More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1704 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1704  Glutathione S-transferase domain protein  100 
 
 		 212 aa  429  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0690203  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5869  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.94 
 
 		 215 aa  245  4e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3947  Glutathione S-transferase domain protein  40.85 
 
 		 207 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5423  Gst12 glutathione-S-transferase  41.46 
 
 		 210 aa  155  5.0000000000000005e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.355245  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4463  Glutathione S-transferase domain  41.75 
 
 		 220 aa  151  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0595447 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2104  putative glutathione S-transferase  43.48 
 
 		 198 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6467  Glutathione S-transferase domain protein  41.75 
 
 		 219 aa  149  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1240  Glutathione S-transferase domain  43.48 
 
 		 213 aa  148  6e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123579  normal  0.124818 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3433  glutathione S-transferase family protein  39.11 
 
 		 214 aa  148  8e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000284771 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2073  Glutathione S-transferase domain  43.96 
 
 		 213 aa  147  8e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.774679  normal  0.0456347 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24830  putative glutathione S-transferase  43.48 
 
 		 198 aa  147  9e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1904  Glutathione S-transferase domain protein  40.1 
 
 		 199 aa  141  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1708  Glutathione S-transferase domain  41.75 
 
 		 199 aa  140  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1180  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.69 
 
 		 207 aa  138  7e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.610567  normal  0.0747789 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3285  putative glutathione S-transferase  41.46 
 
 		 197 aa  136  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.549218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2439  glutathione S-transferase-like protein  40.38 
 
 		 214 aa  135  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.414826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3851  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.91 
 
 		 214 aa  135  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.216591  normal  0.461755 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3670  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.91 
 
 		 214 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4693  glutathione S-transferase-like  39.91 
 
 		 214 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3573  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.38 
 
 		 214 aa  132  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.242235  normal  0.0117224 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4962  Glutathione S-transferase domain protein  39.71 
 
 		 219 aa  131  6.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5040  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.9 
 
 		 221 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.367084 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5417  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.44 
 
 		 214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4250  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.42 
 
 		 209 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5690  glutathione S-transferase-like protein  38.42 
 
 		 227 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529075 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2762  glutathione S-transferase-like  40.59 
 
 		 206 aa  127  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3155  hypothetical protein  40.89 
 
 		 207 aa  126  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.423769  normal  0.476319 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2349  glutathione S-transferase-like protein  40.78 
 
 		 208 aa  124  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0771783 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1347  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.39 
 
 		 205 aa  124  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0107  glutathione S-transferase  39.9 
 
 		 214 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1267  glutathione S-transferase  39.9 
 
 		 214 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261228  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1071  glutathione S-transferase  39.9 
 
 		 214 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.292672  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2817  glutathione S-transferase  39.9 
 
 		 300 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1196  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.93 
 
 		 209 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2670  putative glutathione S-transferase  39.9 
 
 		 297 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0125  glutathione S-transferase  39.9 
 
 		 266 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1162  glutathione S-transferase family protein  37.44 
 
 		 209 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3092  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.41 
 
 		 205 aa  121  8e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.061874 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3224  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.96 
 
 		 208 aa  121  9e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.395203  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1873  Glutathione S-transferase domain protein  36.87 
 
 		 200 aa  120  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0407  glutathione S-transferase  39.35 
 
 		 217 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2245  glutathione S-transferase-like  35.78 
 
 		 220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.556118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6230  putative glutathione S-transferase  39.81 
 
 		 207 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0344917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4125  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.85 
 
 		 203 aa  117  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4686  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.82 
 
 		 205 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0910  Glutathione S-transferase domain  35.96 
 
 		 203 aa  116  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4952  Glutathione S-transferase domain  37.04 
 
 		 208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.246161 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3325  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.93 
 
 		 205 aa  115  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5568  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.32 
 
 		 205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4489  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.57 
 
 		 208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0925  putative glutathione S-transferase  36.32 
 
