More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5869 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5869  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 		 215 aa  443  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1704  Glutathione S-transferase domain protein  57.94 
 
 		 212 aa  245  4e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0690203  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5423  Gst12 glutathione-S-transferase  43.41 
 
 		 210 aa  172  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.355245  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2104  putative glutathione S-transferase  41.75 
 
 		 198 aa  158  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1240  Glutathione S-transferase domain  43.41 
 
 		 213 aa  157  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123579  normal  0.124818 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2073  Glutathione S-transferase domain  44.5 
 
 		 213 aa  155  6e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.774679  normal  0.0456347 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6467  Glutathione S-transferase domain protein  40.29 
 
 		 219 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1708  Glutathione S-transferase domain  43.2 
 
 		 199 aa  153  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4463  Glutathione S-transferase domain  40.29 
 
 		 220 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0595447 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24830  putative glutathione S-transferase  41.06 
 
 		 198 aa  153  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3285  putative glutathione S-transferase  44.39 
 
 		 197 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.549218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3947  Glutathione S-transferase domain protein  41.35 
 
 		 207 aa  147  9e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1180  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.75 
 
 		 207 aa  141  7e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.610567  normal  0.0747789 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2439  glutathione S-transferase-like protein  39.41 
 
 		 214 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.414826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3433  glutathione S-transferase family protein  37.95 
 
 		 214 aa  139  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000284771 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3670  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.92 
 
 		 214 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3851  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.92 
 
 		 214 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.216591  normal  0.461755 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5040  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.9 
 
 		 221 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.367084 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4693  glutathione S-transferase-like  38.92 
 
 		 214 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3573  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.92 
 
 		 214 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.242235  normal  0.0117224 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4250  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.93 
 
 		 209 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1873  Glutathione S-transferase domain protein  39.9 
 
 		 200 aa  136  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5417  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.42 
 
 		 214 aa  136  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0125  glutathione S-transferase  41.67 
 
 		 266 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1904  Glutathione S-transferase domain protein  39.71 
 
 		 199 aa  135  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1071  glutathione S-transferase  41.67 
 
 		 214 aa  135  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.292672  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2670  putative glutathione S-transferase  41.67 
 
 		 297 aa  135  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2817  glutathione S-transferase  41.67 
 
 		 300 aa  135  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0107  glutathione S-transferase  41.67 
 
 		 214 aa  135  5e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1267  glutathione S-transferase  41.67 
 
 		 214 aa  135  5e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261228  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3092  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.92 
 
 		 205 aa  133  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.061874 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2245  glutathione S-transferase-like  35.68 
 
 		 220 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.556118  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1162  glutathione S-transferase family protein  36.95 
 
 		 209 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0407  glutathione S-transferase  41.18 
 
 		 217 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1196  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.45 
 
 		 209 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2762  glutathione S-transferase-like  39.6 
 
 		 206 aa  130  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3224  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.45 
 
 		 208 aa  129  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.395203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6230  putative glutathione S-transferase  38.57 
 
 		 207 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0344917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4952  Glutathione S-transferase domain  36.97 
 
 		 208 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.246161 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5690  glutathione S-transferase-like protein  35.47 
 
 		 227 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529075 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0910  Glutathione S-transferase domain  36.82 
 
 		 203 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8513  Glutathione S-transferase domain protein  37.81 
 
 		 205 aa  126  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700179  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1347  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.14 
 
 		 205 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5568  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.31 
 
 		 205 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1128  glutathione S-transferase-like  36.76 
 
 		 206 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4489  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.49 
 
 		 208 aa  125  6e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5005  Glutathione S-transferase domain  36.97 
 
 		 208 aa  124  7e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.286975  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4125  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.19 
 
 		 203 aa  123  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0661  Glutathione S-transferase domain protein  38.21 
 
 		 203 aa  122  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3323  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.14 
 
 		 227 aa  122  5e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0187385  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1106  Glutathione S-transferase domain  34.83 
 
 		 203 aa  121  8e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3155  hypothetical protein  39.13 
 
