More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3732 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_3732  Glutathione S-transferase domain protein  100 
 
 
234 aa  481  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.952098  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1655  glutathione S-transferase domain-containing protein  85.9 
 
 
234 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.440036  normal  0.557594 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1600  glutathione S-transferase domain-containing protein  84.62 
 
 
234 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal  0.388565 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1203  glutathione S-transferase-like  85.04 
 
 
234 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1581  glutathione S-transferase domain-containing protein  84.19 
 
 
234 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0242583  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1682  glutathione S-transferase domain-containing protein  85.04 
 
 
234 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4836  glutathione S-transferase-like protein  84.19 
 
 
234 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.33242  hitchhiker  0.00725172 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1563  glutathione S-transferase domain-containing protein  84.55 
 
 
234 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.221401 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2390  glutathione S-transferase, putative  82.4 
 
 
362 aa  410  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.223257  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4017  glutathione S-transferase-like  84.55 
 
 
234 aa  413  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1375  glutathione S-transferase-like  83.33 
 
 
234 aa  410  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3350  putative glutathione S-transferase  82.4 
 
 
235 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1147  Glutathione S-transferase domain  80.69 
 
 
235 aa  402  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3984  glutathione S-transferase domain-containing protein  79.75 
 
 
255 aa  391  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.31338 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2123  putative glutathione S-transferase  79.4 
 
 
234 aa  391  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0345909  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1980  putative glutathione S-transferase  79.4 
 
 
234 aa  391  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.110675  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1547  glutathione S-transferase domain-containing protein  77.78 
 
 
234 aa  392  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1961  putative glutathione S-transferase  79.4 
 
 
234 aa  391  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0251  putative glutathione S-transferase  78.97 
 
 
234 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.288754  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3493  glutathione S-transferase  77.35 
 
 
244 aa  389  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0558771  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1591  putative glutathione S-transferase  78.97 
 
 
234 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.161795  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0909  putative glutathione S-transferase  78.97 
 
 
234 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0259435  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1151  glutathione S-transferase, putative  78.11 
 
 
234 aa  384  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3976  glutathione S-transferase domain-containing protein  81.06 
 
 
232 aa  386  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.84686 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3752  glutathione S-transferase-like protein  79.74 
 
 
235 aa  385  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0129793  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4929  glutathione S-transferase  78.11 
 
 
235 aa  386  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.574827  normal  0.56518 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1531  glutathione S-transferase domain-containing protein  77.35 
 
 
233 aa  374  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.195621  normal  0.284704 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0798  glutathione S-transferase domain-containing protein  76.69 
 
 
237 aa  374  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.808485  normal  0.965794 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0097  glutathione S-transferase-like  75.64 
 
 
234 aa  365  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.472902  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3378  glutathione S-transferase domain-containing protein  76.19 
 
 
231 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4104  glutathione S-transferase family protein  74.46 
 
 
231 aa  360  9e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.606268  normal  0.101573 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1760  glutathione S-transferase domain-containing protein  74.03 
 
 
231 aa  358  5e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0130582 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3677  glutathione S-transferase domain-containing protein  74.03 
 
 
231 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.145175  hitchhiker  0.00000417514 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1580  glutathione S-transferase domain-containing protein  70.39 
 
 
234 aa  342  4e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.758866  normal  0.296422 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3750  glutathione S-transferase domain-containing protein  71.24 
 
 
234 aa  341  5.999999999999999e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.5505  normal  0.556027 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0090  glutathione S-transferase  68.67 
 
 
234 aa  337  5.9999999999999996e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.162685  normal  0.0936415 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0907  glutathione S-transferase domain-containing protein  70.39 
 
 
240 aa  337  7e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1529  glutathione S-transferase domain-containing protein  68.67 
 
 
235 aa  337  9e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.623828  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0234  glutathione S-transferase domain-containing protein  69.66 
 
 
234 aa  336  1.9999999999999998e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.697932  normal  0.439898 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8437  Glutathione S-transferase domain protein  70.4 
 
 
231 aa  326  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3326  Glutathione S-transferase domain protein  80.53 
 
 
205 aa  325  5e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5174  glutathione S-transferase-like  68.61 
 
 
232 aa  320  8e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.437986 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0512  glutathione S-transferase-like protein  66.37 
 
 
229 aa  318  3.9999999999999996e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.624431  normal  0.610727 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0127  glutathione S-transferase family protein  64.38 
 
 
234 aa  315  3e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0176618  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3954  glutathione S-transferase domain-containing protein  66.82 
 
