More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0724 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007958  RPD_0724  glutathione S-transferase-like  100 
 
 
222 aa  454  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0021  glutathione S-transferase-like protein  89.19 
 
 
222 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0024  Glutathione S-transferase domain  87.39 
 
 
222 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0019  glutathione S-transferase-like  81.53 
 
 
222 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0318  putative glutathione S-transferase III (GST-III)  78.28 
 
 
221 aa  359  2e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.894729  normal  0.561156 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4290  glutathione S-transferase domain-containing protein  69.86 
 
 
220 aa  315  4e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.380653 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0273  putative glutathione S-transferase  69.68 
 
 
225 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7159  Glutathione S-transferase domain  67.42 
 
 
225 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218915  normal  0.479865 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3927  Glutathione S-transferase domain  65.6 
 
 
218 aa  288  6e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253948  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4634  Glutathione transferase  63.18 
 
 
224 aa  285  2.9999999999999996e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2249  glutathione S-transferase-like protein  64.13 
 
 
222 aa  285  4e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0626984 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3634  glutathione S-transferase domain-containing protein  65.14 
 
 
218 aa  285  4e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.890005  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3917  Glutathione S-transferase domain  64.68 
 
 
218 aa  285  5e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0306349  normal  0.123136 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3680  glutathione S-transferase domain-containing protein  63.68 
 
 
233 aa  284  9e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382886  normal  0.017552 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4517  glutathione S-transferase-like  63.68 
 
 
233 aa  284  9e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.370294  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3847  glutathione S-transferase domain-containing protein  63.68 
 
 
233 aa  284  9e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.948042  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5570  glutathione S-transferase domain-containing protein  63.23 
 
 
222 aa  276  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.509468  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3744  glutathione S-transferase domain-containing protein  63.23 
 
 
222 aa  276  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.66674  normal  0.0935446 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3675  glutathione S-transferase-like protein  59.17 
 
 
220 aa  270  1e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2947  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.95 
 
 
222 aa  257  1e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.282557  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0261  glutathione S-transferase domain-containing protein  62.39 
 
 
221 aa  252  3e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0252994  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3116  Glutathione S-transferase protein  53.98 
 
 
227 aa  249  3e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.324582  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2329  glutathione S-transferase domain-containing protein  62.39 
 
 
218 aa  246  3e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.435459 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1107  glutathione S-transferase  55.2 
 
 
223 aa  245  4.9999999999999997e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.300035  normal  0.477541 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00398  glutathione S-transferase  54.67 
 
 
232 aa  244  9e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.995047  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4433  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.41 
 
 
222 aa  238  5e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2125  glutathione S-transferase-like protein  53.92 
 
 
224 aa  237  1e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.850832  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3957  glutathione S-transferase-like  52.73 
 
 
221 aa  230  1e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0268  glutathione S-transferase domain-containing protein  50 
 
 
221 aa  226  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4480  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.19 
 
 
229 aa  223  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0622605 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1626  Glutathione S-transferase domain  52.94 
 
 
229 aa  219  3e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.506745  normal  0.230633 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1800  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.89 
 
 
232 aa  217  1e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1922  Glutathione S-transferase domain protein  50.45 
 
 
232 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2668  glutathione S-transferase-like  51.35 
 
 
226 aa  211  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.111492  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2196  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.85 
 
 
208 aa  207  7e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.827244 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1175  glutathione S-transferase  48.2 
 
 
208 aa  203  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.275426  normal  0.372199 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4662  glutathione S-transferase, N- domain  50.91 
 
 
222 aa  202  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4612  glutathione S-transferase, N- domain  50.91 
 
 
222 aa  202  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0520156  normal  0.373731 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4518  glutathione S-transferase, N- domain  50.91 
 
 
222 aa  202  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4611  glutathione S-transferase, N- domain  50.91 
 
 
222 aa  202  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.931981  normal  0.250578 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4526  glutathione S-transferase, N- domain  50.91 
 
 
222 aa  201  9e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1060  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.2 
 
 
208 aa  200  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.927457 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2631  glutathione S-transferase-like protein  50 
 
 
208 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00195  Glutathione S-transferase-like protein  47.51 
 
 
222 aa  199  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1365  glutathione S-transferase  47.3 
 
 
208 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.290536  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1722  glutathione S-transferase-like protein  47 
 
 
208 aa  193  1e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2251  Glutathione transferase  49.29 
 
