More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1531 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_1531  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 
233 aa  477  1e-134  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.195621  normal  0.284704 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1655  glutathione S-transferase domain-containing protein  78.63 
 
 
234 aa  387  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.440036  normal  0.557594 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2390  glutathione S-transferase, putative  77.25 
 
 
362 aa  386  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.223257  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1600  glutathione S-transferase domain-containing protein  76.5 
 
 
234 aa  381  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal  0.388565 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1203  glutathione S-transferase-like  77.78 
 
 
234 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1581  glutathione S-transferase domain-containing protein  76.07 
 
 
234 aa  381  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0242583  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1682  glutathione S-transferase domain-containing protein  77.78 
 
 
234 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4104  glutathione S-transferase family protein  78.79 
 
 
231 aa  377  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.606268  normal  0.101573 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0798  glutathione S-transferase domain-containing protein  78.39 
 
 
237 aa  378  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.808485  normal  0.965794 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1375  glutathione S-transferase-like  77.35 
 
 
234 aa  380  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1563  glutathione S-transferase domain-containing protein  77.25 
 
 
234 aa  379  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.221401 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3732  Glutathione S-transferase domain protein  77.35 
 
 
234 aa  374  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.952098  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0251  putative glutathione S-transferase  76.39 
 
 
234 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.288754  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4836  glutathione S-transferase-like protein  75.21 
 
 
234 aa  375  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.33242  hitchhiker  0.00725172 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3378  glutathione S-transferase domain-containing protein  77.92 
 
 
231 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4017  glutathione S-transferase-like  78.11 
 
 
234 aa  376  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1591  putative glutathione S-transferase  76.39 
 
 
234 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.161795  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3350  putative glutathione S-transferase  75.11 
 
 
235 aa  374  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0909  putative glutathione S-transferase  76.39 
 
 
234 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0259435  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1760  glutathione S-transferase domain-containing protein  78.35 
 
 
231 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0130582 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3677  glutathione S-transferase domain-containing protein  78.35 
 
 
231 aa  374  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.145175  hitchhiker  0.00000417514 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1151  glutathione S-transferase, putative  75.54 
 
 
234 aa  371  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2123  putative glutathione S-transferase  75.97 
 
 
234 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0345909  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1961  putative glutathione S-transferase  75.97 
 
 
234 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1980  putative glutathione S-transferase  75.97 
 
 
234 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.110675  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1147  Glutathione S-transferase domain  73.39 
 
 
235 aa  369  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3976  glutathione S-transferase domain-containing protein  79.2 
 
 
232 aa  370  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.84686 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3984  glutathione S-transferase domain-containing protein  76.69 
 
 
255 aa  363  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.31338 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3752  glutathione S-transferase-like protein  74.57 
 
 
235 aa  362  2e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0129793  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1547  glutathione S-transferase domain-containing protein  72.65 
 
 
234 aa  361  6e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4929  glutathione S-transferase  72.1 
 
 
235 aa  359  2e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.574827  normal  0.56518 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3493  glutathione S-transferase  71.37 
 
 
244 aa  348  4e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0558771  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0097  glutathione S-transferase-like  71.37 
 
 
234 aa  341  5.999999999999999e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.472902  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1529  glutathione S-transferase domain-containing protein  69.96 
 
 
235 aa  339  2e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.623828  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0907  glutathione S-transferase domain-containing protein  70.82 
 
 
240 aa  335  1.9999999999999998e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1580  glutathione S-transferase domain-containing protein  69.53 
 
 
234 aa  335  2.9999999999999997e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.758866  normal  0.296422 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0090  glutathione S-transferase  67.38 
 
 
234 aa  326  2.0000000000000001e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.162685  normal  0.0936415 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0234  glutathione S-transferase domain-containing protein  65.38 
 
 
234 aa  326  2.0000000000000001e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.697932  normal  0.439898 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3750  glutathione S-transferase domain-containing protein  68.67 
 
 
234 aa  325  4.0000000000000003e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.5505  normal  0.556027 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0512  glutathione S-transferase-like protein  68.3 
 
 
229 aa  320  9.999999999999999e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.624431  normal  0.610727 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2264  glutathione S-transferase domain-containing protein  64.22 
 
 
238 aa  319  3e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.344237 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3954  glutathione S-transferase domain-containing protein  67.41 
 
 
231 aa  318  3e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0551186 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3326  Glutathione S-transferase domain protein  79.58 
 
 
205 aa  316  2e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5174  glutathione S-transferase-like  66.52 
 
 
232 aa  315  3e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.437986 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8437  Glutathione S-transferase domain protein  66.96 
 
 
231 aa  315  6e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0240  glutathione S-transferase domain protein  67.24 
 
