More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1679 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1679  Glutathione S-transferase domain protein  100 
 
 		 205 aa  427  1e-119  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000555439  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1946  Glutathione S-transferase domain protein  87.8 
 
 		 205 aa  389  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.243361  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2300  Glutathione S-transferase domain protein  67.32 
 
 		 205 aa  303  1.0000000000000001e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2400  Glutathione S-transferase domain protein  62.93 
 
 		 205 aa  287  8e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1623  glutathione S-transferase domain-containing protein  59.71 
 
 		 206 aa  264  5.999999999999999e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.012281 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1542  putative glutathione S-transferase  58.74 
 
 		 206 aa  261  4e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.908985 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2747  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.74 
 
 		 206 aa  261  4.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2665  putative glutathione S-transferase  58.74 
 
 		 206 aa  261  4.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0995  glutathione S-transferase family protein  58.17 
 
 		 208 aa  256  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.80831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0966  glutathione S-transferase family protein  58.17 
 
 		 208 aa  255  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1014  glutathione S-transferase family protein  57.69 
 
 		 208 aa  254  5e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0683472  normal  0.818596 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0898  glutathione S-transferase family protein  57.69 
 
 		 208 aa  254  9e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0934  glutathione S-transferase family protein  57.69 
 
 		 208 aa  253  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27755  glutathione S-transferase  54.37 
 
 		 206 aa  239  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.102414 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2344  glutathione S-transferase  54.37 
 
 		 206 aa  238  5e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.305132  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1629  glutathione S-transferase  54.59 
 
 		 207 aa  238  5e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.197221  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3856  glutathione S-transferase family protein  54.59 
 
 		 207 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2238  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.37 
 
 		 206 aa  234  5.0000000000000005e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.237736  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0951  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.85 
 
 		 206 aa  234  8e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00805  predicted glutathione S-transferase  55.29 
 
 		 208 aa  228  5e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2804  Glutathione S-transferase domain protein  55.29 
 
 		 208 aa  228  5e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2804  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.29 
 
 		 208 aa  228  5e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0864  glutathione S-transferase family protein  55.29 
 
 		 208 aa  228  5e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0908  glutathione S-transferase family protein  55.29 
 
 		 208 aa  228  5e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0990  glutathione S-transferase family protein  55.29 
 
 		 208 aa  228  5e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.472621 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00822  hypothetical protein  55.29 
 
 		 208 aa  228  5e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3821  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.69 
 
 		 207 aa  225  4e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0899  glutathione S-transferase family protein  54.81 
 
 		 208 aa  224  7e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.717795  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1894  glutathione S-transferase family protein  51.21 
 
 		 207 aa  223  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00008239 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1469  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.69 
 
 		 207 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1504  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.21 
 
 		 207 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1329  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.88 
 
 		 208 aa  221  7e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.923957  normal  0.630065 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3602  Glutathione S-transferase domain  49.51 
 
 		 206 aa  219  3e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.383025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4182  glutathione S-transferase-like protein  50.24 
 
 		 227 aa  217  7.999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.645028  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2508  glutathione S-transferase family protein  53.19 
 
 		 192 aa  208  5e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.122319  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7686  glutathione S-transferase-like protein  42.86 
 
 		 214 aa  199  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.474064  normal  0.495812 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5777  glutathione S-transferase-like  43.33 
 
 		 214 aa  197  9e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.184007  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6142  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.33 
 
 		 214 aa  197  9e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6622  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.9 
 
 		 214 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.25172  normal  0.643167 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4031  putative glutathione S-transferase  46.86 
 
 		 213 aa  191  7e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.39864  normal  0.426189 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0984  gst-related protein  43.06 
 
 		 213 aa  191  9e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.149147  normal  0.243011 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3556  Glutathione S-transferase domain protein  43 
 
 		 215 aa  188  5e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3352  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.15 
 
 		 208 aa  184  6e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148422  hitchhiker  0.0000403309 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4895  Glutathione S-transferase domain  46.63 
 
 		 208 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.123273 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0742  Glutathione S-transferase domain protein  41.51 
 
 		 213 aa  184  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0914  Glutathione S-transferase domain protein  41.04 
 
 		 213 aa  182  3e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.61613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0845  Glutathione S-transferase domain  41.04 
 
