More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1760 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009512  Pput_1760  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 
231 aa  474  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0130582 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4104  glutathione S-transferase family protein  99.57 
 
 
231 aa  471  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.606268  normal  0.101573 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3677  glutathione S-transferase domain-containing protein  95.24 
 
 
231 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.145175  hitchhiker  0.00000417514 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3378  glutathione S-transferase domain-containing protein  92.21 
 
 
231 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1531  glutathione S-transferase domain-containing protein  78.35 
 
 
233 aa  375  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.195621  normal  0.284704 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1203  glutathione S-transferase-like  75.43 
 
 
234 aa  363  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1682  glutathione S-transferase domain-containing protein  75.43 
 
 
234 aa  363  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1655  glutathione S-transferase domain-containing protein  75.43 
 
 
234 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.440036  normal  0.557594 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1600  glutathione S-transferase domain-containing protein  74.57 
 
 
234 aa  363  2e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal  0.388565 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4836  glutathione S-transferase-like protein  75 
 
 
234 aa  362  2e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.33242  hitchhiker  0.00725172 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1563  glutathione S-transferase domain-containing protein  75 
 
 
234 aa  362  2e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.221401 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1581  glutathione S-transferase domain-containing protein  74.14 
 
 
234 aa  362  2e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0242583  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2390  glutathione S-transferase, putative  72.41 
 
 
362 aa  359  2e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.223257  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1375  glutathione S-transferase-like  75.76 
 
 
234 aa  360  2e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3732  Glutathione S-transferase domain protein  74.03 
 
 
234 aa  358  5e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.952098  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1147  Glutathione S-transferase domain  74.03 
 
 
235 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3350  putative glutathione S-transferase  73.59 
 
 
235 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1547  glutathione S-transferase domain-containing protein  73.16 
 
 
234 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4017  glutathione S-transferase-like  74.89 
 
 
234 aa  352  2.9999999999999997e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3976  glutathione S-transferase domain-containing protein  75.89 
 
 
232 aa  351  5.9999999999999994e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.84686 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0798  glutathione S-transferase domain-containing protein  74.67 
 
 
237 aa  350  1e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.808485  normal  0.965794 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3984  glutathione S-transferase domain-containing protein  74.35 
 
 
255 aa  350  1e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.31338 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2123  putative glutathione S-transferase  70.69 
 
 
234 aa  345  3e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0345909  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1980  putative glutathione S-transferase  70.69 
 
 
234 aa  345  3e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.110675  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1961  putative glutathione S-transferase  70.69 
 
 
234 aa  345  3e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4929  glutathione S-transferase  70.13 
 
 
235 aa  345  4e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.574827  normal  0.56518 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3752  glutathione S-transferase-like protein  72.29 
 
 
235 aa  343  8.999999999999999e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0129793  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0251  putative glutathione S-transferase  70.26 
 
 
234 aa  343  1e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.288754  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0909  putative glutathione S-transferase  70.26 
 
 
234 aa  343  1e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0259435  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1591  putative glutathione S-transferase  70.26 
 
 
234 aa  343  1e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.161795  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1151  glutathione S-transferase, putative  69.83 
 
 
234 aa  341  7e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0907  glutathione S-transferase domain-containing protein  71.43 
 
 
240 aa  340  1e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3493  glutathione S-transferase  70.13 
 
 
244 aa  337  9e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0558771  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0097  glutathione S-transferase-like  70.56 
 
 
234 aa  334  5.999999999999999e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.472902  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0090  glutathione S-transferase  68.83 
 
 
234 aa  328  4e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.162685  normal  0.0936415 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3750  glutathione S-transferase domain-containing protein  69.26 
 
 
234 aa  328  6e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.5505  normal  0.556027 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1529  glutathione S-transferase domain-containing protein  66.81 
 
 
235 aa  320  8e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.623828  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1580  glutathione S-transferase domain-containing protein  67.53 
 
 
234 aa  318  3.9999999999999996e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.758866  normal  0.296422 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0234  glutathione S-transferase domain-containing protein  65.8 
 
 
234 aa  311  5.999999999999999e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.697932  normal  0.439898 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0097  glutathione S-transferase-like protein  61.9 
 
 
234 aa  305  4.0000000000000004e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.303692  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3954  glutathione S-transferase domain-containing protein  65.47 
 
 
231 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0551186 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0127  glutathione S-transferase family protein  60.61 
 
 
234 aa  302  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0176618  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2264  glutathione S-transferase domain-containing protein  59.13 
 
 
238 aa  298  5e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.344237 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8437  Glutathione S-transferase domain protein  63.68 
 
 
231 aa  298  6e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0512  glutathione S-transferase-like protein  63.23 
 
