More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1170 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1170  glutathione S-transferase  100 
 
 		 217 aa  442  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.859877  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0769  glutathione S-transferase  55.76 
 
 		 219 aa  257  1e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608104  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2427  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.38 
 
 		 219 aa  253  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.340237  normal  0.0428234 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0907  Glutathione S-transferase domain protein  51.83 
 
 		 221 aa  240  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0411393  normal  0.132395 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0573  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.53 
 
 		 219 aa  238  6.999999999999999e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.210533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0794  Glutathione S-transferase domain  48.39 
 
 		 221 aa  230  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.730011  normal  0.341274 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1834  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.84 
 
 		 219 aa  229  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3641  Glutathione S-transferase domain protein  50.46 
 
 		 218 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2015  glutathione S-transferase-like  37.17 
 
 		 221 aa  137  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4356  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.26 
 
 		 205 aa  111  8.000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0014  glutathione S-transferase-like protein  35.21 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.198681  normal  0.0539534 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2005  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.96 
 
 		 202 aa  104  8e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3706  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.04 
 
 		 210 aa  104  9e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5110  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.81 
 
 		 205 aa  101  7e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0347901 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1256  glutathione S-transferase  32.41 
 
 		 184 aa  100  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.522192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4110  Glutathione S-transferase domain protein  32.42 
 
 		 186 aa  97.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4150  glutathione S-transferase domain protein  32.42 
 
 		 186 aa  97.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.432751 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5855  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.41 
 
 		 213 aa  93.6  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5300  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.23 
 
 		 205 aa  90.9  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.217524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3478  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.75 
 
 		 205 aa  90.9  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.556825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3181  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.43 
 
 		 207 aa  90.1  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3380  glutathione S-transferase-like protein  31.92 
 
 		 201 aa  89.4  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5803  Glutathione S-transferase domain protein  32.86 
 
 		 181 aa  89  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3527  Glutathione S-transferase domain protein  31.92 
 
 		 201 aa  88.6  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.11732  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3463  glutathione S-transferase domain protein  32.39 
 
 		 201 aa  88.6  6e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0942071  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3573  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.91 
 
 		 214 aa  87.8  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.242235  normal  0.0117224 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2439  glutathione S-transferase-like protein  34.32 
 
 		 214 aa  87.4  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.414826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3077  glutathione S-transferase-like  34.67 
 
 		 214 aa  87.8  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.187241  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2557  glutathione S-transferase-like protein  30.92 
 
 		 205 aa  87  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.630075 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3670  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.32 
 
 		 214 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5417  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.91 
 
 		 214 aa  87  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4693  glutathione S-transferase-like  34.32 
 
 		 214 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3851  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.13 
 
 		 214 aa  86.3  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.216591  normal  0.461755 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0407  glutathione S-transferase  33.73 
 
 		 217 aa  86.7  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5040  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.91 
 
 		 221 aa  85.9  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.367084 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2670  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.08 
 
 		 200 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.237361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2002  glutathione S-transferase-like protein  30.84 
 
 		 185 aa  84.7  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1267  glutathione S-transferase  33.95 
 
 		 214 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261228  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0107  glutathione S-transferase  33.95 
 
 		 214 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1071  glutathione S-transferase  33.95 
 
 		 214 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.292672  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2670  putative glutathione S-transferase  33.95 
 
 		 297 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0907  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.05 
 
 		 207 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0125  glutathione S-transferase  33.95 
 
 		 266 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2817  glutathione S-transferase  33.95 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5079  Glutathione S-transferase domain  30.59 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.242731  hitchhiker  0.00740675 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2389  Glutathione S-transferase domain protein  30.99 
 
 		 183 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0755  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.52 
 
 		 209 aa  84  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.76216  normal  0.189515 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1887  Glutathione S-transferase domain protein  33.33 
 
 		 206 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0783  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.86 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3183  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.86 
 
 		 209 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.413955  normal  0.024534 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3954  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.86 
 
 		 205 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.251267 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3433  glutathione S-transferase family protein  30.25 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000284771 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3513  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.59 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0797  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.6 
 
 		 205 aa  81.3  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1060  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.91 
 
 		 208 aa  81.3  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.927457 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3629  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.1 
 
 		 210 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.395815  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1508  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.95 
 
 		 211 aa  80.1  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3752  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.1 
 
 		 210 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0132369  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1365  glutathione S-transferase  31.02 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.290536  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6142  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.34 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5777  glutathione S-transferase-like  31.34 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.184007  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0508  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.54 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.553974 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2968  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.46 
 
 		 211 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.167267  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0805  putative glutathione S-transferase  27.95 
 
 		 216 aa  79  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.671378  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0681  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.77 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.052324  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3002  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.8 
 
 		 207 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.404999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2509  glutathione S-transferase-like protein  28.44 
 
 		 208 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.640237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00391  glutathione S-transferase  34.84 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27755  glutathione S-transferase  30.7 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.102414 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1175  glutathione S-transferase  30.09 
 
 		 208 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.275426  normal  0.372199 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0966  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.88 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3561  Glutathione S-transferase domain protein  31.1 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.134068  normal  0.24035 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3227  Glutathione S-transferase domain  31.8 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.805689 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6622  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.17 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.25172  normal  0.643167 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4686  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.82 
 
 		 205 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2967  glutathione S-transferase-like protein  28.97 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3092  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.66 
 
 		 205 aa  76.3  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.061874 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7686  glutathione S-transferase-like protein  29.49 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.474064  normal  0.495812 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2330  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.36 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.639612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5335  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.45 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.222761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43110  putative glutathione S-transferase  31.75 
 
 		 200 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000318488  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0739  glutathione S-transferase-like protein  29.63 
 
 		 214 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000125702  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4952  Glutathione S-transferase domain  31.1 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.246161 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0910  Glutathione S-transferase domain  30.25 
 
 		 203 aa  74.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2300  Glutathione S-transferase domain protein  29.44 
 
 		 205 aa  74.7  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2344  glutathione S-transferase  30.7 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.305132  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1254  glutathione S-transferase-like  32.16 
 
 		 229 aa  74.7  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0201238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4793  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.45 
 
 		 207 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.97456 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2032  glutathione S-transferase family protein  30.19 
 
 		 200 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1783  putative glutathione S-transferase  28.17 
 
 		 187 aa  73.9  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0557937  normal  0.0613847 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1946  Glutathione S-transferase domain protein  30.09 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.243361  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4489  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.71 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2245  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.29 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.597175 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1180  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.02 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.610567  normal  0.0747789 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1106  Glutathione S-transferase domain  31.87 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3617  putative glutathione S-transferase  30.23 
 
 		 200 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2631  glutathione S-transferase-like protein  27.71 
 
 		 208 aa  72.4  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1679  Glutathione S-transferase domain protein  28.7 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000555439  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0838  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.81 
 
 		 227 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0531264  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0014  glutathione S-transferase  29.72 
 
 		 207 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>