 
201 aa  192  5e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00629  glutathione S-transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17010)  44.26 
 
 
255 aa  191  6e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0806169  normal  0.869816 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0510  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.67 
 
 
208 aa  190  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.585126 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1665  Glutathione S-transferase domain protein  48.13 
 
 
214 aa  189  4e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.192716  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0874  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.69 
 
 
234 aa  188  5e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000650083 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3813  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.4 
 
 
221 aa  187  7e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.340281  normal  0.596227 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1276  glutathione S-transferase-like  47.47 
 
 
208 aa  186  3e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.398915  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1722  glutathione S-transferase-like  42.66 
 
 
222 aa  185  5e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.226504  normal  0.784305 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1936  Glutathione S-transferase domain protein  44.19 
 
 
214 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.247506  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1542  glutathione S-transferase  40.83 
 
 
222 aa  177  2e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.172585 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3541  glutathione S-transferase  43.24 
 
 
215 aa  176  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.136471  normal  0.509105 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0966  Glutathione S-transferase domain protein  38.1 
 
 
209 aa  159  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.262392  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3593  glutathione S-transferase-like  42.86 
 
 
221 aa  158  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.404871  normal  0.859314 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0806  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.97 
 
 
206 aa  158  6e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1385  glutathione S-transferase-like protein  40.76 
 
 
205 aa  158  8e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.742051  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1353  Glutathione S-transferase domain protein  39.05 
 
 
209 aa  156  3e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.959522  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6917  putative glutathione S-transferase  41.82 
 
 
213 aa  156  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.522901 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0261  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.16 
 
 
208 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0269  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.16 
 
 
208 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0269  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.16 
 
 
208 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0265  Glutathione S-transferase domain protein  42.63 
 
 
208 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.850678 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001312  glutathione S-transferase  37.91 
 
 
205 aa  152  2.9999999999999998e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1093  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.29 
 
 
209 aa  151  7e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2474  glutathione S-transferase family protein  36.15 
 
 
206 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00158542  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05193  glutathione S-transferase III  37.09 
 
 
205 aa  145  5e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2005  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.1 
 
 
202 aa  140  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35190  glutathione S-transferase  33.91 
 
 
245 aa  129  3e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0548873  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1010  glutathione S-transferase-like  36.82 
 
 
211 aa  117  9.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0375  glutathione S-transferase domain-containing protein  63.1 
 
 
121 aa  112  5e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3640  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.72 
 
 
217 aa  107  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.390438 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0508  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.52 
 
 
213 aa  106  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.553974 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1924  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.65 
 
 
202 aa  105  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.896239 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2200  Glutathione S-transferase domain  35.19 
 
 
202 aa  105  6e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56049  Glutathione S-transferase  31.72 
 
 
265 aa  102  4e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2222  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.34 
 
 
207 aa  99.8  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.186295 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2431  Glutathione S-transferase domain  30.7 
 
 
216 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.342495  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3310  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 
210 aa  94.7  9e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.141117  normal  0.680332 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0348  glutathione S-transferase  44.74 
 
 
124 aa  94  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2200  glutathione S-transferase-like  30.23 
 
 
216 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0995  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.99 
 
 
213 aa  92.8  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3463  glutathione S-transferase domain protein  33.18 
 
 
201 aa  90.9  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0942071  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3264  glutathione S-transferase-like protein  30.23 
 
 
216 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0652587  normal  0.563491 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3767  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.31 
 
 
222 aa  91.3  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2573  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.95 
 
 
221 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.748409  normal  0.500264 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3527  Glutathione S-transferase domain protein  31.75 
 
 
201 aa  90.1  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.11732  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3380  glutathione S-transferase-like protein  31.75 
 
 
201 aa  90.1  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0847  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.87 
 
 
200 aa  87.4  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2967  glutathione S-transferase-like protein  30.43 
 
 
214 aa  87.8  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2968  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.92 
 
 
211 aa  87.8  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.167267  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1148  glutathione S-transferase-like  31.22 
 
 
219 aa  87  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.289477 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3119  putative glutathione S-transferase  32.85 
 
 
207 aa  87  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.427542  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0539  Glutathione S-transferase domain protein  30.88 
 
 
224 aa  87.4  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.333365  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0888  Glutathione S-transferase domain  29.5 
 
 
204 aa  85.1  8e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3114  glutathione S-transferase-like  30.59 
 
 
218 aa  84.7  9e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>