More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0234 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_0234  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 
234 aa  476  1e-134  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.697932  normal  0.439898 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1580  glutathione S-transferase domain-containing protein  77.25 
 
 
234 aa  380  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.758866  normal  0.296422 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3750  glutathione S-transferase domain-containing protein  76.82 
 
 
234 aa  377  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.5505  normal  0.556027 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1529  glutathione S-transferase domain-containing protein  75.54 
 
 
235 aa  371  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.623828  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0097  glutathione S-transferase-like  73.08 
 
 
234 aa  356  9.999999999999999e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.472902  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3954  glutathione S-transferase domain-containing protein  73.09 
 
 
231 aa  353  1e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0551186 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1375  glutathione S-transferase-like  72.22 
 
 
234 aa  350  1e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5174  glutathione S-transferase-like  73.54 
 
 
232 aa  346  2e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.437986 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3350  putative glutathione S-transferase  73.82 
 
 
235 aa  346  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4929  glutathione S-transferase  70.39 
 
 
235 aa  346  2e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.574827  normal  0.56518 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8437  Glutathione S-transferase domain protein  73.09 
 
 
231 aa  345  3e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2390  glutathione S-transferase, putative  69.96 
 
 
362 aa  343  1e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.223257  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0090  glutathione S-transferase  68.24 
 
 
234 aa  340  9e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.162685  normal  0.0936415 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1961  putative glutathione S-transferase  70.39 
 
 
234 aa  339  2e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2123  putative glutathione S-transferase  70.39 
 
 
234 aa  339  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0345909  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1980  putative glutathione S-transferase  70.39 
 
 
234 aa  339  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.110675  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1591  putative glutathione S-transferase  69.96 
 
 
234 aa  337  8e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.161795  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0251  putative glutathione S-transferase  69.96 
 
 
234 aa  337  8e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.288754  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0909  putative glutathione S-transferase  69.96 
 
 
234 aa  337  8e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0259435  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3732  Glutathione S-transferase domain protein  69.66 
 
 
234 aa  336  1.9999999999999998e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.952098  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1581  glutathione S-transferase domain-containing protein  70.09 
 
 
234 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0242583  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1600  glutathione S-transferase domain-containing protein  70.09 
 
 
234 aa  334  5.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal  0.388565 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1151  glutathione S-transferase, putative  69.1 
 
 
234 aa  333  1e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1147  Glutathione S-transferase domain  69.96 
 
 
235 aa  333  1e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3976  glutathione S-transferase domain-containing protein  70.04 
 
 
232 aa  332  2e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.84686 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1655  glutathione S-transferase domain-containing protein  69.66 
 
 
234 aa  332  3e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.440036  normal  0.557594 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3984  glutathione S-transferase domain-containing protein  67.81 
 
 
255 aa  330  1e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.31338 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0127  glutathione S-transferase family protein  66.95 
 
 
234 aa  330  2e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0176618  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0798  glutathione S-transferase domain-containing protein  68.83 
 
 
237 aa  328  5.0000000000000004e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.808485  normal  0.965794 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1203  glutathione S-transferase-like  68.8 
 
 
234 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1682  glutathione S-transferase domain-containing protein  68.8 
 
 
234 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1563  glutathione S-transferase domain-containing protein  68.24 
 
 
234 aa  328  6e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.221401 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4836  glutathione S-transferase-like protein  68.38 
 
 
234 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.33242  hitchhiker  0.00725172 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0512  glutathione S-transferase-like protein  69.51 
 
 
229 aa  327  1.0000000000000001e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.624431  normal  0.610727 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1531  glutathione S-transferase domain-containing protein  65.38 
 
 
233 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.195621  normal  0.284704 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4017  glutathione S-transferase-like  68.67 
 
 
234 aa  325  4.0000000000000003e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1547  glutathione S-transferase domain-containing protein  68.38 
 
 
234 aa  324  6e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3493  glutathione S-transferase  67.52 
 
 
244 aa  323  1e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0558771  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3752  glutathione S-transferase-like protein  69.4 
 
 
235 aa  322  2e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0129793  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0097  glutathione S-transferase-like protein  65.24 
 
 
234 aa  315  6e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.303692  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4104  glutathione S-transferase family protein  65.8 
 
 
231 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.606268  normal  0.101573 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1760  glutathione S-transferase domain-containing protein  65.8 
 
 
231 aa  311  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0130582 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3677  glutathione S-transferase domain-containing protein  65.8 
 
 
231 aa  308  4e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.145175  hitchhiker  0.00000417514 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3378  glutathione S-transferase domain-containing protein  65.37 
 
 
231 aa  308  5e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0513  Glutathione S-transferase domain protein  63.68 
 
