More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2296 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_2296  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 
204 aa  425  1e-118  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.879102 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2738  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.35 
 
 
216 aa  226  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3893  glutathione S-transferase-like protein  53.03 
 
 
210 aa  221  6e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1821  glutathione S-transferase family protein  55.84 
 
 
200 aa  220  9e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0623474  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4124  glutathione S-transferase-like  52.5 
 
 
217 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.590461  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3890  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.33 
 
 
200 aa  218  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.19285 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1399  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.82 
 
 
200 aa  217  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250488  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1421  glutathione S-transferase domain protein  49.75 
 
 
201 aa  216  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1842  glutathione S-transferase  53.81 
 
 
200 aa  215  4e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260742  normal  0.324274 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3927  glutathione S-transferase-like  51.74 
 
 
228 aa  214  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1429  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.31 
 
 
200 aa  214  9e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114439  normal  0.299107 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4810  Glutathione S-transferase domain  52.76 
 
 
217 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1387  Glutathione S-transferase domain protein  49.24 
 
 
201 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1799  putative glutathione S-transferase (GST)  49.75 
 
 
216 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.602523  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1296  glutathione S-transferase-like protein  51.76 
 
 
228 aa  211  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.041604  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2670  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.81 
 
 
200 aa  210  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.237361  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1101  glutathione S-transferase-like  52.53 
 
 
256 aa  210  1e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43110  putative glutathione S-transferase  52.28 
 
 
200 aa  210  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000318488  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2981  glutathione S-transferase  52.02 
 
 
216 aa  209  3e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.897939  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3617  putative glutathione S-transferase  51.78 
 
 
200 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1493  glutathione S-transferase family protein  51 
 
 
203 aa  206  2e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.695225  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1447  glutathione S-transferase family protein  51 
 
 
203 aa  206  2e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277938  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2032  glutathione S-transferase family protein  51.78 
 
 
200 aa  206  3e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2139  glutathione S-transferase  53.37 
 
 
203 aa  203  2e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.041384 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3211  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.01 
 
 
198 aa  202  2e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04799  glutathione S-transferase  49.51 
 
 
209 aa  203  2e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3827  putative glutathione S-transferase  52.76 
 
 
208 aa  201  5e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04080  probable glutathione S-transferase  48.74 
 
 
199 aa  200  9e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3511  glutathione S-transferase-like protein  50.5 
 
 
198 aa  198  6e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0503  Glutathione S-transferase domain protein  52.63 
 
 
208 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0544052  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2495  putative glutathione S-transferase  47.74 
 
 
204 aa  193  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00712937  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0196  glutathione S-transferase-like  47.74 
 
 
204 aa  191  6e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2641  Glutathione S-transferase domain  49 
 
 
218 aa  187  7e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.213293 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003296  glutathione transferase  46.46 
 
 
198 aa  187  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2587  Glutathione S-transferase domain  53.48 
 
 
195 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.751074  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3587  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.48 
 
 
203 aa  179  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0707812  hitchhiker  0.000377551 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2312  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.41 
 
 
195 aa  179  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0196665 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1471  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.69 
 
 
200 aa  176  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2269  Glutathione S-transferase domain  49.48 
 
 
195 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.333911  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1985  glutathione S-transferase  46.08 
 
 
207 aa  173  1.9999999999999998e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3756  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.69 
 
 
208 aa  171  5.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0412  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.77 
 
 
203 aa  171  7.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0017  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.83 
 
 
192 aa  169  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268724  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1311  glutathione S-transferase-like protein  48.39 
 
 
196 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.55458  normal  0.181696 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4794  Glutathione S-transferase domain  47.89 
 
 
197 aa  165  4e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.915466  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1171  Glutathione S-transferase domain protein  46.88 
 
 
204 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245566  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3910  glutathione S-transferase-like  47.09 
 
 
201 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1820  putative glutathione S-transferase  46.28 
 
 
196 aa  162  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3618  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.77 
 
 
201 aa  157  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.822578  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2547  glutathione S-transferase-like  42.13 
 
