More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2869 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008687  Pden_2869  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 
213 aa  442  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.491062  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1560  glutathione S-transferase-like  65.55 
 
 
210 aa  287  1e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.25247  normal  0.599029 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0837  glutathione S-transferase domain protein  65.2 
 
 
211 aa  275  5e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.613396 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2973  glutathione S-transferase-like  53.5 
 
 
206 aa  222  3e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00286843  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2207  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.5 
 
 
209 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3742  glutathione S-transferase family protein  50.99 
 
 
208 aa  198  5e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.495095  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2021  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.99 
 
 
208 aa  197  7e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.203063  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0144  glutathione S-transferase  46.7 
 
 
230 aa  191  9e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0974  Glutathione S-transferase domain protein  44.83 
 
 
209 aa  184  8e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1180  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.52 
 
 
207 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.610567  normal  0.0747789 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3756  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.85 
 
 
208 aa  106  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5005  Glutathione S-transferase domain  35.03 
 
 
208 aa  105  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.286975  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4952  Glutathione S-transferase domain  33.17 
 
 
208 aa  105  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.246161 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1347  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.39 
 
 
205 aa  105  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4489  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.17 
 
 
208 aa  104  8e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3573  glutathione S-transferase domain-containing protein  33 
 
 
214 aa  102  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.242235  normal  0.0117224 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5417  glutathione S-transferase domain-containing protein  33 
 
 
214 aa  102  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556283  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4686  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.39 
 
 
205 aa  102  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3893  glutathione S-transferase-like protein  30.41 
 
 
210 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8513  Glutathione S-transferase domain protein  34.18 
 
 
205 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700179  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2139  glutathione S-transferase  32.47 
 
 
203 aa  97.8  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.041384 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2738  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.16 
 
 
216 aa  97.8  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3851  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.5 
 
 
214 aa  97.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.216591  normal  0.461755 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4693  glutathione S-transferase-like  32.5 
 
 
214 aa  97.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3670  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.5 
 
 
214 aa  97.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630105  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5690  glutathione S-transferase-like protein  32.65 
 
 
227 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.529075 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2439  glutathione S-transferase-like protein  31.79 
 
 
214 aa  96.3  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.414826  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3927  glutathione S-transferase-like  30.26 
 
 
228 aa  96.3  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1821  glutathione S-transferase family protein  32.62 
 
 
200 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0623474  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1296  glutathione S-transferase-like protein  30.26 
 
 
228 aa  95.5  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.041604  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1399  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.62 
 
 
200 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250488  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0910  Glutathione S-transferase domain  33.68 
 
 
203 aa  94.7  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4810  Glutathione S-transferase domain  30.26 
 
 
217 aa  94.4  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5568  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.28 
 
 
205 aa  94  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446565  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5040  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.47 
 
 
221 aa  94.4  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.367084 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3890  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.62 
 
 
200 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.19285 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2495  putative glutathione S-transferase  32.64 
 
 
204 aa  93.2  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00712937  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1106  Glutathione S-transferase domain  30.85 
 
 
203 aa  94  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0661  Glutathione S-transferase domain protein  32.28 
 
 
203 aa  93.6  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4250  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.12 
 
 
209 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04799  glutathione S-transferase  31.58 
 
 
209 aa  93.2  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1421  glutathione S-transferase domain protein  25.63 
 
 
201 aa  93.2  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4124  glutathione S-transferase-like  29.23 
 
 
217 aa  92.4  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.590461  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3325  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.22 
 
 
205 aa  92  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1387  Glutathione S-transferase domain protein  25.63 
 
 
201 aa  92.4  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1429  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.09 
 
 
200 aa  92  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114439  normal  0.299107 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3224  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.12 
 
 
208 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.395203  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5413  Glutathione S-transferase domain protein  32.09 
 
 
207 aa  91.3  9e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4051  putative glutathione S-transferase  31.31 
 
 
223 aa  91.3  9e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.838028 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2981  glutathione S-transferase  28.72 
 
 
216 aa  91.3  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.897939  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3618  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.03 
 
 
201 aa  90.1  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.822578  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0925  putative glutathione S-transferase  30.32 
 
