More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0966 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_0966  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 
219 aa  435  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3077  glutathione S-transferase-like  52.8 
 
 
214 aa  218  3.9999999999999997e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.187241  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2883  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.83 
 
 
223 aa  192  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.527212  normal  0.219041 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0016  glutathione S-transferase-like protein  46.51 
 
 
224 aa  191  6e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0486825 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2824  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.86 
 
 
216 aa  182  3e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.480753  normal  0.31564 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5781  Glutathione S-transferase domain protein  44.71 
 
 
217 aa  176  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0926  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.13 
 
 
217 aa  175  4e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.017472  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0079  glutathione S-transferase-like  44.23 
 
 
221 aa  173  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0789  Glutathione S-transferase domain  44.08 
 
 
216 aa  172  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.100128 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3950  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.92 
 
 
227 aa  168  7e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.532798  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0033  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.07 
 
 
216 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4891  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.65 
 
 
216 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.479159 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1077  Glutathione S-transferase domain protein  41.23 
 
 
216 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.147439  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3111  putative glutathione S-transferase  44.8 
 
 
232 aa  161  7e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0175451  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3840  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.34 
 
 
232 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00883028  normal  0.988624 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1469  glutathione S-transferase-like  42.65 
 
 
217 aa  159  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.368467  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2330  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.6 
 
 
210 aa  158  7e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.639612  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1043  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.33 
 
 
212 aa  151  5.9999999999999996e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.562576  normal  0.573525 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8292  Glutathione S-transferase domain protein  41.59 
 
 
213 aa  149  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3560  Glutathione S-transferase domain  40.1 
 
 
213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.945145  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1407  Glutathione S-transferase domain protein  42.45 
 
 
212 aa  143  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0606838  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5257  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.72 
 
 
220 aa  143  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.619423 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2579  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.38 
 
 
217 aa  135  6.0000000000000005e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.983145  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2245  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.85 
 
 
207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.597175 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5855  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.09 
 
 
213 aa  122  6e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0468  Glutathione S-transferase domain  34.63 
 
 
236 aa  98.2  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.489326  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0513  Glutathione S-transferase domain protein  35.12 
 
 
236 aa  95.9  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0574717 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5865  glutathione S-transferase-like protein  39.69 
 
 
166 aa  95.9  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1633  Glutathione S-transferase domain protein  32.85 
 
 
209 aa  88.6  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0604815 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1529  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.16 
 
 
235 aa  88.6  7e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.623828  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2389  Glutathione S-transferase domain protein  33.85 
 
 
183 aa  88.6  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00663  Glutathione S-transferase  30.05 
 
 
219 aa  86.7  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1256  glutathione S-transferase  36.13 
 
 
184 aa  85.5  6e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.522192  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0486  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.37 
 
 
211 aa  85.1  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.302672  normal  0.434346 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0240  glutathione S-transferase domain protein  32.99 
 
 
232 aa  84.7  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0234  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.22 
 
 
234 aa  84.3  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.697932  normal  0.439898 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1147  Glutathione S-transferase domain  33.67 
 
 
235 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0097  glutathione S-transferase-like  33.5 
 
 
234 aa  83.6  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.472902  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1349  Glutathione S-transferase domain protein  31.02 
 
 
236 aa  84  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43530  hypothetical protein  32.45 
 
 
220 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3650  hypothetical protein  33.68 
 
 
220 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.328113  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1580  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.17 
 
 
234 aa  82.8  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.758866  normal  0.296422 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3640  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.1 
 
 
217 aa  82.8  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.390438 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2427  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.35 
 
 
219 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.340237  normal  0.0428234 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1087  glutathione S-transferase family protein  31.58 
 
 
222 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.983271 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3798  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.69 
 
 
236 aa  82  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.59415  normal  0.718162 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3677  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.69 
 
 
231 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.145175  hitchhiker  0.00000417514 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3378  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.18 
 
 
231 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0769  glutathione S-transferase  34.85 
 
 
219 aa  81.6  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608104  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3752  glutathione S-transferase-like protein  30 
 
