More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0145 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_0145  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 
203 aa  409  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.397548  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4186  glutathione S-transferase domain-containing protein  69.8 
 
 
202 aa  263  1e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.367804  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0407  glutathione S-transferase  43.65 
 
 
197 aa  159  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2600  glutathione S-transferase  47.92 
 
 
200 aa  158  6e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.465574 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2628  Glutathione S-transferase domain  48.17 
 
 
200 aa  157  8e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2020  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.88 
 
 
201 aa  156  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2823  glutathione S-transferase  46.88 
 
 
200 aa  154  7e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0457673  normal  0.108616 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1689  glutathione S-transferase-like  37.62 
 
 
213 aa  129  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4826  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.71 
 
 
211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.3512  normal  0.0149427 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3695  Glutathione S-transferase domain  40.72 
 
 
215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0434501  hitchhiker  0.00000154046 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3382  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.27 
 
 
219 aa  122  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.485104  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0607  putative glutathione S-transferase protein  39.8 
 
 
213 aa  122  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.254773 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3564  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.18 
 
 
211 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.146055  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5220  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.1 
 
 
219 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0962693  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1699  Glutathione S-transferase domain protein  41.41 
 
 
211 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2222  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.18 
 
 
207 aa  117  9e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.186295 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6685  glutathione S-transferase  36.32 
 
 
214 aa  117  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.50271  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0537  Glutathione S-transferase domain  38.16 
 
 
222 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213809  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0065  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 
213 aa  116  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.167606  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2937  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.19 
 
 
204 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0847  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.5 
 
 
200 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0524  Glutathione S-transferase domain protein  36.59 
 
 
222 aa  115  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2990  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.69 
 
 
204 aa  116  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2853  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.69 
 
 
204 aa  115  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.606213 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6295  glutathione S-transferase-like protein  36.22 
 
 
204 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14476  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2964  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.22 
 
 
204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2329  glutathione S-transferase-like  36.22 
 
 
204 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209551  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2943  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.22 
 
 
204 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1820  glutathione S-transferase-like protein  36.08 
 
 
201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.631165 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0144  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.19 
 
 
205 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.764911  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1991  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.15 
 
 
206 aa  109  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175013  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0039  glutathione S-transferase-like  37.19 
 
 
198 aa  109  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1358  Glutathione S-transferase domain  43.79 
 
 
206 aa  109  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.462445  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2508  Glutathione S-transferase domain  39.13 
 
 
214 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0031  glutathione S-transferase  36.08 
 
 
198 aa  105  5e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.243263 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2958  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.82 
 
 
211 aa  104  7e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5702  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.98 
 
 
214 aa  103  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.366134  normal  0.106893 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1911  glutathione S-transferase  34.67 
 
 
207 aa  102  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.429964  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0253  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.17 
 
 
205 aa  101  9e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.617633 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1955  Glutathione S-transferase domain  33.33 
 
 
208 aa  99  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0193951  normal  0.329521 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0897  glutathione S-transferase  32.35 
 
 
210 aa  97.1  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1365  glutathione S-transferase  33.51 
 
 
208 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.290536  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2556  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.35 
 
 
210 aa  95.5  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2778  glutathione S-transferase-like protein  34.65 
 
 
211 aa  95.5  5e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.910721 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2166  Glutathione S-transferase domain protein  33.5 
 
 
208 aa  95.1  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.193029  normal  0.0802991 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4505  Glutathione S-transferase domain  35.61 
 
 
213 aa  94.7  8e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.542768  normal  0.527562 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4394  Glutathione S-transferase domain  34.95 
 
 
213 aa  94  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.297541 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0995  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.5 
 
 
213 aa  92.8  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2005  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.88 
 
 
202 aa  92  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4025  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.47 
 
 
213 aa  91.3  8e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.519007  normal  0.381422 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1924  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.19 
 
 
202 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.896239 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3463  glutathione S-transferase domain protein  33.82 
 
 
201 aa  89.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0942071  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3380  glutathione S-transferase-like protein  32.67 
 