 
232 aa  306  2.0000000000000002e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0127  glutathione S-transferase family protein  61.21 
 
 
234 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0176618  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0097  glutathione S-transferase-like protein  60.78 
 
 
234 aa  298  7e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.303692  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0406  glutathione S-transferase domain-containing protein  59.4 
 
 
235 aa  289  3e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.157624  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5791  glutathione S-transferase  60.68 
 
 
236 aa  284  8e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0513  Glutathione S-transferase domain protein  58.55 
 
 
236 aa  281  6.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0574717 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0456  glutathione S-transferase-like  59.48 
 
 
233 aa  280  1e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0468  Glutathione S-transferase domain  56.41 
 
 
236 aa  270  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.489326  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5556  glutathione S-transferase-like protein  53.3 
 
 
230 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1049  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.89 
 
 
230 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104834  normal  0.267684 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1366  Glutathione S-transferase domain  51.63 
 
 
233 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202985  hitchhiker  0.00146778 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2228  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.89 
 
 
230 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1616  glutathione S-transferase-like  51.89 
 
 
230 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2266  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.42 
 
 
230 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2252  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.42 
 
 
230 aa  210  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.791972  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2145  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.42 
 
 
230 aa  210  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0715733  normal  0.478827 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1001  glutathione S-transferase  49.53 
 
 
230 aa  209  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1954  putative GST-related protein  50.23 
 
 
255 aa  207  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2303  Glutathione S-transferase domain protein  50 
 
 
234 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0188012  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2848  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.42 
 
 
233 aa  206  3e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0336918  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1988  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.23 
 
 
233 aa  205  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.601516 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2655  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.91 
 
 
235 aa  204  7e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185355  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3771  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.53 
 
 
230 aa  204  7e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.680155  normal  0.387546 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2602  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.47 
 
 
231 aa  204  7e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.550233 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2021  putative GST-related protein  49.3 
 
 
230 aa  204  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.398836  normal  0.122618 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0624  glutathione S-transferase family protein  47.91 
 
 
236 aa  202  3e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2962  glutathione S-transferase-like  47.69 
 
 
234 aa  201  6e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.716617  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0967  glutathione S-transferase-like protein  47.64 
 
 
230 aa  201  7e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00253605  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_004310  BR0626  glutathione S-transferase family protein  47.91 
 
 
236 aa  201  9.999999999999999e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.679166  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1459  glutathione S-transferase-like protein  48.8 
 
 
228 aa  199  1.9999999999999998e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0619383 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5226  Glutathione S-transferase domain  49.52 
 
 
211 aa  199  5e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0430433 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4759  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.52 
 
 
211 aa  199  5e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.895544  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0751  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.53 
 
 
242 aa  198  5e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0134442  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2178  Glutathione S-transferase domain  47.89 
 
 
230 aa  198  7e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0564194 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5301  Glutathione S-transferase domain  49.05 
 
 
211 aa  198  7.999999999999999e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0486  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.52 
 
 
211 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.302672  normal  0.434346 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1855  Glutathione S-transferase domain protein  47.42 
 
 
230 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.619929  normal  0.146027 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3209  glutathione S-transferase-like protein  49.06 
 
 
239 aa  194  9e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1486  glutathione S-transferase  48.1 
 
 
204 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3798  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.83 
 
 
236 aa  194  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.59415  normal  0.718162 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3152  glutathione S-transferase-like  49.52 
 
 
235 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.194724  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7359  putative glutathione S-transferase  48.33 
 
 
208 aa  192  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.787949  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2476  Glutathione S-transferase domain  49.77 
 
 
239 aa  192  3e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.797585  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4348  glutathione S-transferase  49.53 
 
 
213 aa  191  9e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1416  glutathione S-transferase  44.55 
 
 
230 aa  191  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0300  glutathione S-transferase-like protein  46.23 
 
 
234 aa  191  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43530  hypothetical protein  48.58 
 
 
220 aa  189  4e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50970  glutathione S-transferase  48.61 
 
 
213 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.069878  hitchhiker  0.0000421189 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2246  glutathione S-transferase-like  47.42 
 
 
237 aa  188  7e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0687483  normal  0.14056 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1526  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.41 
 
 
241 aa  187  8e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.824932  normal  0.476803 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3650  hypothetical protein  48.58 
 
 
220 aa  187  9e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.328113  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0131  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.64 
 
 
208 aa  187  1e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.949199  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4135  glutathione S-transferase-like  48.8 
 
 
239 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.354502  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1931  glutathione S-transferase-like  49.06 
 
 
227 aa  186  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.548624 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3353  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.86 
 
 
208 aa  186  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000179296 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>