More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4051 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4051  putative glutathione S-transferase  100 
 
 		 223 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.838028 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4729  glutathione S-transferase  73.4 
 
 		 203 aa  293  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0556098  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8513  Glutathione S-transferase domain protein  67.49 
 
 		 205 aa  283  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700179  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0925  putative glutathione S-transferase  66.01 
 
 		 203 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.324873  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5568  glutathione S-transferase domain-containing protein  65.02 
 
 		 205 aa  270  1e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4125  glutathione S-transferase domain-containing protein  66.5 
 
 		 203 aa  269  2e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1347  glutathione S-transferase domain-containing protein  66.5 
 
 		 205 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4952  Glutathione S-transferase domain  66.01 
 
 		 208 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.246161 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4489  glutathione S-transferase domain-containing protein  66.01 
 
 		 208 aa  267  1e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5005  Glutathione S-transferase domain  67 
 
 		 208 aa  265  5e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.286975  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4686  glutathione S-transferase domain-containing protein  64.53 
 
 		 205 aa  265  5e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1106  Glutathione S-transferase domain  63.05 
 
 		 203 aa  264  8e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3325  glutathione S-transferase domain-containing protein  63.55 
 
 		 205 aa  261  6e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1057  Glutathione S-transferase domain protein  62.07 
 
 		 203 aa  258  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0628244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0910  Glutathione S-transferase domain  62.07 
 
 		 203 aa  256  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0661  Glutathione S-transferase domain protein  64.53 
 
 		 203 aa  256  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3224  glutathione S-transferase domain-containing protein  60 
 
 		 208 aa  254  6e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.395203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4250  glutathione S-transferase domain-containing protein  59.9 
 
 		 209 aa  250  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1162  glutathione S-transferase family protein  59.41 
 
 		 209 aa  248  6e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3323  glutathione S-transferase domain-containing protein  59.11 
 
 		 227 aa  248  6e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0187385  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1196  glutathione S-transferase domain-containing protein  59.9 
 
 		 209 aa  246  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2762  glutathione S-transferase-like  61.27 
 
 		 206 aa  245  4e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1180  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.33 
 
 		 207 aa  238  8e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.610567  normal  0.0747789 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5690  glutathione S-transferase-like protein  53.67 
 
 		 227 aa  231  9e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529075 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0645  glutathione S-transferase-like  55.61 
 
 		 225 aa  229  3e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.722095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2817  glutathione S-transferase  56.65 
 
 		 300 aa  228  5e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0125  glutathione S-transferase  56.65 
 
 		 266 aa  228  6e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0107  glutathione S-transferase  56.65 
 
 		 214 aa  227  1e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1267  glutathione S-transferase  56.65 
 
 		 214 aa  227  1e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261228  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2670  putative glutathione S-transferase  56.5 
 
 		 297 aa  225  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1071  glutathione S-transferase  56.5 
 
 		 214 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.292672  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5417  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.19 
 
 		 214 aa  222  4e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556283  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4962  Glutathione S-transferase domain protein  53.05 
 
 		 219 aa  221  9e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2439  glutathione S-transferase-like protein  55.66 
 
 		 214 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.414826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3573  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.71 
 
 		 214 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.242235  normal  0.0117224 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0407  glutathione S-transferase  55.67 
 
 		 217 aa  216  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3670  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.72 
 
 		 214 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4693  glutathione S-transferase-like  54.72 
 
 		 214 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3851  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.72 
 
 		 214 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.216591  normal  0.461755 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2245  glutathione S-transferase-like  54.29 
 
 		 220 aa  215  4e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.556118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5040  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.76 
 
 		 221 aa  215  5e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.367084 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1128  glutathione S-transferase-like  50.74 
 
 		 206 aa  206  3e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5079  Glutathione S-transferase domain  50.25 
 
 		 213 aa  205  5e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.242731  hitchhiker  0.00740675 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6230  putative glutathione S-transferase  57.29 
 
 		 207 aa  202  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0344917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3433  glutathione S-transferase family protein  46 
 
 		 214 aa  195  4.0000000000000005e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000284771 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1904  Glutathione S-transferase domain protein  48.47 
 
 		 199 aa  194  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3947  Glutathione S-transferase domain protein  46.5 
 
 		 207 aa  184  9e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3092  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.31 
 
