More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0021 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0021  glutathione S-transferase-like protein  100 
 
 		 222 aa  454  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0724  glutathione S-transferase-like  89.19 
 
 		 222 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0024  Glutathione S-transferase domain  87.39 
 
 		 222 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0019  glutathione S-transferase-like  79.73 
 
 		 222 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0318  putative glutathione S-transferase III (GST-III)  78.73 
 
 		 221 aa  353  1e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.894729  normal  0.561156 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4290  glutathione S-transferase domain-containing protein  71.69 
 
 		 220 aa  325  5e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.380653 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0273  putative glutathione S-transferase  64.71 
 
 		 225 aa  293  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3927  Glutathione S-transferase domain  67.43 
 
 		 218 aa  290  1e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7159  Glutathione S-transferase domain  62.9 
 
 		 225 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218915  normal  0.479865 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3634  glutathione S-transferase domain-containing protein  66.06 
 
 		 218 aa  285  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.890005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4634  Glutathione transferase  62.27 
 
 		 224 aa  280  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3917  Glutathione S-transferase domain  64.68 
 
 		 218 aa  277  1e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0306349  normal  0.123136 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3680  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.88 
 
 		 233 aa  270  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382886  normal  0.017552 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4517  glutathione S-transferase-like  61.88 
 
 		 233 aa  270  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.370294  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3847  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.88 
 
 		 233 aa  270  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.948042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2249  glutathione S-transferase-like protein  61.43 
 
 		 222 aa  270  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0626984 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3675  glutathione S-transferase-like protein  58.72 
 
 		 220 aa  266  2e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5570  glutathione S-transferase domain-containing protein  60.99 
 
 		 222 aa  263  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.509468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3744  glutathione S-transferase domain-containing protein  60.99 
 
 		 222 aa  263  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.66674  normal  0.0935446 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2947  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.2 
 
 		 222 aa  255  4e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.282557  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2329  glutathione S-transferase domain-containing protein  63.76 
 
 		 218 aa  249  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.435459 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3116  Glutathione S-transferase protein  53.54 
 
 		 227 aa  248  4e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.324582  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1107  glutathione S-transferase  56.11 
 
 		 223 aa  246  2e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.300035  normal  0.477541 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00398  glutathione S-transferase  55.31 
 
 		 232 aa  241  9e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.995047  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0261  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.01 
 
 		 221 aa  241  9e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0252994  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2125  glutathione S-transferase-like protein  54.84 
 
 		 224 aa  236  2e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.850832  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4433  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.39 
 
 		 222 aa  233  1.0000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3957  glutathione S-transferase-like  50.91 
 
 		 221 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0268  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.64 
 
 		 221 aa  218  5e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4480  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.44 
 
 		 229 aa  217  8.999999999999998e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0622605 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2196  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.55 
 
 		 208 aa  214  9.999999999999999e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.827244 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1800  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.55 
 
 		 232 aa  213  9.999999999999999e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1922  Glutathione S-transferase domain protein  49.11 
 
 		 232 aa  212  3.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1626  Glutathione S-transferase domain  51.58 
 
 		 229 aa  210  1e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.506745  normal  0.230633 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1175  glutathione S-transferase  49.55 
 
 		 208 aa  209  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.275426  normal  0.372199 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1060  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.2 
 
 		 208 aa  204  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.927457 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2668  glutathione S-transferase-like  50.9 
 
 		 226 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.111492  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1365  glutathione S-transferase  48.65 
 
 		 208 aa  203  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.290536  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4662  glutathione S-transferase, N- domain  49.55 
 
 		 222 aa  202  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4612  glutathione S-transferase, N- domain  49.55 
 
 		 222 aa  201  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0520156  normal  0.373731 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4518  glutathione S-transferase, N- domain  49.55 
 
 		 222 aa  201  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4611  glutathione S-transferase, N- domain  49.55 
 
 		 222 aa  201  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.931981  normal  0.250578 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4526  glutathione S-transferase, N- domain  49.55 
 
 		 222 aa  201  9e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2631  glutathione S-transferase-like protein  50 
 
 		 208 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00195  Glutathione S-transferase-like protein  46.15 
 
 		 222 aa  195  5.000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1722  glutathione S-transferase-like protein  47 
 
 		 208 aa  190  1e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0510  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.21 
 
 		 208 aa  190  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.585126 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2251  Glutathione transferase  49.29 
 