 
231 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0551186 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0097  glutathione S-transferase-like protein  64.81 
 
 
234 aa  313  9.999999999999999e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.303692  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0513  Glutathione S-transferase domain protein  64.1 
 
 
236 aa  305  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0574717 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0240  glutathione S-transferase domain protein  65.67 
 
 
232 aa  297  8e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5791  glutathione S-transferase  60.26 
 
 
236 aa  296  2e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0406  glutathione S-transferase domain-containing protein  60.26 
 
 
235 aa  296  3e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.157624  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0468  Glutathione S-transferase domain  62.39 
 
 
236 aa  295  5e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.489326  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2264  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.58 
 
 
238 aa  285  5.999999999999999e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.344237 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0456  glutathione S-transferase-like  59.23 
 
 
233 aa  272  3e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2145  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.81 
 
 
230 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0715733  normal  0.478827 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5556  glutathione S-transferase-like protein  52.86 
 
 
230 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1366  Glutathione S-transferase domain  53.05 
 
 
233 aa  219  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202985  hitchhiker  0.00146778 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1001  glutathione S-transferase  51.9 
 
 
230 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2266  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.33 
 
 
230 aa  218  6e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2228  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.86 
 
 
230 aa  217  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1616  glutathione S-transferase-like  52.86 
 
 
230 aa  217  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2252  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.9 
 
 
230 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.791972  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1049  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.43 
 
 
230 aa  214  7e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104834  normal  0.267684 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1954  putative GST-related protein  47.23 
 
 
255 aa  208  5e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2021  putative GST-related protein  50.47 
 
 
230 aa  208  7e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.398836  normal  0.122618 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1988  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.23 
 
 
233 aa  207  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.601516 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0967  glutathione S-transferase-like protein  48.57 
 
 
230 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00253605  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2602  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.94 
 
 
231 aa  206  3e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.550233 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1855  Glutathione S-transferase domain protein  48.57 
 
 
230 aa  201  9e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.619929  normal  0.146027 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2178  Glutathione S-transferase domain  48.1 
 
 
230 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0564194 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0751  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.95 
 
 
242 aa  199  3e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0134442  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3457  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.23 
 
 
232 aa  199  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0220469  normal  0.0243961 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3866  Glutathione S-transferase domain  50 
 
 
229 aa  197  1.0000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2962  glutathione S-transferase-like  45.83 
 
 
234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.716617  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2303  Glutathione S-transferase domain protein  47.14 
 
 
234 aa  196  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0188012  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3771  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.64 
 
 
230 aa  196  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.680155  normal  0.387546 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0891  glutathione S-transferase-like protein  49.76 
 
 
241 aa  195  6e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1486  glutathione S-transferase  48.1 
 
 
204 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3152  glutathione S-transferase-like  51.16 
 
 
235 aa  192  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.194724  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50970  glutathione S-transferase  48.15 
 
 
213 aa  192  5e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.069878  hitchhiker  0.0000421189 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1087  glutathione S-transferase family protein  46.95 
 
 
222 aa  191  1e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.983271 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4348  glutathione S-transferase  47.69 
 
 
213 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0131  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.51 
 
 
208 aa  188  5e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.949199  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0300  glutathione S-transferase-like protein  44.81 
 
 
234 aa  187  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0528  putative glutathione S-transferase  46.23 
 
 
222 aa  187  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1576  glutathione S-transferase family protein  46.01 
 
 
222 aa  186  3e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3132  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.52 
 
 
235 aa  186  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188559  normal  0.0740814 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2848  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.13 
 
 
233 aa  186  3e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0336918  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2476  Glutathione S-transferase domain  49.07 
 
 
239 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.797585  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0078  Glutathione S-transferase domain  46.3 
 
 
235 aa  185  5e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.926583  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1214  glutathione S-transferase-like protein  47.47 
 
 
214 aa  184  8e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2655  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.33 
 
 
235 aa  184  9e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185355  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4759  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.67 
 
 
211 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.895544  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5301  Glutathione S-transferase domain  46.92 
 
 
211 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5226  Glutathione S-transferase domain  46.67 
 
 
211 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0430433 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0486  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.45 
 
 
211 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.302672  normal  0.434346 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2306  Glutathione S-transferase domain protein  49.53 
 
 
229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0027483 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2631  glutathione S-transferase-like  47.93 
 
 
239 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.400604  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5440  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.6 
 
 
235 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.199616  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3650  hypothetical protein  47.42 
 
 
220 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.328113  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43530  hypothetical protein  47.42 
 
 
220 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>