More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0017 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_0017  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 
192 aa  389  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268724  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4794  Glutathione S-transferase domain  61.46 
 
 
197 aa  249  1e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.915466  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2587  Glutathione S-transferase domain  64.74 
 
 
195 aa  247  8e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.751074  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3587  glutathione S-transferase domain-containing protein  59.9 
 
 
203 aa  247  9e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0707812  hitchhiker  0.000377551 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3910  glutathione S-transferase-like  61.46 
 
 
201 aa  244  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2312  glutathione S-transferase domain-containing protein  64.21 
 
 
195 aa  244  8e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0196665 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1985  glutathione S-transferase  59.9 
 
 
207 aa  240  7.999999999999999e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1820  putative glutathione S-transferase  60.42 
 
 
196 aa  237  9e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2269  Glutathione S-transferase domain  62.11 
 
 
195 aa  236  1e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.333911  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1311  glutathione S-transferase-like protein  59.38 
 
 
196 aa  236  1e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.55458  normal  0.181696 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1171  Glutathione S-transferase domain protein  52.08 
 
 
204 aa  211  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245566  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003296  glutathione transferase  52.33 
 
 
198 aa  206  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3511  glutathione S-transferase-like protein  49.21 
 
 
198 aa  195  3e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43110  putative glutathione S-transferase  50.78 
 
 
200 aa  194  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000318488  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3617  putative glutathione S-transferase  51.3 
 
 
200 aa  194  6e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1399  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.34 
 
 
200 aa  192  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250488  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1821  glutathione S-transferase family protein  50.8 
 
 
200 aa  191  6e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0623474  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1471  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.98 
 
 
200 aa  191  8e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3211  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.26 
 
 
198 aa  189  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3890  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.27 
 
 
200 aa  189  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.19285 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2495  putative glutathione S-transferase  47.37 
 
 
204 aa  188  4e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00712937  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2032  glutathione S-transferase family protein  50 
 
 
200 aa  188  4e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3827  putative glutathione S-transferase  49.21 
 
 
208 aa  187  7e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0196  glutathione S-transferase-like  49.47 
 
 
204 aa  187  8e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04080  probable glutathione S-transferase  45.13 
 
 
199 aa  186  3e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1842  glutathione S-transferase  47.92 
 
 
200 aa  184  5e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260742  normal  0.324274 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1429  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.66 
 
 
200 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114439  normal  0.299107 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2670  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.73 
 
 
200 aa  181  7e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.237361  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0503  Glutathione S-transferase domain protein  43.01 
 
 
208 aa  171  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0544052  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3893  glutathione S-transferase-like protein  44.62 
 
 
210 aa  170  9e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2139  glutathione S-transferase  41.45 
 
 
203 aa  170  1e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.041384 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2296  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.83 
 
 
204 aa  169  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.879102 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04799  glutathione S-transferase  44.97 
 
 
209 aa  168  4e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2641  Glutathione S-transferase domain  46.03 
 
 
218 aa  166  2.9999999999999998e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.213293 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3756  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.64 
 
 
208 aa  165  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0412  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.16 
 
 
203 aa  163  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1387  Glutathione S-transferase domain protein  41.05 
 
 
201 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1493  glutathione S-transferase family protein  45.5 
 
 
203 aa  161  4.0000000000000004e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.695225  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1447  glutathione S-transferase family protein  45.5 
 
 
203 aa  161  4.0000000000000004e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277938  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1101  glutathione S-transferase-like  42.05 
 
 
256 aa  156  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1421  glutathione S-transferase domain protein  40.21 
 
 
201 aa  155  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2738  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.21 
 
 
216 aa  150  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2981  glutathione S-transferase  40.51 
 
 
216 aa  147  8e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.897939  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1296  glutathione S-transferase-like protein  41.03 
 
 
228 aa  144  5e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.041604  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4810  Glutathione S-transferase domain  41.03 
 
 
217 aa  144  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1799  putative glutathione S-transferase (GST)  39.49 
 
 
216 aa  143  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.602523  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4124  glutathione S-transferase-like  39.69 
 
 
217 aa  141  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.590461  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3927  glutathione S-transferase-like  38.97 
 