 		 203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.324873  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0645  glutathione S-transferase-like  37.07 
 
 		 225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.722095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1106  Glutathione S-transferase domain  33.83 
 
 		 203 aa  112  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0661  Glutathione S-transferase domain protein  36.76 
 
 		 203 aa  112  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5079  Glutathione S-transferase domain  36.54 
 
 		 213 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.242731  hitchhiker  0.00740675 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8513  Glutathione S-transferase domain protein  36.5 
 
 		 205 aa  111  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700179  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5005  Glutathione S-transferase domain  36.45 
 
 		 208 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.286975  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0797  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.65 
 
 		 205 aa  109  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1057  Glutathione S-transferase domain protein  34.48 
 
 		 203 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0628244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3323  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.29 
 
 		 227 aa  108  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0187385  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1128  glutathione S-transferase-like  33.33 
 
 		 206 aa  104  9e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2670  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.12 
 
 		 200 aa  104  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.237361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4729  glutathione S-transferase  34.33 
 
 		 203 aa  102  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0556098  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3617  putative glutathione S-transferase  32.06 
 
 		 200 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43110  putative glutathione S-transferase  32.06 
 
 		 200 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000318488  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4051  putative glutathione S-transferase  32.51 
 
 		 223 aa  101  8e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.838028 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2032  glutathione S-transferase family protein  32.06 
 
 		 200 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1842  glutathione S-transferase  33.01 
 
 		 200 aa  98.2  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260742  normal  0.324274 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3890  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.21 
 
 		 200 aa  98.2  8e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.19285 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1399  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.73 
 
 		 200 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250488  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1821  glutathione S-transferase family protein  31.73 
 
 		 200 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0623474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2641  Glutathione S-transferase domain  33.49 
 
 		 218 aa  95.1  6e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.213293 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5413  Glutathione S-transferase domain protein  36.04 
 
 		 207 aa  95.1  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0503  Glutathione S-transferase domain protein  27.96 
 
 		 208 aa  93.2  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0544052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2139  glutathione S-transferase  27.96 
 
 		 203 aa  93.6  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.041384 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4794  Glutathione S-transferase domain  36.22 
 
 		 197 aa  92  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.915466  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3893  glutathione S-transferase-like protein  29.52 
 
 		 210 aa  92  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2738  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.9 
 
 		 216 aa  89  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1421  glutathione S-transferase domain protein  27.31 
 
 		 201 aa  88.6  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0412  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.54 
 
 		 203 aa  88.6  7e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2495  putative glutathione S-transferase  28.02 
 
 		 204 aa  88.2  8e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00712937  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1387  Glutathione S-transferase domain protein  27.31 
 
 		 201 aa  87.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3700  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.78 
 
 		 202 aa  87.4  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1429  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.81 
 
 		 200 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114439  normal  0.299107 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04080  probable glutathione S-transferase  29.67 
 
 		 199 aa  87  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0462  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.05 
 
 		 205 aa  85.1  7e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.269396 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3211  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.14 
 
 		 198 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003296  glutathione transferase  29 
 
 		 198 aa  84.3  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0805  putative glutathione S-transferase  29.29 
 
 		 216 aa  83.2  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.671378  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1576  glutathione S-transferase family protein  33.33 
 
 		 222 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0196  glutathione S-transferase-like  29.81 
 
 		 204 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2866  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.32 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0201506 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2696  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.82 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036581 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2764  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.82 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3910  glutathione S-transferase-like  35.38 
 
 		 201 aa  81.6  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1171  Glutathione S-transferase domain protein  33.51 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245566  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3511  glutathione S-transferase-like protein  28.71 
 
 		 198 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04799  glutathione S-transferase  30.81 
 
 		 209 aa  79  0.00000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2981  glutathione S-transferase  30.52 
 
 		 216 aa  78.6  0.00000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.897939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3756  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.02 
 
 		 208 aa  78.2  0.00000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>