More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3618 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008687  Pden_3618  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 
201 aa  408  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.822578  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1493  glutathione S-transferase family protein  47.5 
 
 
203 aa  180  1e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.695225  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1447  glutathione S-transferase family protein  47.5 
 
 
203 aa  180  1e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277938  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3511  glutathione S-transferase-like protein  45.85 
 
 
198 aa  159  3e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2296  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.77 
 
 
204 aa  157  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.879102 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2495  putative glutathione S-transferase  41.67 
 
 
204 aa  153  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00712937  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2032  glutathione S-transferase family protein  44.78 
 
 
200 aa  150  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1842  glutathione S-transferase  43.28 
 
 
200 aa  145  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260742  normal  0.324274 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04799  glutathione S-transferase  42.93 
 
 
209 aa  145  3e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04080  probable glutathione S-transferase  38.73 
 
 
199 aa  145  6e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2670  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.86 
 
 
200 aa  144  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.237361  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0196  glutathione S-transferase-like  40.2 
 
 
204 aa  142  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3211  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.5 
 
 
198 aa  142  5e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003296  glutathione transferase  41.5 
 
 
198 aa  142  5e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0503  Glutathione S-transferase domain protein  39.79 
 
 
208 aa  142  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0544052  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3893  glutathione S-transferase-like protein  38.19 
 
 
210 aa  139  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2139  glutathione S-transferase  39.27 
 
 
203 aa  138  3.9999999999999997e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.041384 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1421  glutathione S-transferase domain protein  36 
 
 
201 aa  138  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2738  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.29 
 
 
216 aa  138  6e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1399  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.33 
 
 
200 aa  138  7e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250488  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4124  glutathione S-transferase-like  42.35 
 
 
217 aa  138  7e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.590461  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1821  glutathione S-transferase family protein  40.82 
 
 
200 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0623474  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3890  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.82 
 
 
200 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.19285 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1387  Glutathione S-transferase domain protein  36 
 
 
201 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43110  putative glutathione S-transferase  38.61 
 
 
200 aa  136  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000318488  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1429  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.82 
 
 
200 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114439  normal  0.299107 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3617  putative glutathione S-transferase  38.61 
 
 
200 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3756  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.2 
 
 
208 aa  134  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3827  putative glutathione S-transferase  39.41 
 
 
208 aa  134  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3927  glutathione S-transferase-like  38.97 
 
 
228 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1296  glutathione S-transferase-like protein  38.97 
 
 
228 aa  132  5e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.041604  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4810  Glutathione S-transferase domain  39.49 
 
 
217 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1799  putative glutathione S-transferase (GST)  38.81 
 
 
216 aa  127  8.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.602523  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0017  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.95 
 
 
192 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268724  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1471  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.61 
 
 
200 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2641  Glutathione S-transferase domain  39.9 
 
 
218 aa  125  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.213293 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2981  glutathione S-transferase  38.78 
 
 
216 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.897939  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0412  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.97 
 
 
203 aa  125  6e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1985  glutathione S-transferase  39.49 
 
 
207 aa  125  6e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1101  glutathione S-transferase-like  37.5 
 
 
256 aa  122  4e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3910  glutathione S-transferase-like  38.83 
 
 
201 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5413  Glutathione S-transferase domain protein  38.69 
 
 
207 aa  119  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2587  Glutathione S-transferase domain  39.27 
 
 
195 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.751074  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3587  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.89 
 
 
203 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0707812  hitchhiker  0.000377551 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2312  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.74 
 
 
195 aa  115  5e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0196665 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4794  Glutathione S-transferase domain  37.69 
 
 
197 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.915466  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4125  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.95 
 
 
203 aa  109  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2269  Glutathione S-transferase domain  37.7 
 
 
195 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.333911  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1311  glutathione S-transferase-like protein  36.6 
 
 
196 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.55458  normal  0.181696 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8513  Glutathione S-transferase domain protein  32.16 
 
