More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2712 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2712  glutathione S-transferase-like  100 
 
 		 241 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4748  glutathione S-transferase domain-containing protein  59.19 
 
 		 222 aa  267  1e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0277  Glutathione S-transferase domain  43.81 
 
 		 222 aa  181  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5332  Glutathione S-transferase domain  35.75 
 
 		 212 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1560  glutathione S-transferase-like  32.02 
 
 		 210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.25247  normal  0.599029 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4773  glutathione S-transferase-like  33.99 
 
 		 206 aa  106  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.122319  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0805  putative glutathione S-transferase  33.68 
 
 		 216 aa  105  7e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.671378  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43110  putative glutathione S-transferase  36.84 
 
 		 200 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000318488  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5110  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.67 
 
 		 205 aa  98.2  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0347901 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0974  Glutathione S-transferase domain protein  30.5 
 
 		 209 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4673  putative glutathione S-transferase (modular protein)  33.33 
 
 		 500 aa  96.3  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3617  putative glutathione S-transferase  35.79 
 
 		 200 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0822  Glutathione S-transferase domain protein  34.67 
 
 		 206 aa  95.5  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2670  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.02 
 
 		 200 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.237361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2557  glutathione S-transferase-like protein  34.17 
 
 		 205 aa  93.2  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.630075 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5300  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.67 
 
 		 205 aa  92.4  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.217524  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1821  glutathione S-transferase family protein  34.21 
 
 		 200 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0623474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1399  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.21 
 
 		 200 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3890  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.21 
 
 		 200 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.19285 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3954  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.17 
 
 		 205 aa  90.1  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.251267 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3706  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.68 
 
 		 210 aa  89.7  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0837  glutathione S-transferase domain protein  31.19 
 
 		 211 aa  89.7  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.613396 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2139  glutathione S-transferase  30.1 
 
 		 203 aa  89.4  5e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.041384 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3478  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.67 
 
 		 205 aa  89  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.556825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1842  glutathione S-transferase  34.38 
 
 		 200 aa  88.6  8e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260742  normal  0.324274 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3511  glutathione S-transferase-like protein  32.46 
 
 		 198 aa  88.6  8e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2296  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.36 
 
 		 204 aa  87.8  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.879102 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2495  putative glutathione S-transferase  31.61 
 
 		 204 aa  87.8  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00712937  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2032  glutathione S-transferase family protein  33.68 
 
 		 200 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1429  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 		 200 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114439  normal  0.299107 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0017  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.47 
 
 		 192 aa  86.3  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3587  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.13 
 
 		 203 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0707812  hitchhiker  0.000377551 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1128  glutathione S-transferase-like  33.18 
 
 		 206 aa  85.5  7e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3827  putative glutathione S-transferase  32.46 
 
 		 208 aa  85.1  9e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0503  Glutathione S-transferase domain protein  28.23 
 
 		 208 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0544052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04080  probable glutathione S-transferase  30.89 
 
 		 199 aa  84  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3893  glutathione S-transferase-like protein  33.51 
 
 		 210 aa  83.6  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1985  glutathione S-transferase  33.33 
 
 		 207 aa  84  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2015  glutathione S-transferase-like  27.7 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0412  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.89 
 
 		 203 aa  81.6  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2587  Glutathione S-transferase domain  34.57 
 
 		 195 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.751074  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003296  glutathione transferase  29.69 
 
 		 198 aa  80.5  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2269  Glutathione S-transferase domain  34.04 
 
 		 195 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0794  Glutathione S-transferase domain  30.66 
 
 		 221 aa  80.1  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.730011  normal  0.341274 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0925  putative glutathione S-transferase  29.23 
 
 		 203 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.324873  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2738  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.22 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0113  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.83 
 
 		 211 aa  79.3  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.118782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2312  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.04 
 
 		 195 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0196665 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0196  glutathione S-transferase-like  32.29 
 
 		 204 aa  79  0.00000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0907  Glutathione S-transferase domain protein  30 
 
 		 221 aa  79  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0411393  normal  0.132395 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3211  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.31 
 
 		 198 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0014  glutathione S-transferase-like protein  31.88 
 
 		 223 aa  78.2  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.198681  normal  0.0539534 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3947  Glutathione S-transferase domain protein  31.58 
 
 		 207 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4241  glutathione S-transferase-like  26.94 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0376  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.17 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.411138 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4794  Glutathione S-transferase domain  31.25 
 
 		 197 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.915466  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1437  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.31 
 
 		 202 aa  76.3  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000241692  hitchhiker  0.000981469 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0144  glutathione S-transferase  29.19 
 
 		 230 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0573  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.34 
 
 		 219 aa  73.9  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.210533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3730  glutathione S-transferase-like  25.91 
 
 		 205 aa  74.3  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0418  glutathione S-transferase  30.85 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0882437 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1101  glutathione S-transferase-like  29.65 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4463  Glutathione S-transferase domain  30 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0595447 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0407  glutathione S-transferase  29.35 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3580  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.87 
 
 		 198 aa  72.8  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0483717 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0125  glutathione S-transferase  28 
 
 		 266 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2670  putative glutathione S-transferase  28 
 
 		 297 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3191  Glutathione S-transferase domain  27.92 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0107  glutathione S-transferase  28 
 
 		 214 aa  72  0.000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1421  glutathione S-transferase domain protein  28.95 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2817  glutathione S-transferase  28 
 
 		 300 aa  72  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2741  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.31 
 
 		 203 aa  72  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.492964 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1267  glutathione S-transferase  28 
 
 		 214 aa  72  0.000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261228  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2514  glutathione S-transferase-like protein  28.08 
 
 		 214 aa  72  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0225019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0239  glutathione S-transferase-like protein  29.76 
 
 		 209 aa  72  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.361263  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1071  glutathione S-transferase  28 
 
 		 214 aa  72  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.292672  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1799  putative glutathione S-transferase (GST)  30.16 
 
 		 216 aa  72  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.602523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0529  putative glutathione S-transferase  31.68 
 
 		 203 aa  71.6  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3410  putative glutathione S-transferase  31.97 
 
 		 234 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.822464  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3434  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.34 
 
 		 210 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.398692  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2345  glutathione S-transferase, putative  31.97 
 
 		 234 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2523  putative glutathione S-transferase  31.97 
 
 		 234 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3417  glutathione S-transferase, putative  31.97 
 
 		 234 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0270497  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1237  glutathione S-transferase, putative  31.97 
 
 		 234 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00250185  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6467  Glutathione S-transferase domain protein  29.29 
 
 		 219 aa  71.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1119  putative glutathione S-transferase  31.97 
 
 		 234 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2869  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.18 
 
 		 213 aa  71.6  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.491062  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0742  Glutathione S-transferase domain protein  28.16 
 
 		 213 aa  71.2  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3374  putative glutathione S-transferase  31.97 
 
 		 234 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0444471  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0257  putative glutathione S-transferase  31.97 
 
 		 234 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2158  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.77 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0018  glutathione S-transferase  29.22 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4031  putative glutathione S-transferase  27 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.39864  normal  0.426189 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0014  glutathione S-transferase  29.22 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1164  glutathione S-transferase  29.22 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1521  glutathione S-transferase  29.22 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4962  Glutathione S-transferase domain protein  28.43 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0019  glutathione S-transferase family protein  29.22 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.207851  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1443  glutathione S-transferase  29.22 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1387  Glutathione S-transferase domain protein  28.42 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>