 
235 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0129793  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2222  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.54 
 
 
207 aa  81.3  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.186295 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1375  glutathione S-transferase-like  32.81 
 
 
234 aa  81.3  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3983  glutathione S-transferase-like  32.78 
 
 
219 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.409574  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5791  glutathione S-transferase  31.22 
 
 
236 aa  80.9  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3976  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.83 
 
 
232 aa  79  0.00000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.84686 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2021  putative GST-related protein  29.19 
 
 
230 aa  78.6  0.00000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.398836  normal  0.122618 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0090  glutathione S-transferase  32.99 
 
 
234 aa  78.2  0.00000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.162685  normal  0.0936415 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3435  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.01 
 
 
222 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.288694  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2390  glutathione S-transferase, putative  32.65 
 
 
362 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.223257  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3706  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.22 
 
 
210 aa  77.8  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3350  putative glutathione S-transferase  32.14 
 
 
235 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3623  Glutathione S-transferase domain  29.85 
 
 
211 aa  77.8  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3750  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 
234 aa  77.8  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.5505  normal  0.556027 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2303  Glutathione S-transferase domain protein  27.75 
 
 
234 aa  77.8  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0188012  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0406  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.5 
 
 
235 aa  77.8  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.157624  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1820  glutathione S-transferase-like protein  31.25 
 
 
201 aa  78.2  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.631165 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4836  glutathione S-transferase-like protein  31.63 
 
 
234 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.33242  hitchhiker  0.00725172 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001312  glutathione S-transferase  30.21 
 
 
205 aa  77  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2264  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.8 
 
 
238 aa  76.6  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.344237 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1701  Glutathione S-transferase domain protein  29.81 
 
 
233 aa  76.3  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0528  putative glutathione S-transferase  28.04 
 
 
222 aa  76.3  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2655  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.5 
 
 
235 aa  75.5  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185355  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1576  glutathione S-transferase family protein  28.42 
 
 
222 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1001  glutathione S-transferase  28.23 
 
 
230 aa  75.5  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2557  glutathione S-transferase-like protein  30.85 
 
 
205 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.630075 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2178  Glutathione S-transferase domain  28.71 
 
 
230 aa  75.5  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0564194 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0042  glutathione S-transferase-like  33.5 
 
 
196 aa  75.5  0.0000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.422861 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1170  glutathione S-transferase  29.88 
 
 
217 aa  75.1  0.0000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.859877  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2509  glutathione S-transferase-like protein  30.77 
 
 
208 aa  75.1  0.0000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.640237  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1855  Glutathione S-transferase domain protein  29.19 
 
 
230 aa  75.1  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.619929  normal  0.146027 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05780  Glutathione S-transferase-like protein  32.28 
 
 
229 aa  75.1  0.0000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.713113  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3954  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.73 
 
 
205 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.251267 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4104  glutathione S-transferase family protein  32.65 
 
 
231 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.606268  normal  0.101573 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4110  Glutathione S-transferase domain protein  31.77 
 
 
186 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2866  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.8 
 
 
222 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0201506 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1306  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.89 
 
 
222 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1760  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.65 
 
 
231 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0130582 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3527  Glutathione S-transferase domain protein  36.41 
 
 
201 aa  74.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.11732  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3984  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.13 
 
 
255 aa  74.3  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.31338 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3320  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.37 
 
 
209 aa  74.3  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000262213  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1203  glutathione S-transferase-like  31.47 
 
 
234 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0359  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.39 
 
 
201 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00589351  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2696  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.8 
 
 
222 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036581 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2764  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.8 
 
 
222 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4150  glutathione S-transferase domain protein  31.77 
 
 
186 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.432751 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1682  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.47 
 
 
234 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0794  Glutathione S-transferase domain  30.1 
 
 
221 aa  73.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.730011  normal  0.341274 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1393  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.8 
 
 
222 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6295  glutathione S-transferase-like protein  30.1 
 
 
204 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14476  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1954  putative GST-related protein  28.25 
 
 
255 aa  73.6  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.331571 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>