 
205 aa  106  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700179  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1347  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.17 
 
 
205 aa  104  8e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0910  Glutathione S-transferase domain  33.99 
 
 
203 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4686  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.67 
 
 
205 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4051  putative glutathione S-transferase  33.98 
 
 
223 aa  102  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.838028 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2547  glutathione S-transferase-like  36.51 
 
 
203 aa  102  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.277247  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1171  Glutathione S-transferase domain protein  34.21 
 
 
204 aa  100  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245566  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2762  glutathione S-transferase-like  33.67 
 
 
206 aa  100  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1820  putative glutathione S-transferase  34.22 
 
 
196 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1057  Glutathione S-transferase domain protein  32.51 
 
 
203 aa  99  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0628244  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4489  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.71 
 
 
208 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1106  Glutathione S-transferase domain  31.16 
 
 
203 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4952  Glutathione S-transferase domain  31.22 
 
 
208 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.246161 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3285  putative glutathione S-transferase  33.66 
 
 
197 aa  95.9  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.549218  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24830  putative glutathione S-transferase  34.98 
 
 
198 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6230  putative glutathione S-transferase  32.84 
 
 
207 aa  95.5  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0344917  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1180  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.5 
 
 
207 aa  94.7  9e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.610567  normal  0.0747789 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0661  Glutathione S-transferase domain protein  33.17 
 
 
203 aa  94.4  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0134  Glutathione S-transferase domain protein  35.98 
 
 
209 aa  94  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0925  putative glutathione S-transferase  31.66 
 
 
203 aa  94.4  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.324873  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5005  Glutathione S-transferase domain  32.68 
 
 
208 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.286975  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2104  putative glutathione S-transferase  33.83 
 
 
198 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3573  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.19 
 
 
214 aa  92  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.242235  normal  0.0117224 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5417  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.19 
 
 
214 aa  91.7  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556283  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3224  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.15 
 
 
208 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.395203  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2869  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.03 
 
 
213 aa  90.1  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.491062  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3947  Glutathione S-transferase domain protein  30.05 
 
 
207 aa  89.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4962  Glutathione S-transferase domain protein  34.16 
 
 
219 aa  88.6  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5568  glutathione S-transferase domain-containing protein  32 
 
 
205 aa  89  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446565  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2245  glutathione S-transferase-like  31.55 
 
 
220 aa  88.6  6e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.556118  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3325  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.15 
 
 
205 aa  88.6  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3323  glutathione S-transferase domain-containing protein  32 
 
 
227 aa  88.2  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0187385  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5040  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.23 
 
 
221 aa  87  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.367084 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5690  glutathione S-transferase-like protein  30.48 
 
 
227 aa  84.7  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.529075 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4250  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.64 
 
 
209 aa  84.7  8e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4729  glutathione S-transferase  27.64 
 
 
203 aa  84  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0556098  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1162  glutathione S-transferase family protein  28.64 
 
 
209 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1196  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.64 
 
 
209 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2439  glutathione S-transferase-like protein  30.15 
 
 
214 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.414826  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0645  glutathione S-transferase-like  30.35 
 
 
225 aa  82.8  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.722095  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0209  glutathione S-transferase-like  29.1 
 
 
233 aa  82.4  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3851  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.65 
 
 
214 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.216591  normal  0.461755 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4693  glutathione S-transferase-like  29.5 
 
 
214 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0837  glutathione S-transferase domain protein  33.17 
 
 
211 aa  79.7  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.613396 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3670  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.5 
 
 
214 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630105  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1708  Glutathione S-transferase domain  31.03 
 
 
199 aa  79.3  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1873  Glutathione S-transferase domain protein  29.65 
 
 
200 aa  79  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0107  glutathione S-transferase  31.53 
 
 
214 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1267  glutathione S-transferase  31.53 
 
 
214 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261228  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1071  glutathione S-transferase  31.53 
 
 
214 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.292672  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0125  glutathione S-transferase  31.53 
 
 
266 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>