 
203 aa  154  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.277247  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0134  Glutathione S-transferase domain protein  43.68 
 
 
209 aa  140  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5413  Glutathione S-transferase domain protein  37.37 
 
 
207 aa  136  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1708  Glutathione S-transferase domain  37.31 
 
 
199 aa  125  6e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5005  Glutathione S-transferase domain  35.32 
 
 
208 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.286975  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2762  glutathione S-transferase-like  37.5 
 
 
206 aa  117  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4250  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.14 
 
 
209 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4489  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.15 
 
 
208 aa  115  5e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4962  Glutathione S-transferase domain protein  37.02 
 
 
219 aa  114  8.999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3285  putative glutathione S-transferase  36.14 
 
 
197 aa  114  8.999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.549218  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8513  Glutathione S-transferase domain protein  36.63 
 
 
205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700179  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1196  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.83 
 
 
209 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24830  putative glutathione S-transferase  38.73 
 
 
198 aa  112  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4952  Glutathione S-transferase domain  33.66 
 
 
208 aa  112  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.246161 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2104  putative glutathione S-transferase  37.38 
 
 
198 aa  112  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1162  glutathione S-transferase family protein  35.15 
 
 
209 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1347  glutathione S-transferase domain-containing protein  34 
 
 
205 aa  111  9e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3224  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.83 
 
 
208 aa  107  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.395203  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1057  Glutathione S-transferase domain protein  34.33 
 
 
203 aa  106  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0628244  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3573  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.33 
 
 
214 aa  106  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.242235  normal  0.0117224 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2439  glutathione S-transferase-like protein  34.83 
 
 
214 aa  106  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.414826  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1904  Glutathione S-transferase domain protein  31.84 
 
 
199 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142458  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1180  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.13 
 
 
207 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.610567  normal  0.0747789 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2245  glutathione S-transferase-like  33.5 
 
 
220 aa  105  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.556118  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5417  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.33 
 
 
214 aa  105  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556283  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4125  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.32 
 
 
203 aa  105  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6230  putative glutathione S-transferase  34.65 
 
 
207 aa  104  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0344917  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0645  glutathione S-transferase-like  34.48 
 
 
225 aa  104  8e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.722095  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5040  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.16 
 
 
221 aa  103  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.367084 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4686  glutathione S-transferase domain-containing protein  33 
 
 
205 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3670  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.83 
 
 
214 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630105  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4693  glutathione S-transferase-like  33.83 
 
 
214 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3851  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.83 
 
 
214 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.216591  normal  0.461755 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0910  Glutathione S-transferase domain  33.83 
 
 
203 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3323  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.17 
 
 
227 aa  100  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0187385  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1001  glutathione S-transferase  32.28 
 
 
230 aa  99.8  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3433  glutathione S-transferase family protein  31.37 
 
 
214 aa  100  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000284771 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3983  glutathione S-transferase-like  31.18 
 
 
219 aa  100  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.409574  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0661  Glutathione S-transferase domain protein  34.33 
 
 
203 aa  99  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5079  Glutathione S-transferase domain  33.5 
 
 
213 aa  99  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.242731  hitchhiker  0.00740675 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1087  glutathione S-transferase family protein  30.65 
 
 
222 aa  99  5e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.983271 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4437  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.02 
 
 
206 aa  98.2  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2604  glutathione S-transferase  34.38 
 
 
227 aa  97.1  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.918843  normal  0.211055 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3325  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.84 
 
 
205 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1576  glutathione S-transferase family protein  28.72 
 
 
222 aa  96.7  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4359  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.84 
 
 
222 aa  96.3  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2563  Glutathione S-transferase domain protein  32.64 
 
 
209 aa  96.7  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0185641  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3226  glutathione S-transferase-like  33.16 
 
 
228 aa  96.7  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.74059  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2696  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.72 
 
 
222 aa  96.7  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036581 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1349  Glutathione S-transferase domain protein  34.41 
 
 
236 aa  95.9  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4925  Glutathione S-transferase domain protein  30.69 
 
 
223 aa  95.9  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18954  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>