More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5413 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5413  Glutathione S-transferase domain protein  100 
 
 		 207 aa  413  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2547  glutathione S-transferase-like  51.5 
 
 		 203 aa  201  6e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.277247  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3511  glutathione S-transferase-like protein  40.21 
 
 		 198 aa  156  3e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1842  glutathione S-transferase  40.2 
 
 		 200 aa  155  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260742  normal  0.324274 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3893  glutathione S-transferase-like protein  39 
 
 		 210 aa  154  9e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04080  probable glutathione S-transferase  37.56 
 
 		 199 aa  154  9e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2032  glutathione S-transferase family protein  39.7 
 
 		 200 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3890  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.2 
 
 		 200 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.19285 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1387  Glutathione S-transferase domain protein  37.37 
 
 		 201 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1421  glutathione S-transferase domain protein  37.37 
 
 		 201 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1821  glutathione S-transferase family protein  39.7 
 
 		 200 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0623474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2670  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.21 
 
 		 200 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.237361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1399  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.7 
 
 		 200 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1447  glutathione S-transferase family protein  43.07 
 
 		 203 aa  144  1e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277938  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1493  glutathione S-transferase family protein  43.07 
 
 		 203 aa  144  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.695225  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1429  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.7 
 
 		 200 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114439  normal  0.299107 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3827  putative glutathione S-transferase  39.58 
 
 		 208 aa  144  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2641  Glutathione S-transferase domain  39.09 
 
 		 218 aa  141  7e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.213293 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0503  Glutathione S-transferase domain protein  34.16 
 
 		 208 aa  140  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0544052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43110  putative glutathione S-transferase  37.19 
 
 		 200 aa  137  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000318488  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2139  glutathione S-transferase  33.99 
 
 		 203 aa  137  1e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.041384 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3617  putative glutathione S-transferase  36.68 
 
 		 200 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2296  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.37 
 
 		 204 aa  136  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.879102 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2738  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.16 
 
 		 216 aa  137  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04799  glutathione S-transferase  39.15 
 
 		 209 aa  135  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003296  glutathione transferase  34.52 
 
 		 198 aa  133  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1985  glutathione S-transferase  38.22 
 
 		 207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3756  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.7 
 
 		 208 aa  127  8.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0196  glutathione S-transferase-like  31.86 
 
 		 204 aa  127  8.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3211  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.03 
 
 		 198 aa  127  9.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1471  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.18 
 
 		 200 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1101  glutathione S-transferase-like  36.28 
 
 		 256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2981  glutathione S-transferase  35.35 
 
 		 216 aa  125  6e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.897939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4794  Glutathione S-transferase domain  36.08 
 
 		 197 aa  121  6e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.915466  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3910  glutathione S-transferase-like  36.41 
 
 		 201 aa  121  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2312  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.31 
 
 		 195 aa  121  6e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0196665 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2587  Glutathione S-transferase domain  37.82 
 
 		 195 aa  121  7e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.751074  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2495  putative glutathione S-transferase  31.79 
 
 		 204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00712937  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3618  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.69 
 
 		 201 aa  119  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.822578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3587  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.41 
 
 		 203 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0707812  hitchhiker  0.000377551 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1171  Glutathione S-transferase domain protein  34.92 
 
 		 204 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245566  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2269  Glutathione S-transferase domain  36.27 
 
 		 195 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1311  glutathione S-transferase-like protein  35.33 
 
 		 196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.55458  normal  0.181696 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1799  putative glutathione S-transferase (GST)  34.67 
 
 		 216 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.602523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2762  glutathione S-transferase-like  36 
 
 		 206 aa  115  3.9999999999999997e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3927  glutathione S-transferase-like  35.18 
 
 		 228 aa  115  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1296  glutathione S-transferase-like protein  34.67 
 
 		 228 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.041604  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0134  Glutathione S-transferase domain protein  36.27 
 
