More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0573 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_0573  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 
219 aa  451  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.210533  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0907  Glutathione S-transferase domain protein  65.14 
 
 
221 aa  297  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0411393  normal  0.132395 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0794  Glutathione S-transferase domain  64.68 
 
 
221 aa  295  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.730011  normal  0.341274 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0769  glutathione S-transferase  55.71 
 
 
219 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608104  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3641  Glutathione S-transferase domain protein  56.82 
 
 
218 aa  241  7.999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2427  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.79 
 
 
219 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.340237  normal  0.0428234 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1170  glutathione S-transferase  52.53 
 
 
217 aa  233  3e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.859877  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1834  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.79 
 
 
219 aa  228  5e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4356  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.35 
 
 
205 aa  124  8.000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2015  glutathione S-transferase-like  36 
 
 
221 aa  123  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0014  glutathione S-transferase-like protein  33.81 
 
 
223 aa  105  7e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.198681  normal  0.0539534 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3706  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.49 
 
 
210 aa  99.4  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2005  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.41 
 
 
202 aa  95.1  7e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6622  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.03 
 
 
214 aa  89  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.25172  normal  0.643167 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3527  Glutathione S-transferase domain protein  32.86 
 
 
201 aa  88.6  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.11732  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3463  glutathione S-transferase domain protein  33.33 
 
 
201 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0942071  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5110  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.73 
 
 
205 aa  87.4  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0347901 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3573  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.95 
 
 
214 aa  86.7  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.242235  normal  0.0117224 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0755  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.57 
 
 
209 aa  85.9  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.76216  normal  0.189515 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7686  glutathione S-transferase-like protein  30.37 
 
 
214 aa  85.5  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.474064  normal  0.495812 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3181  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.75 
 
 
207 aa  85.1  7e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0783  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.57 
 
 
209 aa  85.1  7e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5777  glutathione S-transferase-like  31.31 
 
 
214 aa  85.1  8e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.184007  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6142  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.31 
 
 
214 aa  85.1  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5417  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.76 
 
 
214 aa  84.7  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556283  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1508  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.22 
 
 
211 aa  84.3  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4748  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.39 
 
 
222 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3478  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.4 
 
 
205 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.556825  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3629  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.98 
 
 
210 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.395815  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2557  glutathione S-transferase-like protein  31.1 
 
 
205 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.630075 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3752  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.98 
 
 
210 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0132369  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3077  glutathione S-transferase-like  32.69 
 
 
214 aa  83.6  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.187241  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3380  glutathione S-transferase-like protein  30.99 
 
 
201 aa  83.2  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1254  glutathione S-transferase-like  33.33 
 
 
229 aa  82.8  0.000000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0201238  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3183  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.11 
 
 
209 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.413955  normal  0.024534 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4686  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.54 
 
 
205 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5300  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.4 
 
 
205 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.217524  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5040  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.1 
 
 
221 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.367084 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0995  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.43 
 
 
213 aa  82.4  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3954  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.1 
 
 
205 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.251267 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0418  glutathione S-transferase  29.17 
 
 
226 aa  82  0.000000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0882437 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4110  Glutathione S-transferase domain protein  30.56 
 
 
186 aa  82  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4150  glutathione S-transferase domain protein  30.56 
 
 
186 aa  82  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.432751 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3227  Glutathione S-transferase domain  28.97 
 
 
207 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.805689 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0277  Glutathione S-transferase domain  32.18 
 
 
222 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3561  Glutathione S-transferase domain protein  31.98 
 
 
210 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.134068  normal  0.24035 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0681  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.53 
 
 
210 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.052324  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3433  glutathione S-transferase family protein  32.1 
 
 
214 aa  80.1  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000284771 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0910  Glutathione S-transferase domain  29.95 
 
 
203 aa  79.7  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3002  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.91 
 
 
207 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.404999  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1887  Glutathione S-transferase domain protein  38.46 
 
 
206 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2968  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.36 
 
 
211 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.167267  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1985  glutathione S-transferase  28.92 
 