 		 205 aa  177  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.061874 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1873  Glutathione S-transferase domain protein  48.7 
 
 		 200 aa  175  4e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0462  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.73 
 
 		 205 aa  175  4e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.269396 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2104  putative glutathione S-transferase  45.64 
 
 		 198 aa  168  7e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3285  putative glutathione S-transferase  47.92 
 
 		 197 aa  166  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.549218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0797  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.47 
 
 		 205 aa  161  6e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24830  putative glutathione S-transferase  43.59 
 
 		 198 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1708  Glutathione S-transferase domain  45.45 
 
 		 199 aa  159  5e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2349  glutathione S-transferase-like protein  40.1 
 
 		 208 aa  123  3e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0771783 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5869  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.82 
 
 		 215 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4463  Glutathione S-transferase domain  38.31 
 
 		 220 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0595447 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3700  glutathione S-transferase domain-containing protein  34 
 
 		 202 aa  116  3e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2738  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.27 
 
 		 216 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6467  Glutathione S-transferase domain protein  37.31 
 
 		 219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1821  glutathione S-transferase family protein  36.5 
 
 		 200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0623474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3890  glutathione S-transferase domain-containing protein  36 
 
 		 200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.19285 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1799  putative glutathione S-transferase (GST)  33.49 
 
 		 216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.602523  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1493  glutathione S-transferase family protein  36.1 
 
 		 203 aa  108  5e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.695225  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1447  glutathione S-transferase family protein  36.1 
 
 		 203 aa  108  5e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277938  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3893  glutathione S-transferase-like protein  33.17 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1399  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.5 
 
 		 200 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1296  glutathione S-transferase-like protein  34.43 
 
 		 228 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.041604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1429  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.5 
 
 		 200 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114439  normal  0.299107 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4794  Glutathione S-transferase domain  34.85 
 
 		 197 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.915466  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2032  glutathione S-transferase family protein  32.5 
 
 		 200 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3511  glutathione S-transferase-like protein  32.99 
 
 		 198 aa  103  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1240  Glutathione S-transferase domain  33.98 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123579  normal  0.124818 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1387  Glutathione S-transferase domain protein  32 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3618  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.98 
 
 		 201 aa  102  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.822578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2670  glutathione S-transferase domain-containing protein  34 
 
 		 200 aa  102  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.237361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04080  probable glutathione S-transferase  30 
 
 		 199 aa  102  5e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1101  glutathione S-transferase-like  34.5 
 
 		 256 aa  102  5e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2981  glutathione S-transferase  33.99 
 
 		 216 aa  102  6e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.897939  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5413  Glutathione S-transferase domain protein  31.34 
 
 		 207 aa  102  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0412  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.65 
 
 		 203 aa  102  6e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2495  putative glutathione S-transferase  33.67 
 
 		 204 aa  101  9e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00712937  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1704  Glutathione S-transferase domain protein  32.51 
 
 		 212 aa  101  9e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0690203  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3211  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.5 
 
 		 198 aa  101  9e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5423  Gst12 glutathione-S-transferase  32.32 
 
 		 210 aa  101  9e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.355245  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3927  glutathione S-transferase-like  33.17 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1842  glutathione S-transferase  33 
 
 		 200 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260742  normal  0.324274 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4124  glutathione S-transferase-like  33.33 
 
 		 217 aa  99.4  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.590461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2547  glutathione S-transferase-like  34.67 
 
 		 203 aa  99  6e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.277247  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1421  glutathione S-transferase domain protein  31 
 
 		 201 aa  98.6  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0196  glutathione S-transferase-like  34.5 
 
 		 204 aa  98.2  9e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2073  Glutathione S-transferase domain  34.17 
 
 		 213 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.774679  normal  0.0456347 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4810  Glutathione S-transferase domain  33.33 
 
 		 217 aa  97.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3587  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.86 
 
 		 203 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0707812  hitchhiker  0.000377551 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3756  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.03 
 
 		 208 aa  97.1  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0837  glutathione S-transferase domain protein  36.18 
 
 		 211 aa  96.3  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.613396 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3155  hypothetical protein  34.78 
 
 		 207 aa  95.9  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.423769  normal  0.476319 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1311  glutathione S-transferase-like protein  36.32 
 
 		 196 aa  95.1  8e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.55458  normal  0.181696 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3617  putative glutathione S-transferase  32 
 
 		 200 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>