 
201 aa  89.4  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2090  glutathione S-transferase domain-containing protein  34 
 
 
227 aa  89.7  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.403275  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0907  Glutathione S-transferase domain protein  32.86 
 
 
221 aa  88.2  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0411393  normal  0.132395 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3527  Glutathione S-transferase domain protein  32.67 
 
 
201 aa  87.8  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.11732  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1175  glutathione S-transferase  32.66 
 
 
208 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.275426  normal  0.372199 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2200  Glutathione S-transferase domain  30.69 
 
 
202 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3541  glutathione S-transferase  32.66 
 
 
215 aa  87  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.136471  normal  0.509105 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2889  glutathione S-transferase-like  32.68 
 
 
209 aa  87  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.737778  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3181  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.6 
 
 
207 aa  85.9  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0021  glutathione S-transferase-like protein  32.86 
 
 
222 aa  84  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0794  Glutathione S-transferase domain  31.63 
 
 
221 aa  82  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.730011  normal  0.341274 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1093  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.23 
 
 
209 aa  81.6  0.000000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1722  glutathione S-transferase-like protein  30.65 
 
 
208 aa  81.3  0.000000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2668  glutathione S-transferase-like  33.66 
 
 
226 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.111492  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2249  glutathione S-transferase-like protein  30.56 
 
 
222 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0626984 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3680  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.02 
 
 
233 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382886  normal  0.017552 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0273  putative glutathione S-transferase  30.09 
 
 
225 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4517  glutathione S-transferase-like  31.02 
 
 
233 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.370294  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3847  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.02 
 
 
233 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.948042  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0024  Glutathione S-transferase domain  31.46 
 
 
222 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0724  glutathione S-transferase-like  32.42 
 
 
222 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0573  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.95 
 
 
219 aa  79.3  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.210533  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3767  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.37 
 
 
222 aa  78.2  0.00000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2631  glutathione S-transferase-like protein  33.17 
 
 
208 aa  78.2  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5977  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.32 
 
 
221 aa  78.2  0.00000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.9261 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0269  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.29 
 
 
208 aa  78.2  0.00000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3593  glutathione S-transferase-like  30.37 
 
 
221 aa  77.8  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.404871  normal  0.859314 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1385  glutathione S-transferase-like protein  28.28 
 
 
205 aa  77.8  0.00000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.742051  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3957  glutathione S-transferase-like  28.5 
 
 
221 aa  78.2  0.00000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0265  Glutathione S-transferase domain protein  32.32 
 
 
208 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.850678 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2196  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.5 
 
 
208 aa  77.8  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.827244 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2161  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.76 
 
 
199 aa  77.4  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7159  Glutathione S-transferase domain  30.09 
 
 
225 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218915  normal  0.479865 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2947  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.04 
 
 
222 aa  77  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.282557  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1060  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.05 
 
 
208 aa  75.9  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.927457 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1665  Glutathione S-transferase domain protein  31.34 
 
 
214 aa  76.3  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.192716  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0269  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.79 
 
 
208 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2968  glutathione S-transferase domain-containing protein  28 
 
 
211 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.167267  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2967  glutathione S-transferase-like protein  29.11 
 
 
214 aa  76.3  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2474  glutathione S-transferase family protein  28.23 
 
 
206 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00158542  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3641  Glutathione S-transferase domain protein  31.28 
 
 
218 aa  75.5  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0261  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.79 
 
 
208 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3264  glutathione S-transferase-like protein  30.73 
 
 
216 aa  75.1  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0652587  normal  0.563491 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1936  Glutathione S-transferase domain protein  31.34 
 
 
214 aa  75.5  0.0000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.247506  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001312  glutathione S-transferase  27.72 
 
 
205 aa  75.5  0.0000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2431  Glutathione S-transferase domain  31.19 
 
 
216 aa  75.1  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.342495  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2573  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.46 
 
 
221 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.748409  normal  0.500264 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4433  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.57 
 
 
222 aa  74.3  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>