More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4250 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4250  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 		 209 aa  424  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1196  glutathione S-transferase domain-containing protein  95.69 
 
 		 209 aa  407  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1162  glutathione S-transferase family protein  96.17 
 
 		 209 aa  407  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1180  glutathione S-transferase domain-containing protein  85.37 
 
 		 207 aa  360  1e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.610567  normal  0.0747789 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3224  glutathione S-transferase domain-containing protein  81.64 
 
 		 208 aa  351  4e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.395203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5690  glutathione S-transferase-like protein  76.96 
 
 		 227 aa  337  7e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529075 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2439  glutathione S-transferase-like protein  69.12 
 
 		 214 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.414826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8513  Glutathione S-transferase domain protein  66.83 
 
 		 205 aa  281  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700179  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1057  Glutathione S-transferase domain protein  68.66 
 
 		 203 aa  279  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0628244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3670  glutathione S-transferase domain-containing protein  67.16 
 
 		 214 aa  277  7e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4693  glutathione S-transferase-like  67.16 
 
 		 214 aa  277  7e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3851  glutathione S-transferase domain-containing protein  67.16 
 
 		 214 aa  277  9e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.216591  normal  0.461755 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3573  glutathione S-transferase domain-containing protein  66.18 
 
 		 214 aa  276  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.242235  normal  0.0117224 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5417  glutathione S-transferase domain-containing protein  66.01 
 
 		 214 aa  275  5e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5040  glutathione S-transferase domain-containing protein  66.67 
 
 		 221 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.367084 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3323  glutathione S-transferase domain-containing protein  65.84 
 
 		 227 aa  273  1.0000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0187385  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0910  Glutathione S-transferase domain  66.17 
 
 		 203 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4489  glutathione S-transferase domain-containing protein  64.22 
 
 		 208 aa  272  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5005  Glutathione S-transferase domain  64.71 
 
 		 208 aa  270  1e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.286975  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0645  glutathione S-transferase-like  64.56 
 
 		 225 aa  270  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.722095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4952  Glutathione S-transferase domain  63.73 
 
 		 208 aa  268  4e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.246161 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0661  Glutathione S-transferase domain protein  64.18 
 
 		 203 aa  263  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2817  glutathione S-transferase  63.18 
 
 		 300 aa  262  3e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0125  glutathione S-transferase  62.69 
 
 		 266 aa  261  6e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0107  glutathione S-transferase  62.69 
 
 		 214 aa  260  1e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1267  glutathione S-transferase  62.69 
 
 		 214 aa  260  1e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261228  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2670  putative glutathione S-transferase  62.69 
 
 		 297 aa  259  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1071  glutathione S-transferase  62.69 
 
 		 214 aa  258  4e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.292672  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0407  glutathione S-transferase  61.95 
 
 		 217 aa  258  6e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2762  glutathione S-transferase-like  64.08 
 
 		 206 aa  258  6e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4962  Glutathione S-transferase domain protein  58.1 
 
 		 219 aa  257  7e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4686  glutathione S-transferase domain-containing protein  62.93 
 
 		 205 aa  257  8e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3325  glutathione S-transferase domain-containing protein  62.44 
 
 		 205 aa  257  9e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0925  putative glutathione S-transferase  63.68 
 
 		 203 aa  254  5e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.324873  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1347  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.95 
 
 		 205 aa  254  8e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1106  Glutathione S-transferase domain  61.69 
 
 		 203 aa  249  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4125  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.19 
 
 		 203 aa  250  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4051  putative glutathione S-transferase  59.9 
 
 		 223 aa  250  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.838028 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5568  glutathione S-transferase domain-containing protein  60.7 
 
 		 205 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5079  Glutathione S-transferase domain  57.35 
 
 		 213 aa  242  3e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.242731  hitchhiker  0.00740675 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4729  glutathione S-transferase  59.11 
 
 		 203 aa  236  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0556098  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3433  glutathione S-transferase family protein  54.55 
 
 		 214 aa  230  1e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000284771 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2245  glutathione S-transferase-like  57.5 
 
 		 220 aa  228  6e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.556118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6230  putative glutathione S-transferase  62.37 
 
 		 207 aa  228  7e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0344917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1128  glutathione S-transferase-like  53.17 
 
 		 206 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0462  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.59 
 
 		 205 aa  207  6e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.269396 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1904  Glutathione S-transferase domain protein  47.69 
 
