More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3700 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_3700  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 
202 aa  407  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5417  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.76 
 
 
214 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556283  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3573  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.24 
 
 
214 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.242235  normal  0.0117224 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2439  glutathione S-transferase-like protein  37.76 
 
 
214 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.414826  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3851  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.88 
 
 
214 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.216591  normal  0.461755 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3323  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.73 
 
 
227 aa  133  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0187385  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4693  glutathione S-transferase-like  37.88 
 
 
214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3670  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.88 
 
 
214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630105  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3947  Glutathione S-transferase domain protein  37.62 
 
 
207 aa  131  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1347  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.76 
 
 
205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2762  glutathione S-transferase-like  38.5 
 
 
206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4250  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.88 
 
 
209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8513  Glutathione S-transferase domain protein  37.44 
 
 
205 aa  129  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700179  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5005  Glutathione S-transferase domain  36.22 
 
 
208 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.286975  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4952  Glutathione S-transferase domain  36.68 
 
 
208 aa  128  6e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.246161 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1162  glutathione S-transferase family protein  37.76 
 
 
209 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4489  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.69 
 
 
208 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4686  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.13 
 
 
205 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5040  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.73 
 
 
221 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.367084 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0107  glutathione S-transferase  35.71 
 
 
214 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1267  glutathione S-transferase  35.71 
 
 
214 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261228  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0125  glutathione S-transferase  35.71 
 
 
266 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2817  glutathione S-transferase  35.71 
 
 
300 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1196  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.24 
 
 
209 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0407  glutathione S-transferase  35.71 
 
 
217 aa  124  6e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1180  glutathione S-transferase domain-containing protein  37 
 
 
207 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.610567  normal  0.0747789 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1057  Glutathione S-transferase domain protein  34.34 
 
 
203 aa  123  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0628244  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4125  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.18 
 
 
203 aa  123  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1904  Glutathione S-transferase domain protein  37.19 
 
 
199 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142458  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1106  Glutathione S-transferase domain  36.18 
 
 
203 aa  123  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5568  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.55 
 
 
205 aa  122  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446565  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1071  glutathione S-transferase  35.2 
 
 
214 aa  122  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.292672  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2670  putative glutathione S-transferase  35.2 
 
 
297 aa  122  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5690  glutathione S-transferase-like protein  36.22 
 
 
227 aa  121  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.529075 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1128  glutathione S-transferase-like  35.68 
 
 
206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3325  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.37 
 
 
205 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0925  putative glutathione S-transferase  35.03 
 
 
203 aa  119  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.324873  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3224  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.71 
 
 
208 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.395203  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4051  putative glutathione S-transferase  34 
 
 
223 aa  116  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.838028 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5079  Glutathione S-transferase domain  34.69 
 
 
213 aa  115  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.242731  hitchhiker  0.00740675 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3285  putative glutathione S-transferase  34.87 
 
 
197 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.549218  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2104  putative glutathione S-transferase  34.52 
 
 
198 aa  115  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0910  Glutathione S-transferase domain  32.83 
 
 
203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6230  putative glutathione S-transferase  34.36 
 
 
207 aa  112  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0344917  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24830  putative glutathione S-transferase  36.55 
 
 
198 aa  112  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0661  Glutathione S-transferase domain protein  34.01 
 
 
203 aa  109  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3433  glutathione S-transferase family protein  34.03 
 
 
214 aa  108  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000284771 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4729  glutathione S-transferase  30.96 
 
 
203 aa  108  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0556098  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1873  Glutathione S-transferase domain protein  33.51 
 
 
200 aa  108  6e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2245  glutathione S-transferase-like  32.66 
 
 
220 aa  105  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.556118  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1708  Glutathione S-transferase domain  30.77 
 
 
199 aa  105  6e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0462  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.01 
 
 
205 aa  103  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.269396 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0645  glutathione S-transferase-like  32.67 
 
 
225 aa  102  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.722095  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3092  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.99 
 
 
205 aa  98.2  7e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.061874 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4962  Glutathione S-transferase domain protein  29.7 
 
 
219 aa  95.1  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0805  putative glutathione S-transferase  33.5 
 
 
216 aa  94  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.671378  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2296  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.29 
 
 
204 aa  91.3  8e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.879102 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3511  glutathione S-transferase-like protein  32.5 
 
 
198 aa  90.1  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1704  Glutathione S-transferase domain protein  28.78 
 
 
212 aa  87.4  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0690203  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5869  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.27 
 
 
215 aa  83.2  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0503  Glutathione S-transferase domain protein  30.73 
 
 
208 aa  83.2  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0544052  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0797  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.67 
 
 
205 aa  82.8  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003296  glutathione transferase  30.37 
 
 
198 aa  82.4  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2670  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.77 
 
 
200 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.237361  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3617  putative glutathione S-transferase  33 
 
 
200 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2139  glutathione S-transferase  26.96 
 
 
203 aa  79.7  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.041384 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3756  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.9 
 
 
208 aa  78.6  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49100  glutathione S-transferase  27.07 
 
 
209 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000404937 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2349  glutathione S-transferase-like protein  30.46 
 
 
208 aa  77.8  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0771783 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43110  putative glutathione S-transferase  32 
 
 
200 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000318488  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4150  glutathione S-transferase domain protein  33.15 
 
 
186 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.432751 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2032  glutathione S-transferase family protein  28.5 
 
 
200 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1842  glutathione S-transferase  29 
 
 
200 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260742  normal  0.324274 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4110  Glutathione S-transferase domain protein  33.15 
 
 
186 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1821  glutathione S-transferase family protein  29.69 
 
 
200 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0623474  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1387  Glutathione S-transferase domain protein  30.35 
 
 
201 aa  75.9  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0196  glutathione S-transferase-like  28.64 
 
 
204 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5803  Glutathione S-transferase domain protein  31.07 
 
 
181 aa  75.1  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5862  maleylacetoacetate isomerase  29.17 
 
 
213 aa  73.9  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.123467  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2869  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.47 
 
 
213 aa  73.9  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.491062  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3890  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.17 
 
 
200 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.19285 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1399  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.17 
 
 
200 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250488  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3623  Glutathione S-transferase domain  25.28 
 
 
211 aa  73.2  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1421  glutathione S-transferase domain protein  29.85 
 
 
201 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3211  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.69 
 
 
198 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2975  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.46 
 
 
234 aa  72.8  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.916048 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1171  Glutathione S-transferase domain protein  26.52 
 
 
204 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245566  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1101  glutathione S-transferase-like  28.5 
 
 
256 aa  72.4  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6467  Glutathione S-transferase domain protein  31.94 
 
 
219 aa  72  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2641  Glutathione S-transferase domain  25.13 
 
 
218 aa  71.6  0.000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.213293 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4463  Glutathione S-transferase domain  31.94 
 
 
220 aa  71.2  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0595447 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5332  Glutathione S-transferase domain  28.57 
 
 
212 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5156  Glutathione S-transferase domain  32 
 
 
234 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.561496  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4810  Glutathione S-transferase domain  27.18 
 
 
217 aa  70.5  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1560  glutathione S-transferase-like  27.05 
 
 
210 aa  70.9  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.25247  normal  0.599029 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2495  putative glutathione S-transferase  29.85 
 
 
204 aa  70.5  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00712937  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1393  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.95 
 
 
222 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4124  glutathione S-transferase-like  27.54 
 
 
217 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.590461  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1306  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.95 
 
 
222 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2966  Glutathione S-transferase domain protein  30.95 
 
 
222 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.183097  normal  0.112262 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>