More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1820 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_1820  putative glutathione S-transferase  100 
 
 
196 aa  402  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4794  Glutathione S-transferase domain  68.23 
 
 
197 aa  277  6e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.915466  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1311  glutathione S-transferase-like protein  68.75 
 
 
196 aa  271  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.55458  normal  0.181696 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3910  glutathione S-transferase-like  67.19 
 
 
201 aa  271  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1171  Glutathione S-transferase domain protein  61.98 
 
 
204 aa  242  3e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245566  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2587  Glutathione S-transferase domain  60 
 
 
195 aa  240  9e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.751074  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2312  glutathione S-transferase domain-containing protein  60 
 
 
195 aa  239  1e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0196665 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0017  glutathione S-transferase domain-containing protein  60.42 
 
 
192 aa  237  9e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268724  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2269  Glutathione S-transferase domain  59.47 
 
 
195 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.333911  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3587  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.19 
 
 
203 aa  230  8.000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0707812  hitchhiker  0.000377551 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1985  glutathione S-transferase  53.65 
 
 
207 aa  214  8e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003296  glutathione transferase  47.85 
 
 
198 aa  192  4e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43110  putative glutathione S-transferase  50.27 
 
 
200 aa  191  7e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000318488  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3617  putative glutathione S-transferase  50.81 
 
 
200 aa  187  8e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1429  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.46 
 
 
200 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114439  normal  0.299107 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3890  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.46 
 
 
200 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.19285 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0196  glutathione S-transferase-like  47.62 
 
 
204 aa  185  4e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1399  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.91 
 
 
200 aa  184  5e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250488  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1821  glutathione S-transferase family protein  48.91 
 
 
200 aa  184  6e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0623474  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3211  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.19 
 
 
198 aa  184  6e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2032  glutathione S-transferase family protein  47.4 
 
 
200 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3827  putative glutathione S-transferase  47.62 
 
 
208 aa  180  9.000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1842  glutathione S-transferase  48.37 
 
 
200 aa  180  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260742  normal  0.324274 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04080  probable glutathione S-transferase  44.9 
 
 
199 aa  179  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3511  glutathione S-transferase-like protein  44.44 
 
 
198 aa  178  4.999999999999999e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2139  glutathione S-transferase  41.67 
 
 
203 aa  177  8e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.041384 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1471  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.32 
 
 
200 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2670  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.11 
 
 
200 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.237361  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1387  Glutathione S-transferase domain protein  42.62 
 
 
201 aa  164  9e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0503  Glutathione S-transferase domain protein  41.3 
 
 
208 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0544052  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2296  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.28 
 
 
204 aa  162  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.879102 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2495  putative glutathione S-transferase  40.86 
 
 
204 aa  160  8.000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00712937  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3893  glutathione S-transferase-like protein  45 
 
 
210 aa  160  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1421  glutathione S-transferase domain protein  41.9 
 
 
201 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0412  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.41 
 
 
203 aa  150  8e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1493  glutathione S-transferase family protein  42.25 
 
 
203 aa  146  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.695225  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1447  glutathione S-transferase family protein  42.25 
 
 
203 aa  146  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277938  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3756  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.78 
 
 
208 aa  142  4e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2738  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.38 
 
 
216 aa  140  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04799  glutathione S-transferase  40.32 
 
 
209 aa  137  7.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1101  glutathione S-transferase-like  39.68 
 
 
256 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2641  Glutathione S-transferase domain  41.08 
 
 
218 aa  133  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.213293 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2981  glutathione S-transferase  40.21 
 
 
216 aa  132  3e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.897939  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4810  Glutathione S-transferase domain  40.74 
 
 
217 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1296  glutathione S-transferase-like protein  40.21 
 
 
228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.041604  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1799  putative glutathione S-transferase (GST)  38.1 
 
 
216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.602523  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0134  Glutathione S-transferase domain protein  40.32 
 
 
209 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4124  glutathione S-transferase-like  38.83 
 
 
217 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.590461  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3927  glutathione S-transferase-like  38.62 
 