 
228 aa  141  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3618  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.95 
 
 
201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.822578  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0134  Glutathione S-transferase domain protein  39.78 
 
 
209 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5413  Glutathione S-transferase domain protein  32.81 
 
 
207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2547  glutathione S-transferase-like  36.79 
 
 
203 aa  112  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.277247  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3323  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.36 
 
 
227 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0187385  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0661  Glutathione S-transferase domain protein  35.35 
 
 
203 aa  103  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1347  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.06 
 
 
205 aa  103  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3573  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.41 
 
 
214 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.242235  normal  0.0117224 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5417  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.41 
 
 
214 aa  102  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556283  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1057  Glutathione S-transferase domain protein  31.86 
 
 
203 aa  101  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0628244  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0910  Glutathione S-transferase domain  32.99 
 
 
203 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4686  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.52 
 
 
205 aa  100  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1128  glutathione S-transferase-like  34.92 
 
 
206 aa  100  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3670  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.73 
 
 
214 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630105  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4693  glutathione S-transferase-like  36.73 
 
 
214 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3851  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.73 
 
 
214 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.216591  normal  0.461755 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4962  Glutathione S-transferase domain protein  37.06 
 
 
219 aa  99.4  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2762  glutathione S-transferase-like  34.36 
 
 
206 aa  98.6  4e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1904  Glutathione S-transferase domain protein  32.82 
 
 
199 aa  98.6  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142458  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8513  Glutathione S-transferase domain protein  32.49 
 
 
205 aa  98.6  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700179  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2741  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.36 
 
 
203 aa  98.6  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.492964 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4125  glutathione S-transferase domain-containing protein  32 
 
 
203 aa  98.6  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4952  Glutathione S-transferase domain  33.85 
 
 
208 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.246161 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2439  glutathione S-transferase-like protein  36.22 
 
 
214 aa  97.4  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.414826  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1180  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.14 
 
 
207 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.610567  normal  0.0747789 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4489  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 
208 aa  96.3  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5040  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.26 
 
 
221 aa  97.1  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.367084 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3433  glutathione S-transferase family protein  31.16 
 
 
214 aa  96.3  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000284771 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5005  Glutathione S-transferase domain  32.82 
 
 
208 aa  95.1  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.286975  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1196  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.63 
 
 
209 aa  95.1  6e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1162  glutathione S-transferase family protein  32.63 
 
 
209 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0805  putative glutathione S-transferase  31.41 
 
 
216 aa  93.6  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.671378  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0107  glutathione S-transferase  32.65 
 
 
214 aa  93.2  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1267  glutathione S-transferase  32.65 
 
 
214 aa  93.2  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261228  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0125  glutathione S-transferase  32.65 
 
 
266 aa  93.2  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0407  glutathione S-transferase  32.32 
 
 
217 aa  92.8  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6230  putative glutathione S-transferase  33.33 
 
 
207 aa  92.4  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0344917  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2670  putative glutathione S-transferase  32.14 
 
 
297 aa  92  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1071  glutathione S-transferase  32.14 
 
 
214 aa  91.7  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.292672  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0925  putative glutathione S-transferase  32.82 
 
 
203 aa  92  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.324873  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2817  glutathione S-transferase  32.14 
 
 
300 aa  92  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4051  putative glutathione S-transferase  33.16 
 
 
223 aa  91.3  8e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.838028 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4250  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.28 
 
 
209 aa  91.3  8e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0645  glutathione S-transferase-like  33.33 
 
 
225 aa  91.3  9e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.722095  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1106  Glutathione S-transferase domain  30.77 
 
 
203 aa  90.9  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2973  glutathione S-transferase-like  32.43 
 
 
206 aa  90.5  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00286843  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4359  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.73 
 
 
222 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3224  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.79 
 
 
208 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.395203  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4773  glutathione S-transferase-like  35.53 
 
 
206 aa  89.4  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.122319  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0144  glutathione S-transferase  33 
 
 
230 aa  89  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5079  Glutathione S-transferase domain  35.68 
 
 
213 aa  89  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.242731  hitchhiker  0.00740675 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2245  glutathione S-transferase-like  30.46 
 
 
220 aa  88.2  7e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.556118  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>