 		 199 aa  187  8e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3092  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.96 
 
 		 205 aa  187  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.061874 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0797  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.74 
 
 		 205 aa  182  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3947  Glutathione S-transferase domain protein  45.64 
 
 		 207 aa  175  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1873  Glutathione S-transferase domain protein  42.27 
 
 		 200 aa  170  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2104  putative glutathione S-transferase  42.35 
 
 		 198 aa  167  9e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3285  putative glutathione S-transferase  41.62 
 
 		 197 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.549218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1708  Glutathione S-transferase domain  41.54 
 
 		 199 aa  161  6e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24830  putative glutathione S-transferase  39.8 
 
 		 198 aa  159  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5869  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.93 
 
 		 215 aa  137  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3700  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.88 
 
 		 202 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1704  Glutathione S-transferase domain protein  38.42 
 
 		 212 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0690203  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2670  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.2 
 
 		 200 aa  124  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.237361  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2032  glutathione S-transferase family protein  37.19 
 
 		 200 aa  122  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1821  glutathione S-transferase family protein  37.81 
 
 		 200 aa  121  6e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0623474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1399  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.69 
 
 		 200 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43110  putative glutathione S-transferase  35.32 
 
 		 200 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000318488  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1429  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.82 
 
 		 200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114439  normal  0.299107 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2349  glutathione S-transferase-like protein  37.76 
 
 		 208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0771783 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3890  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.31 
 
 		 200 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.19285 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1842  glutathione S-transferase  35.18 
 
 		 200 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260742  normal  0.324274 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3617  putative glutathione S-transferase  35.32 
 
 		 200 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5423  Gst12 glutathione-S-transferase  32.18 
 
 		 210 aa  117  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.355245  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0196  glutathione S-transferase-like  35.15 
 
 		 204 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2738  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.5 
 
 		 216 aa  116  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2296  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.14 
 
 		 204 aa  115  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.879102 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2981  glutathione S-transferase  35.82 
 
 		 216 aa  115  5e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.897939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4463  Glutathione S-transferase domain  36.63 
 
 		 220 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0595447 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3511  glutathione S-transferase-like protein  31.5 
 
 		 198 aa  112  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6467  Glutathione S-transferase domain protein  36.14 
 
 		 219 aa  112  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2073  Glutathione S-transferase domain  34.16 
 
 		 213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.774679  normal  0.0456347 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1799  putative glutathione S-transferase (GST)  34.33 
 
 		 216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.602523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1240  Glutathione S-transferase domain  32.67 
 
 		 213 aa  109  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123579  normal  0.124818 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3211  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.67 
 
 		 198 aa  109  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4810  Glutathione S-transferase domain  35.29 
 
 		 217 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04080  probable glutathione S-transferase  31.19 
 
 		 199 aa  108  5e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0503  Glutathione S-transferase domain protein  30.88 
 
 		 208 aa  107  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0544052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1387  Glutathione S-transferase domain protein  30.65 
 
 		 201 aa  107  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1101  glutathione S-transferase-like  34.33 
 
 		 256 aa  107  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0412  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.84 
 
 		 203 aa  107  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2495  putative glutathione S-transferase  32.52 
 
 		 204 aa  107  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00712937  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2139  glutathione S-transferase  31.12 
 
 		 203 aa  106  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.041384 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3927  glutathione S-transferase-like  33.83 
 
 		 228 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4794  Glutathione S-transferase domain  34.67 
 
 		 197 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.915466  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003296  glutathione transferase  31.82 
 
 		 198 aa  104  8e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2547  glutathione S-transferase-like  36.18 
 
 		 203 aa  104  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.277247  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1296  glutathione S-transferase-like protein  34.31 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.041604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1311  glutathione S-transferase-like protein  34.87 
 
 		 196 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.55458  normal  0.181696 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4124  glutathione S-transferase-like  33.83 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.590461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1421  glutathione S-transferase domain protein  29.65 
 
 		 201 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1493  glutathione S-transferase family protein  33.33 
 
 		 203 aa  102  6e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.695225  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1447  glutathione S-transferase family protein  33.33 
 
 		 203 aa  102  6e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277938  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3910  glutathione S-transferase-like  33.33 
 
 		 201 aa  101  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3155  hypothetical protein  34.74 
 
 		 207 aa  101  7e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.423769  normal  0.476319 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>