More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2696 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2696  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 
222 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036581 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2764  glutathione S-transferase domain-containing protein  99.1 
 
 
222 aa  460  1e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2866  glutathione S-transferase domain-containing protein  98.65 
 
 
222 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0201506 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1576  glutathione S-transferase family protein  94.59 
 
 
222 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2966  Glutathione S-transferase domain protein  94.59 
 
 
222 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.183097  normal  0.112262 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1393  glutathione S-transferase domain-containing protein  94.59 
 
 
222 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1416  glutathione S-transferase domain-containing protein  94.14 
 
 
222 aa  441  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1306  glutathione S-transferase domain-containing protein  93.69 
 
 
222 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1377  glutathione S-transferase domain-containing protein  94.14 
 
 
222 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.682685  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3435  glutathione S-transferase domain-containing protein  80.63 
 
 
222 aa  388  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.288694  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0528  putative glutathione S-transferase  78.38 
 
 
222 aa  374  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1087  glutathione S-transferase family protein  78.38 
 
 
222 aa  372  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.983271 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3292  putative glutathione S-transferase  77.93 
 
 
222 aa  367  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000024408 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43530  hypothetical protein  65.77 
 
 
220 aa  312  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3650  hypothetical protein  65.32 
 
 
220 aa  308  4e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.328113  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1349  Glutathione S-transferase domain protein  64.13 
 
 
236 aa  298  5e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3983  glutathione S-transferase-like  63.51 
 
 
219 aa  293  1e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.409574  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0906  hypothetical protein  62.56 
 
 
228 aa  290  1e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.719726  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00663  Glutathione S-transferase  59.91 
 
 
219 aa  280  1e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5556  glutathione S-transferase-like protein  54.3 
 
 
230 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1366  Glutathione S-transferase domain  55.12 
 
 
233 aa  239  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202985  hitchhiker  0.00146778 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1616  glutathione S-transferase-like  52.94 
 
 
230 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2228  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.94 
 
 
230 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2145  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.94 
 
 
230 aa  235  3e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0715733  normal  0.478827 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2266  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.94 
 
 
230 aa  236  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2252  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.04 
 
 
230 aa  234  8e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.791972  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0967  glutathione S-transferase-like protein  53.47 
 
 
230 aa  231  5e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00253605  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2602  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.46 
 
 
231 aa  231  6e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.550233 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1988  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.67 
 
 
233 aa  229  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.601516 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3771  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.31 
 
 
230 aa  229  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.680155  normal  0.387546 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1001  glutathione S-transferase  52.97 
 
 
230 aa  229  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1049  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.13 
 
 
230 aa  229  3e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104834  normal  0.267684 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0831  Glutathione S-transferase domain protein  56 
 
 
227 aa  226  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0286662 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2178  Glutathione S-transferase domain  51.58 
 
 
230 aa  227  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0564194 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2021  putative GST-related protein  53.47 
 
 
230 aa  226  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.398836  normal  0.122618 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1954  putative GST-related protein  54.46 
 
 
255 aa  226  2e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3152  glutathione S-transferase-like  50.45 
 
 
235 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.194724  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3866  Glutathione S-transferase domain  50.9 
 
 
229 aa  226  3e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1855  Glutathione S-transferase domain protein  49.77 
 
 
230 aa  223  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.619929  normal  0.146027 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0131  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.94 
 
 
208 aa  222  4e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.949199  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4348  glutathione S-transferase  52.48 
 
 
213 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3457  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.49 
 
 
232 aa  219  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0220469  normal  0.0243961 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5265  putative glutathione transferase  52.68 
 
 
234 aa  219  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0071298  normal  0.528332 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0346  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.68 
 
 
231 aa  219  3.9999999999999997e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1214  glutathione S-transferase-like protein  52.48 
 
 
214 aa  218  7e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1381  Glutathione S-transferase domain protein  49.5 
 
 
209 aa  216  2e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0785607  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2440  glutathione S-transferase-like  51.46 
 
 
239 aa  216  2e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2631  glutathione S-transferase-like  51.96 
 
 
239 aa  215  4e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.400604  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50970  glutathione S-transferase  50 
 
 
213 aa  215  4e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.069878  hitchhiker  0.0000421189 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2563  Glutathione S-transferase domain protein  50.5 
 
 
209 aa  215  5e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0185641  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2848  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.43 
 
 
233 aa  215  5e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0336918  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00391  glutathione S-transferase  50.72 
 