 
203 aa  90.1  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.324873  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3511  glutathione S-transferase-like protein  28.57 
 
 
198 aa  90.1  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1799  putative glutathione S-transferase (GST)  29.08 
 
 
216 aa  89.7  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.602523  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2296  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.41 
 
 
204 aa  89.7  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.879102 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3617  putative glutathione S-transferase  32.62 
 
 
200 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1057  Glutathione S-transferase domain protein  31.58 
 
 
203 aa  89.4  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0628244  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3587  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.05 
 
 
203 aa  89  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0707812  hitchhiker  0.000377551 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1196  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.93 
 
 
209 aa  89  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43110  putative glutathione S-transferase  32.62 
 
 
200 aa  89  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000318488  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_004310  BR1493  glutathione S-transferase family protein  33.5 
 
 
203 aa  88.6  6e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.695225  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1447  glutathione S-transferase family protein  33.5 
 
 
203 aa  88.6  6e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277938  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4125  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.91 
 
 
203 aa  88.6  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6230  putative glutathione S-transferase  32.65 
 
 
207 aa  88.6  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0344917  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1101  glutathione S-transferase-like  28.72 
 
 
256 aa  88.6  7e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2547  glutathione S-transferase-like  30.93 
 
 
203 aa  88.6  7e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.277247  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3323  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.49 
 
 
227 aa  87.8  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0187385  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1162  glutathione S-transferase family protein  30.41 
 
 
209 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4773  glutathione S-transferase-like  27.41 
 
 
206 aa  87.4  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.122319  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0017  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.57 
 
 
192 aa  87.8  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268724  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4729  glutathione S-transferase  32.83 
 
 
203 aa  87  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0556098  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0503  Glutathione S-transferase domain protein  30.1 
 
 
208 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0544052  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0407  glutathione S-transferase  30.26 
 
 
217 aa  86.3  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3285  putative glutathione S-transferase  33.66 
 
 
197 aa  86.7  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.549218  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0107  glutathione S-transferase  30.77 
 
 
214 aa  85.9  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1267  glutathione S-transferase  30.77 
 
 
214 aa  85.9  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261228  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0196  glutathione S-transferase-like  29.74 
 
 
204 aa  85.9  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0125  glutathione S-transferase  30.77 
 
 
266 aa  85.5  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2817  glutathione S-transferase  32.14 
 
 
300 aa  85.5  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3211  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.69 
 
 
198 aa  85.9  5e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1873  Glutathione S-transferase domain protein  28.78 
 
 
200 aa  85.5  6e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0418  glutathione S-transferase  28.06 
 
 
226 aa  85.5  6e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0882437 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1842  glutathione S-transferase  30.69 
 
 
200 aa  84.7  9e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260742  normal  0.324274 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2032  glutathione S-transferase family protein  30.16 
 
 
200 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4359  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.84 
 
 
222 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2762  glutathione S-transferase-like  32.63 
 
 
206 aa  83.6  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0134  Glutathione S-transferase domain protein  30.61 
 
 
209 aa  84  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003296  glutathione transferase  28.5 
 
 
198 aa  83.6  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0645  glutathione S-transferase-like  28.43 
 
 
225 aa  83.2  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.722095  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3947  Glutathione S-transferase domain protein  29.79 
 
 
207 aa  82.8  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1071  glutathione S-transferase  30.26 
 
 
214 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.292672  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0097  glutathione S-transferase-like  32.32 
 
 
234 aa  82.4  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.472902  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2670  putative glutathione S-transferase  30.26 
 
 
297 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2349  glutathione S-transferase-like protein  31.6 
 
 
208 aa  82.4  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0771783 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3910  glutathione S-transferase-like  30.56 
 
 
201 aa  82  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3092  glutathione S-transferase domain-containing protein  29 
 
 
205 aa  81.6  0.000000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.061874 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24830  putative glutathione S-transferase  30.24 
 
 
198 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3195  Glutathione S-transferase domain  27.19 
 
 
233 aa  81.6  0.000000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.16528  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1171  Glutathione S-transferase domain protein  31.44 
 
 
204 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245566  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2670  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.95 
 
 
200 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.237361  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>