More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_5005 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_5005  Glutathione S-transferase domain  100 
 
 
208 aa  409  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.286975  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4952  Glutathione S-transferase domain  89.42 
 
 
208 aa  375  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.246161 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4489  glutathione S-transferase domain-containing protein  88.94 
 
 
208 aa  374  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8513  Glutathione S-transferase domain protein  76.35 
 
 
205 aa  315  2e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700179  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4686  glutathione S-transferase domain-containing protein  71.57 
 
 
205 aa  298  5e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1057  Glutathione S-transferase domain protein  70.44 
 
 
203 aa  290  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0628244  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0910  Glutathione S-transferase domain  69.95 
 
 
203 aa  288  4e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3325  glutathione S-transferase domain-containing protein  70.1 
 
 
205 aa  286  1e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3323  glutathione S-transferase domain-containing protein  69.46 
 
 
227 aa  285  5e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0187385  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4125  glutathione S-transferase domain-containing protein  70.44 
 
 
203 aa  280  8.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0661  Glutathione S-transferase domain protein  69.95 
 
 
203 aa  278  6e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1347  glutathione S-transferase domain-containing protein  67.16 
 
 
205 aa  271  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4250  glutathione S-transferase domain-containing protein  64.71 
 
 
209 aa  270  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1196  glutathione S-transferase domain-containing protein  66.01 
 
 
209 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1162  glutathione S-transferase family protein  65.02 
 
 
209 aa  268  4e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4051  putative glutathione S-transferase  67 
 
 
223 aa  265  4e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.838028 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3224  glutathione S-transferase domain-containing protein  63.55 
 
 
208 aa  265  4e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.395203  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1106  Glutathione S-transferase domain  65.52 
 
 
203 aa  263  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2439  glutathione S-transferase-like protein  66.18 
 
 
214 aa  262  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.414826  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4729  glutathione S-transferase  67 
 
 
203 aa  261  4e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0556098  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5568  glutathione S-transferase domain-containing protein  64.88 
 
 
205 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446565  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1180  glutathione S-transferase domain-containing protein  64.22 
 
 
207 aa  259  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.610567  normal  0.0747789 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3851  glutathione S-transferase domain-containing protein  64.71 
 
 
214 aa  259  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.216591  normal  0.461755 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4693  glutathione S-transferase-like  64.71 
 
 
214 aa  258  4e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3670  glutathione S-transferase domain-containing protein  64.71 
 
 
214 aa  258  4e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630105  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5417  glutathione S-transferase domain-containing protein  64.22 
 
 
214 aa  257  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556283  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3573  glutathione S-transferase domain-containing protein  64.22 
 
 
214 aa  256  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.242235  normal  0.0117224 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5690  glutathione S-transferase-like protein  60.78 
 
 
227 aa  254  5e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.529075 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0925  putative glutathione S-transferase  65.52 
 
 
203 aa  254  5e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.324873  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2762  glutathione S-transferase-like  64.88 
 
 
206 aa  254  9e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5040  glutathione S-transferase domain-containing protein  63.46 
 
 
221 aa  252  3e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.367084 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0407  glutathione S-transferase  61.27 
 
 
217 aa  237  6.999999999999999e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2817  glutathione S-transferase  60.78 
 
 
300 aa  236  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0125  glutathione S-transferase  60.29 
 
 
266 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1267  glutathione S-transferase  60.29 
 
 
214 aa  234  8e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261228  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0107  glutathione S-transferase  60.29 
 
 
214 aa  234  8e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5079  Glutathione S-transferase domain  56.65 
 
 
213 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.242731  hitchhiker  0.00740675 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2670  putative glutathione S-transferase  60.29 
 
 
297 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1071  glutathione S-transferase  60.29 
 
 
214 aa  232  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.292672  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4962  Glutathione S-transferase domain protein  53.4 
 
 
219 aa  221  7e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0645  glutathione S-transferase-like  54.63 
 
 
225 aa  221  9e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.722095  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6230  putative glutathione S-transferase  59.11 
 
 
207 aa  208  4e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0344917  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1128  glutathione S-transferase-like  50.75 
 
 
206 aa  206  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3433  glutathione S-transferase family protein  46.27 
 
 
214 aa  198  3.9999999999999996e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000284771 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2245  glutathione S-transferase-like  53.47 
 
 
220 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.556118  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1904  Glutathione S-transferase domain protein  49.74 
 