 		 207 aa  121  8e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.423769  normal  0.476319 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0645  glutathione S-transferase-like  34.31 
 
 		 225 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.722095  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1057  Glutathione S-transferase domain protein  35.82 
 
 		 203 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0628244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4686  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.81 
 
 		 205 aa  119  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4962  Glutathione S-transferase domain protein  37.07 
 
 		 219 aa  119  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0925  putative glutathione S-transferase  36.32 
 
 		 203 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.324873  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2349  glutathione S-transferase-like protein  35.92 
 
 		 208 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0771783 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4051  putative glutathione S-transferase  36.82 
 
 		 223 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.838028 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4729  glutathione S-transferase  36.5 
 
 		 203 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0556098  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3325  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.42 
 
 		 205 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0797  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.29 
 
 		 205 aa  114  8.999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0462  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.98 
 
 		 205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.269396 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5079  Glutathione S-transferase domain  36.45 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.242731  hitchhiker  0.00740675 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2670  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.55 
 
 		 200 aa  103  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.237361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43110  putative glutathione S-transferase  33.33 
 
 		 200 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000318488  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3617  putative glutathione S-transferase  32.86 
 
 		 200 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1842  glutathione S-transferase  32.38 
 
 		 200 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260742  normal  0.324274 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2032  glutathione S-transferase family protein  32.38 
 
 		 200 aa  98.6  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04080  probable glutathione S-transferase  32.7 
 
 		 199 aa  95.5  5e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2139  glutathione S-transferase  31.03 
 
 		 203 aa  95.1  6e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.041384 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0503  Glutathione S-transferase domain protein  31.03 
 
 		 208 aa  94.7  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0544052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3211  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.18 
 
 		 198 aa  94.4  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3511  glutathione S-transferase-like protein  30.14 
 
 		 198 aa  94.4  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1821  glutathione S-transferase family protein  30.92 
 
 		 200 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0623474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1399  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.73 
 
 		 200 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3890  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.43 
 
 		 200 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.19285 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003296  glutathione transferase  30.85 
 
 		 198 aa  91.3  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3893  glutathione S-transferase-like protein  30.48 
 
 		 210 aa  89.4  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2495  putative glutathione S-transferase  29.95 
 
 		 204 aa  89  6e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00712937  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1471  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.08 
 
 		 200 aa  88.6  7e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1447  glutathione S-transferase family protein  32.37 
 
 		 203 aa  88.2  8e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277938  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1493  glutathione S-transferase family protein  32.37 
 
 		 203 aa  88.2  8e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.695225  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1421  glutathione S-transferase domain protein  28.84 
 
 		 201 aa  88.2  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2641  Glutathione S-transferase domain  34.45 
 
 		 218 aa  87.8  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.213293 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5413  Glutathione S-transferase domain protein  34.12 
 
 		 207 aa  87.8  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1387  Glutathione S-transferase domain protein  28.37 
 
 		 201 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1429  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.47 
 
 		 200 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114439  normal  0.299107 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2738  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.81 
 
 		 216 aa  87  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4794  Glutathione S-transferase domain  32.67 
 
 		 197 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.915466  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3827  putative glutathione S-transferase  30.59 
 
 		 208 aa  87  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1459  glutathione S-transferase-like protein  34.31 
 
 		 228 aa  86.3  4e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0619383 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3152  glutathione S-transferase-like  32.84 
 
 		 235 aa  85.1  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.194724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2476  Glutathione S-transferase domain  32.02 
 
 		 239 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.797585  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2246  glutathione S-transferase-like  31.84 
 
 		 237 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0687483  normal  0.14056 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1101  glutathione S-transferase-like  30.77 
 
 		 256 aa  83.6  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0196  glutathione S-transferase-like  27.75 
 
 		 204 aa  84  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3700  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.27 
 
 		 202 aa  83.2  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0837  glutathione S-transferase domain protein  30.28 
 
 		 211 aa  82.8  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.613396 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0974  Glutathione S-transferase domain protein  30.2 
 
 		 209 aa  82.4  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>