 
236 aa  304  6e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0574717 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0406  glutathione S-transferase domain-containing protein  60.68 
 
 
235 aa  300  1e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.157624  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0468  Glutathione S-transferase domain  62.39 
 
 
236 aa  298  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.489326  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2264  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.87 
 
 
238 aa  284  5.999999999999999e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.344237 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0907  glutathione S-transferase domain-containing protein  59.66 
 
 
240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0240  glutathione S-transferase domain protein  61.8 
 
 
232 aa  275  4e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5791  glutathione S-transferase  57.38 
 
 
236 aa  275  6e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3326  Glutathione S-transferase domain protein  67.54 
 
 
205 aa  270  1e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0456  glutathione S-transferase-like  57.51 
 
 
233 aa  265  5.999999999999999e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5556  glutathione S-transferase-like protein  50.48 
 
 
230 aa  209  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2228  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.48 
 
 
230 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1616  glutathione S-transferase-like  50.48 
 
 
230 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2252  glutathione S-transferase domain-containing protein  50 
 
 
230 aa  208  5e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.791972  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2266  glutathione S-transferase domain-containing protein  50 
 
 
230 aa  207  9e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2145  glutathione S-transferase domain-containing protein  50 
 
 
230 aa  206  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0715733  normal  0.478827 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1049  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.1 
 
 
230 aa  202  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104834  normal  0.267684 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1954  putative GST-related protein  45.92 
 
 
255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2602  glutathione S-transferase domain-containing protein  50 
 
 
231 aa  196  4.0000000000000005e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.550233 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1366  Glutathione S-transferase domain  47.42 
 
 
233 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202985  hitchhiker  0.00146778 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1988  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.89 
 
 
233 aa  193  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.601516 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0486  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.52 
 
 
211 aa  193  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.302672  normal  0.434346 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1001  glutathione S-transferase  45.24 
 
 
230 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3798  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.06 
 
 
236 aa  187  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.59415  normal  0.718162 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2021  putative GST-related protein  46.19 
 
 
230 aa  187  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.398836  normal  0.122618 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2303  Glutathione S-transferase domain protein  45.71 
 
 
234 aa  182  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0188012  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3771  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.81 
 
 
230 aa  182  4.0000000000000006e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.680155  normal  0.387546 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5301  Glutathione S-transferase domain  47.14 
 
 
211 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2178  Glutathione S-transferase domain  44.76 
 
 
230 aa  181  7e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0564194 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1486  glutathione S-transferase  46.19 
 
 
204 aa  181  9.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4348  glutathione S-transferase  46.26 
 
 
213 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1855  Glutathione S-transferase domain protein  44.29 
 
 
230 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.619929  normal  0.146027 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0891  glutathione S-transferase-like protein  46.19 
 
 
241 aa  180  2e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0209  glutathione S-transferase-like  47.71 
 
 
233 aa  180  2e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5226  Glutathione S-transferase domain  46.19 
 
 
211 aa  179  4e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0430433 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4759  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.19 
 
 
211 aa  179  4e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.895544  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2848  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.47 
 
 
233 aa  179  4.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0336918  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50970  glutathione S-transferase  45.83 
 
 
213 aa  178  8e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.069878  hitchhiker  0.0000421189 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2306  Glutathione S-transferase domain protein  47.42 
 
 
229 aa  178  8e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0027483 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0967  glutathione S-transferase-like protein  42.86 
 
 
230 aa  177  9e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00253605  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1576  glutathione S-transferase family protein  44.13 
 
 
222 aa  177  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1087  glutathione S-transferase family protein  43.66 
 
 
222 aa  177  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.983271 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0131  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.26 
 
 
208 aa  176  2e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.949199  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2563  Glutathione S-transferase domain protein  43.13 
 
 
209 aa  177  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0185641  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4938  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.75 
 
 
210 aa  176  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4437  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.23 
 
 
206 aa  176  4e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1459  glutathione S-transferase-like protein  46.67 
 
 
228 aa  175  4e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0619383 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2866  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.66 
 
 
222 aa  176  4e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0201506 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2655  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.58 
 
 
235 aa  175  5e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185355  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1416  glutathione S-transferase  44.76 
 
 
230 aa  175  5e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2329  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.65 
 
 
211 aa  175  6e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00249355  normal  0.144066 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2696  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.19 
 
 
222 aa  175  6e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036581 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2764  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.19 
 
 
222 aa  175  7e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0906  hypothetical protein  48.13 
 
 
228 aa  174  8e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.719726  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2966  Glutathione S-transferase domain protein  42.72 
 
 
222 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.183097  normal  0.112262 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1393  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.72 
 
 
222 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0624  glutathione S-transferase family protein  44.5 
 
 
236 aa  174  9.999999999999999e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>