 		 213 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00564189  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1508  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.71 
 
 		 211 aa  180  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1775  glutathione S-transferase  44.71 
 
 		 208 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000137039 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4438  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.78 
 
 		 206 aa  178  4e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.969865 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4241  glutathione S-transferase-like  41.75 
 
 		 206 aa  177  5.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2784  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.1 
 
 		 220 aa  177  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0350061  hitchhiker  0.000562262 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3191  Glutathione S-transferase domain  41.26 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3730  glutathione S-transferase-like  41.75 
 
 		 205 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3002  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.78 
 
 		 207 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.404999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2514  glutathione S-transferase-like protein  41.28 
 
 		 214 aa  172  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0225019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3227  Glutathione S-transferase domain  40.29 
 
 		 207 aa  170  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.805689 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2684  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.57 
 
 		 203 aa  169  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0239  glutathione S-transferase-like protein  41.83 
 
 		 209 aa  166  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.361263  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1994  glutathione S-transferase-like  42.65 
 
 		 201 aa  162  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.418655  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1609  glutathione S-transferase-like protein  40.38 
 
 		 216 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.952522  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2536  glutathione S-transferase family protein  39.3 
 
 		 207 aa  161  6e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.869863  normal  0.0380869 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3181  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.81 
 
 		 207 aa  160  9e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.948185  normal  0.478615 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1487  glutathione S-transferase  38.81 
 
 		 212 aa  160  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2021  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.3 
 
 		 207 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1987  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.52 
 
 		 220 aa  159  4e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1699  glutathione S-transferase family protein  38.28 
 
 		 218 aa  158  5e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1887  Glutathione S-transferase domain protein  39.89 
 
 		 206 aa  158  7e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3395  putative glutathione S-transferase  39.3 
 
 		 207 aa  154  6e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.482598  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40070  putative glutathione S-transferase  39.3 
 
 		 207 aa  154  9e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.151976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2351  glutathione S-transferase  40.55 
 
 		 214 aa  152  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2053  putative glutathione S-transferase  38.21 
 
 		 213 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.70347  normal  0.153383 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1148  Glutathione S-transferase protein  36.59 
 
 		 213 aa  152  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0203  glutathione S-transferase-like protein  38.81 
 
 		 207 aa  151  7e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.645095 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2218  Glutathione S-transferase domain  36.97 
 
 		 213 aa  151  8e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4793  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.13 
 
 		 207 aa  147  9e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.97456 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2741  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.32 
 
 		 203 aa  147  9e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.492964 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5335  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.63 
 
 		 207 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.222761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2072  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.32 
 
 		 207 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165134  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0014  glutathione S-transferase  36.14 
 
 		 207 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1521  glutathione S-transferase  36.14 
 
 		 207 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0018  glutathione S-transferase  36.14 
 
 		 207 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1443  glutathione S-transferase  36.14 
 
 		 207 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0019  glutathione S-transferase family protein  36.14 
 
 		 207 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.207851  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0017  glutathione S-transferase family protein  36.14 
 
 		 207 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.934023  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1164  glutathione S-transferase  36.14 
 
 		 207 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2499  glutathione S-transferase  36.36 
 
 		 207 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.215777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4821  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.32 
 
 		 207 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.62479  normal  0.686923 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4710  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.31 
 
 		 207 aa  140  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.131353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5413  glutathione S-transferase-like  35.32 
 
 		 207 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.763921  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5448  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.32 
 
 		 207 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.504175 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0376  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.09 
 
 		 213 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.411138 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0016  glutathione S-transferase  34.98 
 
 		 207 aa  139  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4777  glutathione S-transferase family protein  35.82 
 
 		 207 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3325  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.92 
 
 		 211 aa  138  6e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0807444 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2200  putative glutathione S-transferase-like protein  35.32 
 
 		 225 aa  138  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.801388  hitchhiker  0.00721495 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2009  Glutathione S-transferase domain  35.18 
 
 		 207 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.500519  normal  0.375789 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3104  Glutathione S-transferase domain protein  35.35 
 
 		 207 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1174  Glutathione S-transferase domain protein  34.85 
 
 		 207 aa  132  5e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4025  Glutathione S-transferase domain  37.13 
 
 		 201 aa  131  7.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.853688  normal  0.245138 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>