 
228 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5413  Glutathione S-transferase domain protein  33.7 
 
 
207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3851  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.87 
 
 
214 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.216591  normal  0.461755 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2547  glutathione S-transferase-like  32.31 
 
 
203 aa  100  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.277247  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3618  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.22 
 
 
201 aa  100  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.822578  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4693  glutathione S-transferase-like  36.87 
 
 
214 aa  99.8  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3670  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.87 
 
 
214 aa  99.8  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630105  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4250  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.74 
 
 
209 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2439  glutathione S-transferase-like protein  35.2 
 
 
214 aa  96.3  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.414826  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1347  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.84 
 
 
205 aa  95.1  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1180  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.39 
 
 
207 aa  94.4  9e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.610567  normal  0.0747789 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1162  glutathione S-transferase family protein  34.43 
 
 
209 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4962  Glutathione S-transferase domain protein  35.32 
 
 
219 aa  93.2  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1196  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.43 
 
 
209 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3573  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.86 
 
 
214 aa  92  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.242235  normal  0.0117224 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1057  Glutathione S-transferase domain protein  30.77 
 
 
203 aa  92  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0628244  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5040  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.23 
 
 
221 aa  92  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.367084 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3323  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.67 
 
 
227 aa  91.7  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0187385  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4686  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.62 
 
 
205 aa  91.3  8e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5417  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.86 
 
 
214 aa  91.3  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556283  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4925  Glutathione S-transferase domain protein  32.97 
 
 
223 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18954  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2762  glutathione S-transferase-like  31.82 
 
 
206 aa  90.9  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4489  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.14 
 
 
208 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1775  glutathione S-transferase  36.05 
 
 
208 aa  90.5  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000137039 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0910  Glutathione S-transferase domain  31.28 
 
 
203 aa  90.5  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1699  glutathione S-transferase family protein  33.85 
 
 
218 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5079  Glutathione S-transferase domain  35.75 
 
 
213 aa  88.6  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.242731  hitchhiker  0.00740675 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4895  Glutathione S-transferase domain  35.47 
 
 
208 aa  88.2  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.123273 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5005  Glutathione S-transferase domain  32.49 
 
 
208 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.286975  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0805  putative glutathione S-transferase  29.35 
 
 
216 aa  86.7  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.671378  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0407  glutathione S-transferase  33.68 
 
 
217 aa  86.7  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0107  glutathione S-transferase  33.68 
 
 
214 aa  86.3  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0125  glutathione S-transferase  33.68 
 
 
266 aa  85.9  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3224  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.53 
 
 
208 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.395203  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1904  Glutathione S-transferase domain protein  30.46 
 
 
199 aa  85.9  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142458  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1267  glutathione S-transferase  33.68 
 
 
214 aa  86.3  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261228  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4359  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.46 
 
 
222 aa  85.5  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4952  Glutathione S-transferase domain  31.12 
 
 
208 aa  85.5  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.246161 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6230  putative glutathione S-transferase  33.16 
 
 
207 aa  84.7  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0344917  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1887  Glutathione S-transferase domain protein  35.76 
 
 
206 aa  84.3  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2817  glutathione S-transferase  33.16 
 
 
300 aa  84.3  9e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3352  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.29 
 
 
208 aa  84.3  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148422  hitchhiker  0.0000403309 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0645  glutathione S-transferase-like  32.61 
 
 
225 aa  84.3  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.722095  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2764  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.79 
 
 
222 aa  84  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1416  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.26 
 
 
222 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0661  Glutathione S-transferase domain protein  31.82 
 
 
203 aa  83.2  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1087  glutathione S-transferase family protein  27.89 
 
 
222 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.983271 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3433  glutathione S-transferase family protein  31.72 
 
 
214 aa  83.6  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000284771 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2245  glutathione S-transferase-like  29.47 
 
 
220 aa  83.6  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.556118  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2866  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.79 
 
 
222 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0201506 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1393  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.26 
 
 
222 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3104  Glutathione S-transferase domain protein  32.64 
 
 
207 aa  82.8  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>