 
207 aa  79.3  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27755  glutathione S-transferase  31.82 
 
 
206 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.102414 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3851  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.61 
 
 
214 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.216591  normal  0.461755 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0145  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.95 
 
 
203 aa  79.3  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.397548  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4773  glutathione S-transferase-like  31.87 
 
 
206 aa  78.6  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.122319  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5855  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.84 
 
 
213 aa  78.2  0.00000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4693  glutathione S-transferase-like  30.1 
 
 
214 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3670  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.1 
 
 
214 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630105  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2439  glutathione S-transferase-like protein  29.17 
 
 
214 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.414826  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1256  glutathione S-transferase  29.63 
 
 
184 aa  78.2  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.522192  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3513  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.67 
 
 
207 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72335  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0021  glutathione S-transferase-like protein  25.89 
 
 
222 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4634  Glutathione transferase  28.44 
 
 
224 aa  77  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0805  putative glutathione S-transferase  28.49 
 
 
216 aa  76.3  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.671378  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1347  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.94 
 
 
205 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1057  Glutathione S-transferase domain protein  29.81 
 
 
203 aa  76.3  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0628244  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4031  putative glutathione S-transferase  34.94 
 
 
213 aa  75.9  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.39864  normal  0.426189 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2300  Glutathione S-transferase domain protein  29.91 
 
 
205 aa  75.9  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2200  Glutathione S-transferase domain  28.7 
 
 
202 aa  75.9  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2784  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.7 
 
 
220 aa  75.9  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0350061  hitchhiker  0.000562262 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1800  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.33 
 
 
232 aa  75.5  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0661  Glutathione S-transferase domain protein  33.51 
 
 
203 aa  75.5  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1365  glutathione S-transferase  26.82 
 
 
208 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.290536  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0407  glutathione S-transferase  31.74 
 
 
217 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0797  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.06 
 
 
205 aa  75.5  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4794  Glutathione S-transferase domain  29.11 
 
 
197 aa  75.1  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.915466  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3209  glutathione S-transferase-like protein  31.16 
 
 
239 aa  75.1  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0914  Glutathione S-transferase domain protein  30.49 
 
 
213 aa  75.1  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.61613  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1924  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.7 
 
 
202 aa  74.7  0.0000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.896239 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1175  glutathione S-transferase  27.73 
 
 
208 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.275426  normal  0.372199 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0845  Glutathione S-transferase domain  30.49 
 
 
213 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00564189  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3602  Glutathione S-transferase domain  28.17 
 
 
206 aa  74.3  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.383025  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0724  glutathione S-transferase-like  26.34 
 
 
222 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0984  gst-related protein  31.39 
 
 
213 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.149147  normal  0.243011 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4952  Glutathione S-transferase domain  30.72 
 
 
208 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.246161 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2712  glutathione S-transferase-like  30.34 
 
 
241 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2344  glutathione S-transferase  30.7 
 
 
206 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.305132  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2514  glutathione S-transferase-like protein  28.38 
 
 
214 aa  73.9  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0225019  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3191  Glutathione S-transferase domain  31.68 
 
 
207 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1922  Glutathione S-transferase domain protein  27.9 
 
 
232 aa  73.6  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2604  glutathione S-transferase  34.19 
 
 
227 aa  72.8  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.918843  normal  0.211055 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3226  glutathione S-transferase-like  33.52 
 
 
228 aa  72.8  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.74059  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2741  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.93 
 
 
203 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.492964 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2947  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.32 
 
 
222 aa  72.8  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.282557  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5174  glutathione S-transferase-like  33.71 
 
 
232 aa  72.8  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.437986 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4241  glutathione S-transferase-like  30.59 
 
 
206 aa  72.4  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0318  putative glutathione S-transferase III (GST-III)  26.67 
 
 
221 aa  72.4  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.894729  normal  0.561156 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1704  Glutathione S-transferase domain protein  34.91 
 
 
212 aa  72  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0690203  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>