 
199 aa  195  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142458  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3285  putative glutathione S-transferase  50.25 
 
 
197 aa  192  3e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.549218  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0462  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.49 
 
 
205 aa  185  5e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.269396 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3092  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.74 
 
 
205 aa  183  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.061874 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1708  Glutathione S-transferase domain  46.67 
 
 
199 aa  176  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3947  Glutathione S-transferase domain protein  46.67 
 
 
207 aa  176  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2104  putative glutathione S-transferase  45.92 
 
 
198 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1873  Glutathione S-transferase domain protein  46.91 
 
 
200 aa  169  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0797  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.42 
 
 
205 aa  167  7e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24830  putative glutathione S-transferase  44.39 
 
 
198 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3700  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.22 
 
 
202 aa  129  5.0000000000000004e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2349  glutathione S-transferase-like protein  38.78 
 
 
208 aa  127  8.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0771783 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1799  putative glutathione S-transferase (GST)  35.07 
 
 
216 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.602523  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5869  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.97 
 
 
215 aa  124  7e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1296  glutathione S-transferase-like protein  36.76 
 
 
228 aa  122  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.041604  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4810  Glutathione S-transferase domain  37.25 
 
 
217 aa  121  6e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0196  glutathione S-transferase-like  35.12 
 
 
204 aa  119  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3511  glutathione S-transferase-like protein  34.17 
 
 
198 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1101  glutathione S-transferase-like  37.26 
 
 
256 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3211  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.5 
 
 
198 aa  118  7e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2296  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.32 
 
 
204 aa  117  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.879102 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2738  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.76 
 
 
216 aa  117  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4463  Glutathione S-transferase domain  39.11 
 
 
220 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0595447 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2981  glutathione S-transferase  36.28 
 
 
216 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.897939  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3893  glutathione S-transferase-like protein  32.2 
 
 
210 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3927  glutathione S-transferase-like  35.47 
 
 
228 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6467  Glutathione S-transferase domain protein  38.92 
 
 
219 aa  115  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1842  glutathione S-transferase  33.17 
 
 
200 aa  115  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260742  normal  0.324274 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1821  glutathione S-transferase family protein  34.67 
 
 
200 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0623474  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4124  glutathione S-transferase-like  34.62 
 
 
217 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.590461  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3890  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.17 
 
 
200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.19285 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2032  glutathione S-transferase family protein  33.17 
 
 
200 aa  112  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1399  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.67 
 
 
200 aa  111  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250488  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1704  Glutathione S-transferase domain protein  36.45 
 
 
212 aa  111  8.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0690203  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04799  glutathione S-transferase  32.02 
 
 
209 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1387  Glutathione S-transferase domain protein  29.15 
 
 
201 aa  109  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2641  Glutathione S-transferase domain  33.82 
 
 
218 aa  109  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.213293 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43110  putative glutathione S-transferase  33.17 
 
 
200 aa  108  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000318488  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1429  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.67 
 
 
200 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114439  normal  0.299107 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3617  putative glutathione S-transferase  33.17 
 
 
200 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3756  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.1 
 
 
208 aa  105  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2869  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.03 
 
 
213 aa  105  5e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.491062  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4794  Glutathione S-transferase domain  36.5 
 
 
197 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.915466  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2670  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.67 
 
 
200 aa  105  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.237361  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2547  glutathione S-transferase-like  34.87 
 
 
203 aa  104  9e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.277247  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1421  glutathione S-transferase domain protein  28.14 
 
 
201 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1256  glutathione S-transferase  38.02 
 
 
184 aa  104  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.522192  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2139  glutathione S-transferase  28.36 
 
 
203 aa  104  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.041384 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5423  Gst12 glutathione-S-transferase  32.37 
 
 
210 aa  103  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.355245  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3155  hypothetical protein  33.82 
 
 
207 aa  102  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.423769  normal  0.476319 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1010  glutathione S-transferase-like protein  36.96 
 
 
215 aa  102  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0403399  normal  0.226457 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2587  Glutathione S-transferase domain  35.6 
 
 
195 aa  100  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.751074  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04080  probable glutathione S-transferase  28.22 
 
 
199 aa  100  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1493  glutathione S-transferase family protein  33.83 
 
 
203 aa  100  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.695225  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1447  glutathione S-transferase family protein  33.83 
 
 
203 aa  100  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277938  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>