 		 201 aa  189  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1665  Glutathione S-transferase domain protein  46.48 
 
 		 214 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.192716  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00629  glutathione S-transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17010)  43.4 
 
 		 255 aa  185  4e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0806169  normal  0.869816 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1276  glutathione S-transferase-like  47 
 
 		 208 aa  184  6e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.398915  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3813  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.86 
 
 		 221 aa  184  6e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.340281  normal  0.596227 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1936  Glutathione S-transferase domain protein  44.19 
 
 		 214 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.247506  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0874  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.83 
 
 		 234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000650083 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1722  glutathione S-transferase-like  40.83 
 
 		 222 aa  174  8e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.226504  normal  0.784305 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3541  glutathione S-transferase  42.15 
 
 		 215 aa  172  5e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.136471  normal  0.509105 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1542  glutathione S-transferase  38.99 
 
 		 222 aa  169  3e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.172585 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0806  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.71 
 
 		 206 aa  159  4e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3593  glutathione S-transferase-like  42.86 
 
 		 221 aa  158  8e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.404871  normal  0.859314 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05193  glutathione S-transferase III  39.17 
 
 		 205 aa  154  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001312  glutathione S-transferase  38.39 
 
 		 205 aa  154  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6917  putative glutathione S-transferase  40.91 
 
 		 213 aa  153  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.522901 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1385  glutathione S-transferase-like protein  39.34 
 
 		 205 aa  153  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.742051  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0966  Glutathione S-transferase domain protein  36.19 
 
 		 209 aa  152  5e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.262392  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0265  Glutathione S-transferase domain protein  39.44 
 
 		 208 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.850678 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1353  Glutathione S-transferase domain protein  37.62 
 
 		 209 aa  150  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.959522  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0269  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.44 
 
 		 208 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0269  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.44 
 
 		 208 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0261  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.44 
 
 		 208 aa  149  4e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2474  glutathione S-transferase family protein  36.15 
 
 		 206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00158542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1093  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.94 
 
 		 209 aa  145  7.0000000000000006e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2005  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.71 
 
 		 202 aa  136  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35190  glutathione S-transferase  35.5 
 
 		 245 aa  129  4.0000000000000003e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0548873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1010  glutathione S-transferase-like  35.45 
 
 		 211 aa  115  5e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0375  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.9 
 
 		 121 aa  109  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2200  Glutathione S-transferase domain  33.33 
 
 		 202 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1924  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.86 
 
 		 202 aa  106  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.896239 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0508  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.52 
 
 		 213 aa  106  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.553974 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3640  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.48 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.390438 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2431  Glutathione S-transferase domain  31.94 
 
 		 216 aa  99  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.342495  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56049  Glutathione S-transferase  31.14 
 
 		 265 aa  96.7  3e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2200  glutathione S-transferase-like  29.77 
 
 		 216 aa  95.9  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3767  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.05 
 
 		 222 aa  95.1  7e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2573  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.68 
 
 		 221 aa  95.1  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.748409  normal  0.500264 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2222  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.84 
 
 		 207 aa  94.7  9e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.186295 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3264  glutathione S-transferase-like protein  29.77 
 
 		 216 aa  93.2  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0652587  normal  0.563491 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1148  glutathione S-transferase-like  33.93 
 
 		 219 aa  92.8  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.289477 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3310  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.96 
 
 		 210 aa  90.9  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.141117  normal  0.680332 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3205  glutathione S-transferase-like  29.11 
 
 		 219 aa  89.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.877532  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0348  glutathione S-transferase  41.23 
 
 		 124 aa  89.4  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00620  glutathione transferase, putative  28.94 
 
 		 249 aa  87.4  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.295755  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0670  putative glutathione S-transferase (GST)  28.5 
 
 		 218 aa  87  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.804169  normal  0.0458182 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4821  Glutathione S-transferase domain protein  32.87 
 
 		 221 aa  87  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236344  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3114  glutathione S-transferase-like  30.59 
 
 		 218 aa  87.4  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0995  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.02 
 
 		 213 aa  86.3  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2968  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.87 
 
 		 211 aa  85.5  5e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.167267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2967  glutathione S-transferase-like protein  29.95 
 
 		 214 aa  85.1  8e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3181  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.43 
 
 		 207 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5735  Glutathione S-transferase domain protein  28.7 
 
 		 225 aa  84  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3119  putative glutathione S-transferase  32.04 
 
 		 207 aa  83.6  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.427542  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>