 
229 aa  296  2e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.624431  normal  0.610727 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5174  glutathione S-transferase-like  62.78 
 
 
232 aa  295  4e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.437986 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3326  Glutathione S-transferase domain protein  75.4 
 
 
205 aa  291  4e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0406  glutathione S-transferase domain-containing protein  59.05 
 
 
235 aa  285  4e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.157624  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0240  glutathione S-transferase domain protein  61.47 
 
 
232 aa  282  3.0000000000000004e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0513  Glutathione S-transferase domain protein  59.48 
 
 
236 aa  275  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0574717 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0456  glutathione S-transferase-like  56.52 
 
 
233 aa  273  2.0000000000000002e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5791  glutathione S-transferase  57.76 
 
 
236 aa  271  5.000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0468  Glutathione S-transferase domain  57.76 
 
 
236 aa  268  5e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.489326  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5556  glutathione S-transferase-like protein  51.9 
 
 
230 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2252  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.43 
 
 
230 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.791972  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1616  glutathione S-transferase-like  51.9 
 
 
230 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2228  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.9 
 
 
230 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1049  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.9 
 
 
230 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104834  normal  0.267684 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2266  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.95 
 
 
230 aa  210  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2145  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.95 
 
 
230 aa  209  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0715733  normal  0.478827 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1366  Glutathione S-transferase domain  51.17 
 
 
233 aa  206  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202985  hitchhiker  0.00146778 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1001  glutathione S-transferase  48.57 
 
 
230 aa  205  6e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1954  putative GST-related protein  48.62 
 
 
255 aa  201  8e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0967  glutathione S-transferase-like protein  47.14 
 
 
230 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00253605  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1988  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.3 
 
 
233 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.601516 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2303  Glutathione S-transferase domain protein  48.57 
 
 
234 aa  198  6e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0188012  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3771  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.1 
 
 
230 aa  195  5.000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.680155  normal  0.387546 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2021  putative GST-related protein  48.57 
 
 
230 aa  194  7e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.398836  normal  0.122618 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0486  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.33 
 
 
211 aa  194  8.000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.302672  normal  0.434346 
 
 
-
 
NC_004310  BR0626  glutathione S-transferase family protein  46.05 
 
 
236 aa  194  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.679166  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2602  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.11 
 
 
231 aa  193  1e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.550233 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2655  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.05 
 
 
235 aa  192  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185355  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0624  glutathione S-transferase family protein  45.58 
 
 
236 aa  192  3e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2178  Glutathione S-transferase domain  47.14 
 
 
230 aa  191  7e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0564194 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1459  glutathione S-transferase-like protein  48.8 
 
 
228 aa  191  7e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0619383 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5226  Glutathione S-transferase domain  46.19 
 
 
211 aa  191  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0430433 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0751  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.95 
 
 
242 aa  190  1e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0134442  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4759  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.19 
 
 
211 aa  191  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.895544  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1855  Glutathione S-transferase domain protein  46.67 
 
 
230 aa  190  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.619929  normal  0.146027 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5301  Glutathione S-transferase domain  46.89 
 
 
211 aa  190  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3798  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.39 
 
 
236 aa  188  7e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.59415  normal  0.718162 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2962  glutathione S-transferase-like  44.86 
 
 
234 aa  188  8e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.716617  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3152  glutathione S-transferase-like  48.57 
 
 
235 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.194724  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0131  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.57 
 
 
208 aa  185  6e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.949199  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2848  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.19 
 
 
233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0336918  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0891  glutathione S-transferase-like protein  48.54 
 
 
241 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43530  hypothetical protein  47.87 
 
 
220 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1416  glutathione S-transferase  43.54 
 
 
230 aa  181  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3650  hypothetical protein  47.87 
 
 
220 aa  180  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.328113  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2476  Glutathione S-transferase domain  47.89 
 
 
239 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.797585  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1486  glutathione S-transferase  46.67 
 
 
204 aa  180  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2563  Glutathione S-transferase domain protein  45.5 
 
 
209 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0185641  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4348  glutathione S-transferase  47.39 
 
 
213 aa  179  4e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1576  glutathione S-transferase family protein  44.6 
 
 
222 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0300  glutathione S-transferase-like protein  44.34 
 
 
234 aa  178  8e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7359  putative glutathione S-transferase  46.19 
 
 
208 aa  178  8e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.787949  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0831  Glutathione S-transferase domain protein  43.6 
 
 
227 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0286662 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4437  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.98 
 
 
206 aa  176  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3209  glutathione S-transferase-like protein  46.01 
 
 
239 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2696  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.19 
 
 
222 aa  176  3e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036581 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>