 
255 aa  214  5.9999999999999996e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2246  glutathione S-transferase-like  49.02 
 
 
237 aa  214  8e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0687483  normal  0.14056 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3209  glutathione S-transferase-like protein  46.46 
 
 
239 aa  214  9e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0406  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.83 
 
 
235 aa  212  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.157624  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2303  Glutathione S-transferase domain protein  51.74 
 
 
234 aa  211  4.9999999999999996e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0188012  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2476  Glutathione S-transferase domain  46.46 
 
 
239 aa  211  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.797585  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5791  glutathione S-transferase  51.4 
 
 
236 aa  210  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0354  Glutathione S-transferase domain protein  50.75 
 
 
233 aa  208  5e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2356  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.5 
 
 
231 aa  208  6e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.727095  normal  0.759531 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1486  glutathione S-transferase  50 
 
 
204 aa  206  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3320  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.52 
 
 
209 aa  206  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000262213  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2851  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.78 
 
 
207 aa  206  3e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0434229  normal  0.257081 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0980  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.02 
 
 
237 aa  205  4e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0332  glutathione S-transferase-like protein  50 
 
 
229 aa  205  4e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02807  glutathione S-transferase  47.81 
 
 
229 aa  205  5e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3329  Glutathione S-transferase domain  50.25 
 
 
235 aa  204  8e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0078  Glutathione S-transferase domain  48.26 
 
 
235 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.926583  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3132  glutathione S-transferase domain-containing protein  49 
 
 
235 aa  203  1e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188559  normal  0.0740814 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04905  Putative uncharacterized proteinTheta class glutathione S-transferase ;(EC 2.5.1.18) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJZ8]  49.07 
 
 
302 aa  203  2e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0318236  normal  0.302303 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4759  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.25 
 
 
211 aa  203  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.895544  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5301  Glutathione S-transferase domain  49.26 
 
 
211 aa  203  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5226  Glutathione S-transferase domain  50.25 
 
 
211 aa  203  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0430433 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0300  glutathione S-transferase-like protein  47.26 
 
 
234 aa  202  3e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3798  glutathione S-transferase domain-containing protein  50 
 
 
236 aa  202  5e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.59415  normal  0.718162 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0209  glutathione S-transferase-like  49.03 
 
 
233 aa  202  5e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0751  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.22 
 
 
242 aa  201  5e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0134442  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05780  Glutathione S-transferase-like protein  47.75 
 
 
229 aa  201  6e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.713113  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4693  glutathione S-transferase-like protein  51.26 
 
 
232 aa  201  7e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2306  Glutathione S-transferase domain protein  46.61 
 
 
229 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0027483 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0442  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.24 
 
 
233 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0747669 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2962  glutathione S-transferase-like  46.12 
 
 
234 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.716617  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0486  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.28 
 
 
211 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.302672  normal  0.434346 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3453  Glutathione S-transferase domain  48.98 
 
 
235 aa  199  3e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2590  glutathione S-transferase, N- domain  46.57 
 
 
215 aa  198  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.153757  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1653  Glutathione S-transferase domain protein  48.73 
 
 
233 aa  198  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2536  glutathione S-transferase, N- domain  46.57 
 
 
215 aa  198  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0018218  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1701  Glutathione S-transferase domain protein  46.9 
 
 
233 aa  198  5e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1416  glutathione S-transferase  49.32 
 
 
230 aa  198  5e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2490  glutathione S-transferase, N- domain  46.57 
 
 
215 aa  198  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00139167  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4144  glutathione S-transferase-like protein  46.43 
 
 
235 aa  198  7e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.547927  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2699  glutathione S-transferase, N- domain  46.57 
 
 
215 aa  198  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.100904  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2578  glutathione S-transferase, N- domain  46.57 
 
 
215 aa  198  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.539822  normal  0.255018 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5440  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.38 
 
 
235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.199616  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2784  Glutathione S-transferase domain protein  45.54 
 
 
208 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000939416  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0090  glutathione S-transferase  49.3 
 
 
234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.162685  normal  0.0936415 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2407  putative glutathione S-transferase  48.29 
 
 
235 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00274689  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2390  glutathione S-transferase, putative  47.42 
 
 
362 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.223257  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4742  glutathione S-transferase domain-containing protein  48 
 
 
215 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.917928  hitchhiker  0.00649205 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3625  glutathione S-transferase-like  48 
 
 
215 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0643687  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>