-like protein  51.98 
 
 		 230 aa  221  4.9999999999999996e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00253605  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1988  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.33 
 
 		 233 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.601516 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2021  putative GST-related protein  50.5 
 
 		 230 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.398836  normal  0.122618 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1855  Glutathione S-transferase domain protein  48.18 
 
 		 230 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.619929  normal  0.146027 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3771  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.64 
 
 		 230 aa  218  3.9999999999999997e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.680155  normal  0.387546 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4348  glutathione S-transferase  50.23 
 
 		 213 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1001  glutathione S-transferase  49.55 
 
 		 230 aa  218  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2178  Glutathione S-transferase domain  50.5 
 
 		 230 aa  218  5e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0564194 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3457  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.21 
 
 		 232 aa  217  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0220469  normal  0.0243961 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0831  Glutathione S-transferase domain protein  55 
 
 		 227 aa  216  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0286662 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3866  Glutathione S-transferase domain  48.87 
 
 		 229 aa  216  2e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0354  Glutathione S-transferase domain protein  51.74 
 
 		 233 aa  216  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00391  glutathione S-transferase  53.17 
 
 		 255 aa  216  2e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2303  Glutathione S-transferase domain protein  53.23 
 
 		 234 aa  216  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0188012  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2440  glutathione S-transferase-like  52.94 
 
 		 239 aa  216  2.9999999999999998e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0346  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.49 
 
 		 231 aa  214  5.9999999999999996e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2246  glutathione S-transferase-like  48.67 
 
 		 237 aa  214  9e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0687483  normal  0.14056 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1214  glutathione S-transferase-like protein  49.07 
 
 		 214 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5265  putative glutathione transferase  51.96 
 
 		 234 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0071298  normal  0.528332 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50970  glutathione S-transferase  49.5 
 
 		 213 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.069878  hitchhiker  0.0000421189 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3152  glutathione S-transferase-like  49.55 
 
 		 235 aa  210  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.194724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0980  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.7 
 
 		 237 aa  210  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2962  glutathione S-transferase-like  48.06 
 
 		 234 aa  209  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.716617  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3209  glutathione S-transferase-like protein  46.82 
 
 		 239 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0131  glutathione S-transferase domain-containing protein  50 
 
 		 208 aa  206  2e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.949199  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0300  glutathione S-transferase-like protein  45.05 
 
 		 234 aa  206  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2306  Glutathione S-transferase domain protein  51.49 
 
 		 229 aa  206  2e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0027483 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1381  Glutathione S-transferase domain protein  47.03 
 
 		 209 aa  206  3e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0785607  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2563  Glutathione S-transferase domain protein  48.51 
 
 		 209 aa  206  3e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0185641  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2631  glutathione S-transferase-like  47.98 
 
 		 239 aa  205  4e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.400604  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2784  Glutathione S-transferase domain protein  48.02 
 
 		 208 aa  205  5e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000939416  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2356  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.01 
 
 		 231 aa  205  5e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.727095  normal  0.759531 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4144  glutathione S-transferase-like protein  50.25 
 
 		 235 aa  205  5e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.547927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4135  glutathione S-transferase-like  49.75 
 
 		 239 aa  204  7e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.354502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3625  glutathione S-transferase-like  48.5 
 
 		 215 aa  204  9e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0643687  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4742  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.5 
 
 		 215 aa  204  9e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.917928  hitchhiker  0.00649205 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4693  glutathione S-transferase-like protein  51.01 
 
 		 232 aa  203  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1010  glutathione S-transferase-like protein  48.31 
 
 		 215 aa  203  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0403399  normal  0.226457 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2458  glutathione S-transferase  47.55 
 
 		 215 aa  203  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00690199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02807  glutathione S-transferase  47.96 
 
 		 229 aa  203  2e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3442  glutathione S-transferase  47.55 
 
 		 215 aa  203  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000326275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2476  Glutathione S-transferase domain  45.91 
 
 		 239 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.797585  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3132  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.5 
 
 		 235 aa  202  3e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188559  normal  0.0740814 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1701  Glutathione S-transferase domain protein  47.53 
 
 		 233 aa  201  5e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3329  Glutathione S-transferase domain  50.25 
 
 		 235 aa  202  5e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0751  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.03 
 
 		 242 aa  201  6e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0134442  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5541  glutathione S-transferase domain-containing protein  48 
 
 		 215 aa  201  7e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1416  glutathione S-transferase  49.55 
 
 		 230 aa  201  9e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5178  glutathione S-transferase-like  49.75 
 
 		 232 aa  200  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.14205  normal  0.444148 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02227  predicted glutathione S-transferase  47.06 
 
 		 215 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0437248  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1354  Glutathione S-transferase domain protein  47.06 
 
 		 215 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000942555  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2851  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.83 
 
 		 207 aa  200  1.9999999999999998e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0434229  normal  0.257081 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1350  glutathione S-transferase  47.06 
 
 		 215 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0219801  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02187  hypothetical protein  47.06 
 
 		 215 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0695509  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2590  glutathione S-transferase, N- domain  45.1 
 
 		 215 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.153757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2678  glutathione S-transferase  47.06 
 
 		 215 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000401347  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2452  glutathione S-transferase  47.06 
 
 		 215 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2536  glutathione S-transferase, N- domain  45.1 
 
 		 215 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0018218  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2596  glutathione S-transferase  47.06 
 
 		 215 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000860005  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0078  Glutathione S-transferase domain  47.26 
 
 		 235 aa  199  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.926583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2578  glutathione S-transferase, N- domain  45.1 
 
 		 215 aa  199  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.539822  normal  0.255018 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2490  glutathione S-transferase, N- domain  45.1 
 
 		 215 aa  199  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00139167  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2699  glutathione S-transferase, N- domain  45.1 
 
 		 215 aa  199  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.100904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3215  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.5 
 
 		 261 aa  199  3e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.969871  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05780  Glutathione S-transferase-like protein  50.5 
 
 		 229 aa  199  3.9999999999999996e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.713113  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2848  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.28 
 
 		 233 aa  199  3.9999999999999996e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0336918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5791  glutathione S-transferase  48.13 
 
 		 236 aa  198  5e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5440  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.38 
 
 		 235 aa  198  6e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.199616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3453  Glutathione S-transferase domain  49.49 
 
 		 235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5301  Glutathione S-transferase domain  47.29 
 
 		 211 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0442  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.72 
 
 		 233 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0747669 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>