 		 209 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0017  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.81 
 
 		 192 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0412  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.17 
 
 		 203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1820  putative glutathione S-transferase  33.7 
 
 		 196 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8513  Glutathione S-transferase domain protein  33.67 
 
 		 205 aa  112  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700179  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4810  Glutathione S-transferase domain  34.17 
 
 		 217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1106  Glutathione S-transferase domain  34.52 
 
 		 203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3947  Glutathione S-transferase domain protein  32.18 
 
 		 207 aa  107  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0925  putative glutathione S-transferase  33.84 
 
 		 203 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.324873  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4124  glutathione S-transferase-like  32.85 
 
 		 217 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.590461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1904  Glutathione S-transferase domain protein  32.5 
 
 		 199 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1347  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.17 
 
 		 205 aa  104  8e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5568  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.49 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4051  putative glutathione S-transferase  31.34 
 
 		 223 aa  102  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.838028 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4489  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.16 
 
 		 208 aa  102  6e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2245  glutathione S-transferase-like  33.5 
 
 		 220 aa  101  7e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.556118  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0107  glutathione S-transferase  33.66 
 
 		 214 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1071  glutathione S-transferase  33.66 
 
 		 214 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.292672  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0125  glutathione S-transferase  33.66 
 
 		 266 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2670  putative glutathione S-transferase  33.66 
 
 		 297 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1267  glutathione S-transferase  33.66 
 
 		 214 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261228  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1708  Glutathione S-transferase domain  33.66 
 
 		 199 aa  100  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4686  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.5 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2817  glutathione S-transferase  33.66 
 
 		 300 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4125  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.84 
 
 		 203 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4952  Glutathione S-transferase domain  31.66 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.246161 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1057  Glutathione S-transferase domain protein  30.96 
 
 		 203 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0628244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0407  glutathione S-transferase  33.66 
 
 		 217 aa  99.8  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2439  glutathione S-transferase-like protein  32.66 
 
 		 214 aa  98.6  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.414826  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1873  Glutathione S-transferase domain protein  33.5 
 
 		 200 aa  99  5e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3851  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.98 
 
 		 214 aa  98.6  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.216591  normal  0.461755 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1576  glutathione S-transferase family protein  32.26 
 
 		 222 aa  98.2  7e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2764  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.52 
 
 		 222 aa  98.2  8e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2866  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.8 
 
 		 222 aa  97.4  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0201506 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1087  glutathione S-transferase family protein  34.55 
 
 		 222 aa  97.4  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.983271 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4693  glutathione S-transferase-like  31.47 
 
 		 214 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2696  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.98 
 
 		 222 aa  97.1  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036581 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3670  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.47 
 
 		 214 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1180  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.16 
 
 		 207 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.610567  normal  0.0747789 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4250  glutathione S-transferase domain-containing protein  31 
 
 		 209 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5005  Glutathione S-transferase domain  31.66 
 
 		 208 aa  95.9  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.286975  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1162  glutathione S-transferase family protein  30.5 
 
 		 209 aa  95.1  6e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0910  Glutathione S-transferase domain  30.46 
 
 		 203 aa  95.1  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1704  Glutathione S-transferase domain protein  36.04 
 
 		 212 aa  95.1  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0690203  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3325  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.65 
 
 		 205 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1196  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.65 
 
 		 209 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4962  Glutathione S-transferase domain protein  32.51 
 
 		 219 aa  94  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0661  Glutathione S-transferase domain protein  31.47 
 
 		 203 aa  93.6  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5040  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.25 
 
 		 221 aa  92.8  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.367084 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5417  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.98 
 
 		 214 aa  93.2  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1393  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.55 
 
 		 222 aa  92.4  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2966  Glutathione S-transferase domain protein  31.55 
 
 		 222 aa  92.4  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.183097  normal  0.112262 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3573  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.47 
 
 		 214 aa  92.8  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.242235  normal  0.0117224 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>